Gene Information

Name : SAAV_2020 (SAAV_2020)
Accession : YP_003282876.1
Strain : Staphylococcus aureus ED98
Genome accession: NC_013450
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phage tail tape measure protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG3953
EC number : -
Position : 2054069 - 2060245 bp
Length : 6177 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATGAAAAAGTAGAAGGCATGACCTTGGAGCTGAAATTAGACCATTTAGGTGTCCAAGAAGGCATGAAAGGTTTAAA
GCGACAATTAGGTGTTGTTAATAGTGAAATGAAAGCTAATCTGTCAGCATTTGATAAGTCTGAAAAATCAATGGAAAAGT
ATCAGGCGAGAATTAAGGGGTTAAATGATAAGCTTAAAGTTCAAAAAAAGATGTATTCTCAAGTAGAAGATGAGCTTAAA
CAAGTTAACGCTAATTACCAAAAAGCTAAATCTAGTGTAAAAGATGTTGAGAAAGCATATTTAAAGCTAGTAGAAGCTAA
TAAAAAAGAAAAATTAGCTCTTGATAAATCTAAAGAAGCCTTAAAATCATCGAATACAGAACTTAAAAAAGCTGAAAATC
AATATAAACGTACAAATCAACGTAAACAAGATGCGTATCAAAAACTTAAACAGTTGAGAGATGCAGAACAAAAGCTTAAG
AATAGTAACCAAGCTACTACTGCACAACTAAAAAGAGCAAGTGACGCAGTACAGAAGCAGTCCGTTAAGCATAAAGAACT
TGTTGAACAATATAAACAAGAAGGCAATCAAGTTCAAAAACTAAAAGTGCAAAATGACAATCTTTCAAAATCAAATGATA
AAATTGAAAGTTCTTACGCTAAAACTAATACTAAGTTAAAGCAAACAGAAAAAGAATTTAATGATTTAAACAATACTATT
AAGAATCATAGTGCTAATGTCGCAAAAGCTGAAACAGCTGTTAATAAAGAAAAAGCTGCTTTAAATAATTTGGAGCGTTC
AATAGATAAAGCTTCATCCGAAATGAAGACTTTTAACAAAGAACAAATGATAGCTCAAAGTCATTTCGGTAAACTTGCAA
GTCAAGCGGATGTCATGTCAAAGAAATTTAGTTCTATTGGAGACAAAATGACTTCCCTGGGACGTACAATGACGATGGGC
GTATCTACACCGATTACTTTAGGGTTAGGTGCAGCATTAAAAACGAGTGCAGACTTTGAAGGGCAAATGTCTCGAGTTGG
AGCGATTGCGCAAGCAAGCAGTAAAGACTTAAAAAGCATGTCTAATCAAGCAGTTGACTTAGGAGCTAAAACAAGTAAAA
GTGCTAACGAAGTTGCTAAAGGTATGGAAGAATTGGCAGCTTTAGGCTTTAATGCCAAACAAACAATGGAGGCTATGCCG
GGTGTTATCAGTGCAGCAGAAGCAAGTGGTGCAGAAATGGCTACAACTGCAACTGTAATGGCATCAGCAATTAATTCTTT
CGGTTTAAAAGCATCTGATGCAAACCATGTTGCTGATTTACTTGCGAGATCAGCTAATGACAGTGCTGCAGATATTCAAT
ATATGGGAGATGCATTAAAATATGCAGGTACCCCAGCAAAAGCATTAGGAGTTTCAATAGAGGACACTTCTGCAGCAATT
GAAGTTTTATCTAACTCAGGTTTAGAGGGGTCTCAAGCAGGTACTGCCTTAAGAGCTTCGTTTATTAGGCTAGCTAATCC
AAGTAAAAGTACAGCTAAGGAAATGAAAAAATTAGGTATTCATTTGTCTGATGCTAAAGGTGAGTTTGTTGGAATGGGCG
AATTGATTAGACAGTTCCAAGATAACATGAAAGGCATGACGAGAGAACAAAAACTAGCTACAGTGGCTACAATAGTTGGT
ACTGAAGCAGCAAGTGGATTTTTAGCCTTGATTGAAGCAGGTCCAGATAAAATTAATAGCTATAGCAAATCATTGAAGAA
CTCTAATGGTGAAAGTAAAAAAGCAGCTGATTTGATGAAAGATAACCTCAAAGGTGCTCTGGAACAATTAGGTGGCGCTT
