Name : Dtox_1457 (Dtox_1457) Accession : YP_003190947.1 Strain : Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771 Genome accession: NC_013216 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type III restriction protein res subunit Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4951 EC number : - Position : 1512880 - 1515795 bp Length : 2916 bp Strand : + Note : PFAM: type III restriction protein res subunit; DNA primase small subunit; SMART: DEAD-like helicase; KEGG: dal:Dalk_3491 type III restriction protein res subunit DNA sequence : ATGAATTTTGAAGAGTTGCTTAAAAAGTATCAAGCAGTACTTGTTGAAAACAATAATTTGAAGATAGAAATAAATAATTT AAAGGCACAACTAGGCATTGTAGAACAGCACTATGTTACAGATAAAGTTTATAAACAAAAATCAATAGCAAAAGTATTAA AACAGGAACCTGTAAATAAAGTTTTACTCTCGGGTATGAACATCTATGCTACCCCTATTGAAAAAATTAAACTATTTATG TCATTATTTAAAGGCCGAGAGGATGTTTATGCAAAAAGATGGGAGAGTAAAAAGAAGGTTAAGAACGGGTACTCACCTGT ATGTCTAAACGAATGGAAATCTGGAGTATGCAGTAAACCAAAGATAAAATGCGATCATTGTATCAAAAAGGCTTATGCTG CTTTAGATGAAAAGGTTATTGAAGAACATTTAAAAGGGAATATTGTTGTTGGAATATACCCCCTATGCCTTGATGAAACA TGTTACTTCTTAGCTATTGATTTTGATGATGAAGGCTGGCAAAAGGATATTTCTGTGCTTAGAGAAGTATGTATGGAATA TAATATTCCTGTTGCCGTTGAGCGTTCATGTTCCGGCAATGGAGCCCATGCCTGGTTTTTCTTTGAAAATAAGATATCAG CGGTTTTAGCCAGAAAATTGGGGACAGCTTTACTTACCTATTCAATGAGTAAAAGACACGAAATAACTTTTGAATCTTAT GACAGGTTTTTTCCTAGTCAGGACACCTTGCCAAAAGGCGGCTTAGGAAATTTAATTGCACTACCGCTTCAAAAGGCAGC AAGGAAGTATAATAATAGTGTTTTTATTGATGAAAATCTTGAACCCTATGCTGACCAATGGGGATTTTTAGCTGCAATTA AAAAACTTTCTGAATATGATATTGAAATGCTTATTTCAAAACTTTATCATGGGAACGAATTAGGAGTATTGAAGAAAGAT GATGAGGACGATCAAAAGCCATGGGAAACAGCTGAAATTAAGTTAACAAAAAATGATTTTCCTGCAGATCTAAAAGTTGT AAAAGCTAATATGCTTTTCATTGAGAAATCGGGCATTTCTCAAAGGGCTTTAAATTATATAAAACGTTTGGCTGCTTTCA AAAATCCAGAGTTCTACAAAGCCCAGGCTATGCGCATGTCGACTTTTAAAAAGCCTAGGATTATCTCATGCGCTGATGAA GTTGGGAAATACTTATGCTTGCCTAGAGGATGTGAAGTTGACTTAATAGCAGTGCTTAAAGAGCTTGAGATAGCTGCCAG TTGGATAGACAATACCAATTGCGGGAGAAATATTGATGTGGAATTCAATGGTAGCCTCAGGGATGAACAGCTCTTAGCTA TCAATGAATTGCTGAAATATGATAACGGAGTACTCTCCGGGACAACAGCCTTTGGAAAAACTGTTGTGTCTATAAAGCTA ATTGCCGAAAGAAAAGTTAATACACTTATTTTGGTAGATAGAGTTAGTTTAGTTTCACAATGGAAAAATAAATTAGCCGA GTTTTTGAGTATTAATGAATTATTGCCGGAAATGAATCAGACGAAAAAACGGGGAAGAAAAAAGGCTGAAAGTTTTATCG GGCAAATTGGAGCAGGAAAGGACAGTTTAGGTGGAATTATTGACATAGCTGTAATGCAATCTTTAAATAGAATGGGTGAA GTAAAGGATTGCGTTAAAAATTATGGCATGGTCATTGTTGATGAATGTCATCATATTTCGGCATTTAGCTTTGAGAAGAT