Gene Information

Name : Phep_1006 (Phep_1006)
Accession : YP_003091289.1
Strain : Pedobacter heparinus DSM 2366
Genome accession: NC_013061
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1178308 - 1179669 bp
Length : 1362 bp
Strand : +
Note : PFAM: Ammonium Transporter Family; TIGRFAM: ammonium transporter

DNA sequence :
ATGGCAAAAGTTTTATTTAAACAGTGGGGCCCCTTTGCAGTTTTATTAATAATTGCAATTCTTGCTCTATTTATTCCCTT
ACTTCCTAATTTTGATGAGGGAAAATACAATGCAGCTGACGTTGCATTCGTATTGGTTGCTGCAGCATTGGTATTTTTGA
TGACTCCAGGCCTTGCTTTCTTTTACGGAGGAATGGTGCATCGTAAAAATGTGCTTTCAACTATGATCAAAAGTGTGGTT
GCTGCCGGAGTAATTACTGTATTGTGGGTGGTTGTAGGCTTTAGTCTTGCATTTGGAGATTCGATTGGTGGCTTTATTGG
TAACCCTTCTACCTATCTCTTTTTTCAGGGTGTAAATTCAGGTCCGGCATGGGGAACAATCCCACTCTCGCTTTTTGCTG
TTTTCCAGTTGATGTTCGCCATCATAACTCCGGGTTTGGTTGTAGGGGCAGTAGCAGAACGTATCCGTTTTACATCTTAC
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TAAAATGGGTGTGCTTGATTTTGCAGGTGGTACAGTTGTACACATCTCTGCAGGTATGGCAGCTTTAGCAGGCGCCCTGG
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TTACTCTGGTTCGGATGGTTCGGTTTCAACGCTGGCTCTGCGCTGGGTGCAAATGCTTTGGCTGTTTCTGCTTTCTTAAC
TACAAATATCGCTGCTGGTGCTGCTGGTTTATCCTGGATGTTCTTTGATGTTTCCAGAGGTAAAAAACCTTCGGTATTGG
GCTTCTGTATTGGTGCTGTTGTTGGTTTGGTAGCCATTACACCTGGTGCCGGCTTTGTGAGTATTCCTTCCAGTATTTTC
ATTGGTGTAATTGCTGCGGTAATCTCTAACCTGGTTGTTTCATGGAAGCAAAAAACCTCATTGGATGATACTTTGGATGT
GTTCCCTTGTCATGGTGTAGGTGGTATTGTGGGCATGTTGTTAACTGGTGTGTTCGCTACCAAAACGGTAAATCCGGCAG
GTGTGGACGGATTGCTTTATGGCAATGTTGAGTTCTTCTTTACGCAGCTTAAAGGTGCCGTTATTGTGATCATATTTAGT
TTTGTAATGTCATTCATCATCTTCAAACTGATTAACCTGGTGCAGCCAATCCGTGTTACTTCAGAAGAAGAAGAAGAAGG
TCTGGATGCCTCTCAACATAACGAAAAATATACTCAGGGCACATTGATTGTTGCCGGTCAGGAAGTCGAAAATACCTTTT
AA

Protein sequence :
MAKVLFKQWGPFAVLLIIAILALFIPLLPNFDEGKYNAADVAFVLVAAALVFLMTPGLAFFYGGMVHRKNVLSTMIKSVV
AAGVITVLWVVVGFSLAFGDSIGGFIGNPSTYLFFQGVNSGPAWGTIPLSLFAVFQLMFAIITPGLVVGAVAERIRFTSY
ILFIVMFALFVYSPLAHWTWHPEGMLFKMGVLDFAGGTVVHISAGMAALAGALVLKRRKSHLEHKEVPPANIPYVLIGTG
LLWFGWFGFNAGSALGANALAVSAFLTTNIAAGAAGLSWMFFDVSRGKKPSVLGFCIGAVVGLVAITPGAGFVSIPSSIF
IGVIAAVISNLVVSWKQKTSLDDTLDVFPCHGVGGIVGMLLTGVFATKTVNPAGVDGLLYGNVEFFFTQLKGAVIVIIFS
FVMSFIIFKLINLVQPIRVTSEEEEEGLDASQHNEKYTQGTLIVAGQEVENTF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 2e-49 46
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 2e-49 46