TTGAATCGTTAGCAATTGAAGTTGGTAAAGATTTAACGCCTATGATTAGAGCAGGTGCGGAAGGATTAACAAAATTAGTT
GATGGATTTACACATCTTCCTGGTTGGGTTAGAAAGGCTTCGGTAGGCTTAGCAATATTTGGTGCATCTATTGGCCCTGC
TGTTCTTGCTGGTGGCTTATTAATACGTGCAGTTGGGAGCGCGGCTAAAGGATATGCATCATTAAATAGACGCATTGCTG
AAAATACAATACTTTCTAATACCAATTCAAAAGCAATGAAATCTTTAGGTCTTCAAACTTTATTTCTTGGTACTACTACC
GGAAAAACGTCAAAAGGCTTTAAAGGATTAGCAGGAGCTATGTTGTTTAATTTAAAGCCTATAAATGTTTTGAAAAATAC
TGCAAATCTAGCAATCTTGCCTTTTAAACTTTTAGGGAAAGGAATTGGATTAGCTTCTAAAAGTGTTTTTGCCTTTAGTG
GTGGAGCTAGAGGTTTAGGAATAGCTTTACGTTTTATAACAGGTCCTATTGGTGCAACAATAACTGCTATTACAATTGCT
TATAAAGTTTTTAAGACCGCATATGATCATGTGGAATGGTTCAGAAAAGGTATTAACGGTTTAGGAGAAACTATAAAGTT
TTTTGGTGGCAAAATCATCGGCGGTGCTGTTAGAAAGCTCGGAGAGTTTAAAAATTATCTCGGAAGTATAGGGAGAAGTT
TCAAAGAAAAATTTTCAAAAGATATGAAAGATGGCTATAAATCATTAAGTGATGATGACCTTCTGAAAGTAGGAGTCAAC
AAGTTTAAAGGATTTATGCAAACCATGGGCACAGCTTCAAAAAAAGCATCTGATACTGTAAAAGTGTTAGGGAAAGGTGT
TTCAAAAGAAACAGAAAAAGCTTTAGAAAAATACGTACACTATTCTGAAGAAAACAACAGAATCATGGAAAAAGTACGTT
TGAACTCGGGTCAAATAACAGAAGACAAAGCAAAAAAACTTTTGAAAATTGAAACGGATTTATCTAATAACCTTATAGCT
GAAATAGAAAAAAGAAATAAAAAGGAACTCGAAAAAACTCAAGAACTTATTGATAAGTATAGTGCATTCGATGAACAAGA
AAAGCAAAACATTTTAACTCGAACTAAAGAAAAAAATGATTTGCGAATTAAAAAAGAGCAAGAACTCAATCAGAAAATCA
AAGAATTGAAAGAAAAAGCTTTAAGTGATGGTCAAATTTCAGAAAATGAAAGAAAAGAAATTGAAAATCTTGAAAATCAA
AGACGTGACATCACTGTTAAAGAACTGAGTAAGACTGAAAAAGAGCAAGAGCGTATTTTAGTAAGAATGCAAAGAAACAG
AAATGCTTATTCAATAGACGAAGCGAGCAAAGCAATTAAAGAAGCAGAAAAAGCAAGAAAAGCAAGAAAAAAAGAAGTAG
ACAAGCAATATGAAGATGATGTCATTGCTATAAAAAATAATGTCAACCTTTCTAAGTCTGAAAAAGATAAATTGTTAGCT
ATTGCTGATCAAAGACATAAGGATGAAGTAAGAAAAGCAAAATCTAAAAAAGATGCTGTAGTAGACGTTGTTAAAAAGCA
AAATAAAGATATTGACAAAGAGATGGATTTATCCAGTGGCCGTGTATATAAAAATACTGAAAAGTGGTGGAATGGCCTTA
AAAGTTGGTGGTCTAACTTCAGAGAAGACCAAAAGAAGAAAAGTGATAAGTACGCTAAAGAACAAGAAGAAACAGCTCGT
AGAAACAGAGAAAATATAAAGAAATGGTTTGGAAATGCTTGGGACGGCGTAAAAACTAAAACTGGTGAAGCCTTTAGTAA
AATGGGCAGAAATGCTAATCATTTTGGCGGCGAAATGAAAAAAATGTGGAGTGGAATCAAAGGAATTCCAAGCAAATTAA
GTTCAGGTTGGAACTCAGCCAAAAGTTCTGTAGGATATCACACTAAGGCTATAGCTAATAGTACTGGTAAATGGTTTGGA
AAAGCTTGGCAATCTGTTAAGTCGACAACAGGAAGTATTTACAATCAAACTAAGCAAAAGTATTCAGATGCCTCAGATAA
AGCTTGGGCGCATTCAAAATCTATTTGGAGAGGTACATCAAAATGGTTTAGCAATGCATATAAAAGTGCAAAGGGCTGGC
TAACGGATATGGCTAATAAATCGCGCTCGAAATGGGATAATATTTCTAGTACAGCATGGTCGAATGCAAAATCCGTTTGG