ACTAAAAAATACGAATGCAAAATATGTTTATGGGTTGACTGCAACGCCTACAAGGAAGGATGGGCACCATCCGATTATAT TTATGCAATGCGGTCCTATACGGTACAGGGATAATGCAAAGAAGCAAGCAGAAAAAAGACCATTTGAGCATTTTATCATA CCAAGATTCACGCCTTTAAGAGTGCCATTAGATAAAAATGAACGGGACGTATCGATTCAAGAGCTATATTCCGAAATTGT AGTTAATGAAATGAGGAATCAGCTAATTGTAGATGATGTAGTCAGAAGTTTTGAAAACAATAGAAACTGTATTGTCTTAA CTCAAAGAACTGCTCATGTCGAATTGCTGGCGAAGAAACTAAGCGAGAGAATTCCTAACGTGATATCTTTAACGGGCGGC ATGGGTAGAAAGCATACAAGAGAGATATTAACAAAAATAGCTGAAACTCCTACAGATAAGCAGTTAATATTGATTGCCAC TGGAAAATACATTGGGGAGGGTTTTGACGAGCCCCGTCTTGATACCTTATTTTTAGCTATGCCAATATCATGGAAAGGCA CTTTACAGCAATACGCAGGGAGGTTGCATAGATTATATGAAAACAAAAATGAGGTTCAAATATATGATTATGTGGATATC CATGTGAGGATGCTGGAGAAAATGTACCATAAAAGGCTTACGGGATATGCATCAATTGGGTATAAAGCAAAAGGGGAAAG TATTGCAGCGGATTCGATTGATATTATTTTTGATAAGAGCGACTTTTTGCCGGTATTTAGTAATGATCTAGTAAATGCGG GAAGAGAGATTTTGATAGTTAGCCCATTTGTTACGAAGAGGCGCACTTTACAAATGCTACAATACCTAGATGCTGCATTG CGAAAAAAGATCAGAGTAATCGTTGTGACTAGACCGGTTGAAGATTCTAGAAATAAGGATAAGAGTGCTTTGAAAAACGT CTTGGATTCAATGAAAAGCGCCGGTATCAGTTTAATTTTAAAATCGGACATACATCAAAAATTTGCAGTTGTGGACCAAA GAATTGTATGGTATGGAAGCATCAACCTTTTGAGCTTTGGTAGTGCTGAAGAAAGTATTATGCGGCTTGACAGTCCCAAT ATTTCCCATGGACTTTTAAGGAGACTAGAAATTTAA Protein sequence : MNFEELLKKYQAVLVENNNLKIEINNLKAQLGIVEQHYVTDKVYKQKSIAKVLKQEPVNKVLLSGMNIYATPIEKIKLFM SLFKGREDVYAKRWESKKKVKNGYSPVCLNEWKSGVCSKPKIKCDHCIKKAYAALDEKVIEEHLKGNIVVGIYPLCLDET CYFLAIDFDDEGWQKDISVLREVCMEYNIPVAVERSCSGNGAHAWFFFENKISAVLARKLGTALLTYSMSKRHEITFESY DRFFPSQDTLPKGGLGNLIALPLQKAARKYNNSVFIDENLEPYADQWGFLAAIKKLSEYDIEMLISKLYHGNELGVLKKD DEDDQKPWETAEIKLTKNDFPADLKVVKANMLFIEKSGISQRALNYIKRLAAFKNPEFYKAQAMRMSTFKKPRIISCADE VGKYLCLPRGCEVDLIAVLKELEIAASWIDNTNCGRNIDVEFNGSLRDEQLLAINELLKYDNGVLSGTTAFGKTVVSIKL IAERKVNTLILVDRVSLVSQWKNKLAEFLSINELLPEMNQTKKRGRKKAESFIGQIGAGKDSLGGIIDIAVMQSLNRMGE VKDCVKNYGMVIVDECHHISAFSFEKILKNTNAKYVYGLTATPTRKDGHHPIIFMQCGPIRYRDNAKKQAEKRPFEHFII PRFTPLRVPLDKNERDVSIQELYSEIVVNEMRNQLIVDDVVRSFENNRNCIVLTQRTAHVELLAKKLSERIPNVISLTGG MGRKHTREILTKIAETPTDKQLILIATGKYIGEGFDEPRLDTLFLAMPISWKGTLQQYAGRLHRLYENKNEVQIYDYVDI HVRMLEKMYHKRLTGYASIGYKAKGESIAADSIDIIFDKSDFLPVFSNDLVNAGREILIVSPFVTKRRTLQMLQYLDAAL RKKIRVIVVTRPVEDSRNKDKSALKNVLDSMKSAGISLILKSDIHQKFAVVDQRIVWYGSINLLSFGSAEESIMRLDSPN ISHGLLRRLEI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
Z1129 | NP_286664.1 | helicase | Not tested | TAI | Protein | 3e-163 | 46 |
Z1568 | NP_287072.1 | helicase | Not tested | TAI | Protein | 3e-163 | 46 |