|
Name : Cyan8802_3984 (Cyan8802_3984) Accession : YP_003139622.1 Strain : Cyanothece sp. PCC 8802 Genome accession: NC_013161 Putative virulence/resistance : Unknown Product : N-6 DNA methylase Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0286 EC number : - Position : 4099155 - 4101185 bp Length : 2031 bp Strand : + Note : PFAM: N-6 DNA methylase; KEGG: lpc:LPC_2790 type I restriction enzyme HindVIIP M protein DNA sequence : ATGCAAAATTTTGGCGAGAAAGTCAGCTTTATTTGGTCGGTAGCGGATTTAATTCGTGATAGTTTTAAGCGAGGGAAGTA TCAGGATGTAATTTTGCCGTTTACGGTGTTACGTCGGTTAGATTGCGTGTTAGAACCGACAAAGGAGCAGGTTTTAGAGG CTTATCATAAATATCATGGTAAATTAGAGAATCTTGACCCGATTTTGTGTAAACAGTCAGGATTTGCTTTTTATAATGCG TCTAACTATGATTTTGGTAAGTTAATTGATGACCCGAAGGATTTGGGAGCAAATTTAAAGAAATATATTAACAGTTTTAG TTCTAATATGCGGGAAGTTTTAGAAAAGTTTGACTTTCCCAATACCATTGATAAGTTAGAGGAAGCGGATTTATTATTTC AAGTGATGGAGAAGTTTAAGACAATTGATCTTCATCCTGATAAGGTTTCTAATTTGGAGATGGGGTATATTTTTGAGGAG TTAATTCGTAAGTTTAATGAAGCATTAGACGAAAATCCAGGGGAACACTTTACTCCTAGAGAAGTAATCAGATTAATGGT GAGTTTATTATTATCTCAGGATAAGGATTCTCTTAAACAAGCGCATATTACTCGAACCATTTATGACCCTTGTTGTGGTA GCGGTGGGATGTTAACCATAGCTAAAGAAAGAATTTTAGAGTTAAATCCCAATGCGACGGTATTTTTATTTGGACAAGAG GTCAACCCTGAAACCTTTGCTATTTGTAAGTCAGATTTATACATGAAAAGTGAGGACGGAAAGGACGCTGATAATATTAA GTTTGGGAGTACGTTATCCAATGACCAACATAGTGATAAAAGCTTTGATTATTTATTAGCTAATCCTCCCTATGGTAAGG ACTGGAAACGGGATAAGGATGCGGTAGAAACGGAAGCACAAAAAACAGGAAGTCGCTTTAGTGCAGGAACTCCGAGAATT AGTGATGGACAGTTATTATTTTTACAGCAAATGTTAGCACGGATGAAGTCTCCTGAGAATGGAGGAAGTCGGGTAGCTAT TGTTATGAATGGTTCACCTTTGTTTACGGGAGATGCAGGAAGCGGAGAGAGTGAGATTAGAAGATGGATATTAGAAAATG ATTGGTTAGAAGCGATTATCGCTTTACCTGAACAGTTATTTTATAATACGGGAATTTCTACCTATATTTGGATATTAAGC AATAAGAAATTACTGCAAAAAAAGGAGAAAGTTCAGTTAATTAATGGGTCTGATTTTTGGGTAGCGATGCGAAAAAGTTT AGGGGATAAGCGTCGGGAAATTAGCACAGAACATATTGAGAAAATAACCGCTATCTTTCAAGACTTTGAAGTATCAGAGG TAAGTAAGACTTTTAATAGTACAGATTTTGGGTATCGTAAAATCACGATTGAACGTCCTTTGCGCTTGAATTTTCAAGTC ATACCCGAAAGAATTGAACGGGTAAAGGAACAAACGGCGTTTATTAATTTAGCAGTGAGTAAGAAGAAAAACCCAGAAAT GAGAAAGATAGAAGAAGACGCAGGAAGAGAACAACAAAAGTTAATTTTAGGGGTTTTAAATGGTTTATCAGATGAGTTAT ACAAAGACCGTAACCCGTTTGAATTGTTATTAAAAAAGGCGTTTAAAGTAGAGAATGTGGCGGTTAAAGGGGCATTATTT AAGGCGATATTAACGGGGTTATCAGAGAAAGATGAAACCGCAGAAATTTGTCGAGATAAAGACGGAAATCCTGAACCCGA TACGGAGCTAAGAGACACAGAAAATGTGCCGTTAGATGAGGATATTTATGATTATTTTGAACGAGAAGTTAAACCCCATG TTTCTGATGCGTGGATTAATGAAACAGTGAGAGATAGTAAGGATAGTGGGGTAGGGAAAGTGGGTTATGAGATTAATTTT AATCGTTATTTTTATCAGTATCAACCCCCAAGGGAGTTATCAGAAATTGAAAAGGATATTCAACAAGTAGAGGGGGCAAT TTTAGCGATGCTGAAGGAGATGAGAGAGTGA Protein sequence : MQNFGEKVSFIWSVADLIRDSFKRGKYQDVILPFTVLRRLDCVLEPTKEQVLEAYHKYHGKLENLDPILCKQSGFAFYNA SNYDFGKLIDDPKDLGANLKKYINSFSSNMREVLEKFDFPNTIDKLEEADLLFQVMEKFKTIDLHPDKVSNLEMGYIFEE LIRKFNEALDENPGEHFTPREVIRLMVSLLLSQDKDSLKQAHITRTIYDPCCGSGGMLTIAKERILELNPNATVFLFGQE VNPETFAICKSDLYMKSEDGKDADNIKFGSTLSNDQHSDKSFDYLLANPPYGKDWKRDKDAVETEAQKTGSRFSAGTPRI SDGQLLFLQQMLARMKSPENGGSRVAIVMNGSPLFTGDAGSGESEIRRWILENDWLEAIIALPEQLFYNTGISTYIWILS NKKLLQKKEKVQLINGSDFWVAMRKSLGDKRREISTEHIEKITAIFQDFEVSEVSKTFNSTDFGYRKITIERPLRLNFQV IPERIERVKEQTAFINLAVSKKKNPEMRKIEEDAGREQQKLILGVLNGLSDELYKDRNPFELLLKKAFKVENVAVKGALF KAILTGLSEKDETAEICRDKDGNPEPDTELRDTENVPLDEDIYDYFEREVKPHVSDAWINETVRDSKDSGVGKVGYEINF NRYFYQYQPPRELSEIEKDIQQVEGAILAMLKEMRE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SAS0027 | YP_042160.1 | type I restriction enzyme methylase | Not tested | SCC476 | Protein | 4e-90 | 43 |