AAAGGAACATCGAAATGGTTTAGTAGCTCATACAAATCTTTAAAAAGTTGGACTGGGGATATGTATTCAAGAGCCCACGA
TCGTTTTGATGCAATTTCAAGTTCGGCATGGTCTAACGCTAAATCAGTATTTAATGGTTTTAGAAAATGGCTATCAAAAA
CATATGATTGGATTAGAGATATTGGTAAAGACATGGGAAGAGCTGCGGCTGATTTAGGTAAAAATGTTGCTAATAAAGCT
ATTGGCGGTTTGAATAGCATGATTGGCGGTATTAATAAAATATCTAAAGCCATTACTGATAAAAATCTCATCAAGCCAAT
ACCTACATTGTCTACTGGTACTTTAGCAGGAAAAGGTGTAGCTACCGATAATTCTGGATCATTAACGCAACCGACATTTG
CTGTATTAAATGATAGAGGTTCTGGAAATGCCCCAGGCGGAGGTGTTCAAGAAGTAATTCATAGAGCTGATGGAACATTC
CATGCACCCCAAGGACGAGATGTGGTTGTTCCACTAGGAGTTGGAGATAGTGTAATAAATGCCAATGACACTCTAAAGTT
ACAGCGGATGGGTGTTTTACCAAAATTCCATGGTGGTACGAAAAAGAAAAAATGGATGGAACAAGTTACTGAAAATCTTG
GTAAAAAAGCAGGGGACTTCGGTTCTAAAGCTAAAAACACAGCTCATAATATCAAAAAAGGTGCAGAAGAAATGGTTGAA
GCGGCAGGCGATAAAATCAAAGATGGTGCATCTTGGTTAGGTGATAAAATCGGCGATGTATGGGATTACGTACAACATCC
AGGGAAACTAGTAAATAAAGTAATGTCAGGTTTAAATATTAATTTTGGAGGCGGAGCTAACGCTACAGTAAAAATTGCTA
AAGGCGCGTATTCATTACTCAAAAAGAAATTAGTAGACAAAGTAAAATCGTGGTTTGAAGATTTTGGTGGCGGAGGCGAT
GGGAGCTATCTATTTGACCATCCAATTTGGCAAAGGTTTGGGAGCTACACAGGTGGACTTAACTTTAATGGAGGTCGTCA
CTATGGTATCGACTTTCAAATGCCTACTGGAACGAACATTTATGCTGTTAAAGGCGGTATAGCTGATAAAGTATGGACTG
ATTACGGTGGCGGTAATTCTATACAAATTAAGACCGGTGCTAACGAATGGAATTGGTATATGCATTTATCTAAGCAATTA
GCAAGACAAGGCCAACGTATTAAAGCTGGTCAACTGATAGGGAAATCCGGTGCTACAGGTAATTTCGTTAGAGGAGCACA
CTTACATTTCCAATTGATGAGAGGTTCACATCCAGGTAATGATACAGCAGTAGATCCTATGAAATGGTTGAAGTCACTTA
AAGGTGGCGGTGGCAAGGTTGGCGGAAGCGGATACGAGAATGCAAAAAGAGCTATTCTCAGAGCACAATCAATTTTAGGT
GGACGATATAGATCTGACTATATCACTACTCAGATGTTAAGAGTAGCCAAGCGTGAAAGTAACTATCAGGCAGATGTTAT
TAACAACTGGGATTCCAACGCAAGAGCAGGTACACCGTCTAAAGGTATGTTCCAAATGATTGAACCTTCATTTAGAGCTT
TTGCTAAGCCAGGACATGGAAATATTTATAATCCTACTGATGAGGCGATTTCAGCAATGAAATACATTGTTGCTAAGTAC
GGTTGGGGAGGCTTTAAACGCGCGGGAGATTATGCCTATGCGAATGGAGGTCTTATAACTAAACATCAAATCGCTGAAGT
GGGAGAAGGAGATAAACCAGAAATGGTTATTCCATTGACAAGACGTAAAAGAGCAATGCAATTAACTGAACAGGTTATGC
GCATCATCGGTATGGATGGCAAGCAAAATAACATCACTGTAAATAATGATACTTCTACGGTTGAAAAATTGTTGAAACAA
ATTGTTATGCTAACGGATAAAGGAAATAAATTAACAGATGCATTGATTCAAACTGTTTCTTCTCAGGATAATAACTTAAG
CTCTAGTGATGCAATTAGAGATTTAGAAAAGGTATTGTCAAAACAAAGTGGACATAGAGTAAATGCAAATAATTATATGG
GAGGTTTGACTAATTAA

Protein sequence :
MNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDKLKVQKKMYSQVEDELK
QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK
