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Name : leuS (CDR20291_2410) Accession : YP_003218891.1 Strain : Clostridium difficile R20291 Genome accession: NC_013316 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 2823458 - 2825878 bp Length : 2421 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGCGTATATAATTTTAAAGAAGTAGAATCGAAATGGCAAAAAATTTGGAAAGATAATAATCAGTATAAAATGGATAC TGCACAAACTGAAAAACCTAATTATTACACATTAGAAATGTTCCCTTATCCATCTGGAAAAATACACATGGGACATGTTA GAAATTATTCTATAGGTGATGTTGTCGCAAGATTCAAAAAAATGGAAGGATATAATGTACTTCATCCAATGGGATGGGAT TCTTTTGGATTACCAGCTGAAAATGCAGCTATAAAACATGGAATACATCCGCATAAATGGACAATGGAAAATATAGAAGA AATGAAAGAGCAATTAAATTTATTAGGTATTAGTTATGATTGGGATAAAGAAGTTGCAACTTCAACTCCAGAATACTATA GATTTACACAAGAAATATTTTTGAAGTTTTTAGAGCATGGGCTTGCATATAAGAAAAAATCATATGTTAACTGGTGTCCT TCTTGTGAGACTGTTCTTGCAAATGAGCAAGTTGTTCAAGGAGCATGTGAGAGATGTAAAGCAACAGTATTAAAGAAAGA TTTAGAACAATGGTATTTTAAGACTACTGAATTTGCAGAAGAATTACTTAATGACTTAGATACATTAGATGGATGGCCAG AAAAAGTTAAAACAATGCAAAAAAATTGGATAGGTAAAAGTACAGGAGCAGATTTAGTTTTTGATATAGATGGAACTGAT AAATCTATGACAGTATTTACAACTAGACCAGACACAACTTATGGAGTTACTTATATGGTACTTGCTCCAGAGCATGAATT AGTTAAAGAATTGGTTGCAGGGACTGAATATGAAGCAGATGTTGAAGCTTTTGTTCAAAAAATGCATACTATGACAGAAA TAGAAAGAACAGCAGCTGATGTAGAAAAAGAAGGAATGTTTATAGGTAGATATGTTATAAATCCTTTAAATGGCAAGAAA GTTCCTCTATGGATAGCTAACTATGTATTAGTTGAGTATGGAACGGGTGCTATAATGGCAGTTCCAGCACATGATGAAAG AGATAGAGATTTTGCTGAAAAATATAATTTAGACATAATTGATGTAATAACAGAAGATAACAAAATGATAAATTCAGAAG AATTTAATGGATTAGATGCTTCAGAAGGATTTGAAGGAATAATCGATAAGTTAGAAAAAGAAGGTAGAGGAAAGAGAACA ATTAATTATAGACTTAGAGACTGGTTAGTTTCAAGACAAAGATACTGGGGTTGTCCTATACCTGTGGTTTATTGTGATGA ATGTGGAATAGTTCCAGTTAAAAAGGAAGATTTACCAGTTCTTTTACCAACAGATGTTGAATTTACTGGAAAGGGAGAAT CTCCACTTACGACTTCAAAGCAATTTATGTCAACAACTTGTCCTCACTGTGGAAAACCAGCTAGAAGGGAAGTTGATACT ATGGATACATTCGTTGATTCTTCTTGGTATTTCTTAAGATATGTGGATAGCAATAATGAAAATGAACCATTTAGTAAGGA ATTAGTTAATAGATGGCATCCAGTAGACCAATATATAGGTGGAGTAGAACATGCTATAATGCATTTGCTTTATGCAAGAT GGTTTGTAAAGGCATTTAAGAGTATGGGAATGGTAGACTTCAATGAGCCATTTAAAAACTTACTTACTCAAGGAATGGTA CTTATGGATGGTTCTAAAATGAGTAAGTCTAAAGGGAATACAGTATCTCCTATGGATATAATAGATGAGTATGGAGCAGA TACTGCAAGACTTTTCGTATTATTTGCAGCACCACCAGAAAGAGATTTAGACTGGTCAGAGCAAGGTGTTGATGGATGCT TTAGATTCTTAAATAGGGTTTATAGATTGGTTGACGAGTTAGCAGATGTGGTTAAAAAGGATGTAGAGTTTGGAGAATTA AATTCCCAAGATAAGGATATGAGATATACTATACACTCTACACTTAAAAAAGTTACTGCTGATTTAAGTGAAAAATTCGG ATTTAATACTGCTATATCAGCTCTTATGGAATTAATAAATGATATGTATAAATATAAAGAGTTAGATAATATAAACGAAG CAGTTATAAAAGAAGGTGTACAAACTATAGTAACTATAATTGCACCATTTGCCCCTCATTTAGGTGAAGAACTATGGACT ATGATAGGTAAAGAAGGAAGTGTATTTGATATAGACTGGCCTAAATATGACGAAAAAGCTTTAGTAAAAGATGAAATAGA AGTTGTTGTACAAGTTAATGGAAAAGTTAGAGGAAAATTAACTGTTAACTCAAATATATCTAAAGATGAGATGGAAAAGG TAGCTTTAGAAGATGAAAAAATAAAAGGATTAGTTGAAGGTAAAACTATAGTTAAAGTTGTAGCTGTACCTAAAAAATTA GTAAATATAGTTGTTAAATAA Protein sequence : MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWD SFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCP SCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTD KSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKK VPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRT INYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDT MDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMV LMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGEL NSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWT MIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKL VNIVVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 3e-175 | 45 |