NSNQATTAQLKRASDAVQKQSVKHKELVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI
KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG
VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP
GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI
EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKSTAKEMKKLGIHLSDAKGEFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG
TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV
DGFTHLPGWVRKASVGLAIFGASIGPAVLAGGLLIRAVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGTTT
GKTSKGFKGLAGAMLFNLKPINVLKNTANLAILPFKLLGKGIGLASKSVFAFSGGARGLGIALRFITGPIGATITAITIA
YKVFKTAYDHVEWFRKGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGRSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN
KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENNRIMEKVRLNSGQITEDKAKKLLKIETDLSNNLIA
EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIENLENQ
RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA
IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR
RNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSGWNSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG
KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWRGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVW
KGTSKWFSSSYKSLKSWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA
IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGSLTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF
HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKKWMEQVTENLGKKAGDFGSKAKNTAHNIKKGAEEMVE
AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD
GSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFQMPTGTNIYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL
ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMRGSHPGNDTAVDPMKWLKSLKGGGGKVGGSGYENAKRAILRAQSILG
GRYRSDYITTQMLRVAKRESNYQADVINNWDSNARAGTPSKGMFQMIEPSFRAFAKPGHGNIYNPTDEAISAMKYIVAKY
GWGGFKRAGDYAYANGGLITKHQIAEVGEGDKPEMVIPLTRRKRAMQLTEQVMRIIGMDGKQNNITVNNDTSTVEKLLKQ
IVMLTDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLSSSDAIRDLEKVLSKQSGHRVNANNYMGGLTN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAUSA300_1393 YP_494090.1 phiSLT ORF2067-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 93
MW1390 NP_646207.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 93