|
Name : PAU_03342 (PAU_03342) Accession : YP_003042172.1 Strain : Photorhabdus asymbiotica ATCC 43949 Genome accession: NC_012962 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3921027 - 3923879 bp Length : 2853 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTAATCAGGATGCACTGTTTCATAGCGTTAAAGACGATATTCACTTTGATACCTTGCTGGAACAAGCTCATCAGGT GATTGAAAAACAGGCTGAAAAACTGTGGAGTGATACGGCAGAGCATGATCCGGGTATCACATTTTTGCAGGGAATCAGTT ACGGTGTGTCAGATTTGGCTTACCGACATACATTACCCCTGAAAGATTTACTGACTCCGGCGCCGGATGAGCAGCAGCAA GAGGGAATTTTTCCTGCCGAATTTGGCCCGCATAATACACTGACTTGTGGGCCGGTGACAGCGGATGATTATCGCAAGGC ATTGTTAGATCTACACAGCAGCGACAGCCTGGATGGTACTCAGCAGGATGAGGGGGATTTTCTGTTCCGGAGTGTGCAAC TGGTGCGTGAACCGGAAAAACAGCGTTATACCTATTGGTATGATGCAACCAAGAGGGAATATAGCTTTGTCAACAGTGAA GGGGCTAAAGAGTTTACCTTGCGGGGGAATTACTGGTTGTATCTGGAACCAACCCGTTGGACTCAGGGTAATATTGCCGC TGCTACCAGACAACTGACAGAATTTTTGACTAAAAATCGCAATATTGGTGAATCTGTCAGCAACATTATCTGGCTACAAC CGGTTGATCTGCCACTGTTGCTGGATGTTGAACTGGATGATGATGTAGGTGCACAGGATGTCCCCGGTATTTTTGCGGCG GTGTATAGCACCGCAGAGCAGTATCTGATGCCTGGAGCACAGCGTTACCGTACGGAAGTACTGCAAAATGCTGGGATGAG CAATGATCAAATCTTCGAAGGTCCATTATTGGAACATGGCTGGATACCAGAGCTGCCGGCAGCCCGTGATTATACTCAAA GGCTCACTCTCAATCTTAGCCGGTTGGTAAATAGTCTGCTTGAGATTGAGGGCATTAAACATGTGAATCGTCTTCGTCTG GATGATAGCTTCGATAAAACTGCTATTGAACCCGTTAAGGGGGATACCTGGTCGTGGTCGATCAAAGAGGGCTATTATCC ACGTCTTTGGGGAGAAGACCCACTTAACCAATTGGCGCAACAAAATGGCCCGCTTAGGGTGATAGCCAAAGGAGGGATTA GCGTCAGTGTGAGTAAAGAGCAAATCCAGGCCAGTTTACCCAGTCAATCACTGATTCAAAATGAGCCGGTAATATTGGCT TACGGCCAGCACCGTGACGTTGGCAGCTATTATCCCGTCAGTGATACTTTGCCGCCTTGCTATGGACTACAACATTCTTT GTCTGAAAGTGAACACTTATTGCCACTTCATCAATTTATGTTGCCATTTGAACAATTATTGGCCTGTGGTTGTCAACAGA TAGCCATGCTCCCGCGGTTACTGGCTTTTCAGCGCGAAGGTTATGAGGTTTGGGGTGATCAGTGGCCCTTTAAGTCAGGC TCAGTGAATGATGACGCCCATCAAGATTATGCCCCTGCATTAAAGGATTTGTTAGGACAGATTGCGCTGGATAGTGATCA TGAATTGGATATTATTAATTACTTGCTGGGTTACTTTGGCACACAGCGGGCACCGCGTACCTTTACGACACAACTCGATG ATTTTCGTGCGGTCCAACAGGGTTATCTGGCCCAGCAACCGACATTGACTTACCACCGCTCCAATATTCGTATCGATCAG GTATCGTCGCTACAAAAACGTATTGCTGCTCGCATGGGGCTGGGCGGTGAGTTGTTTAAACCTCAACCGGATCTGAGCCA ACTGCCTTTTTATTTGATTGAACATCGAGCGTTGCTGCCAGTCAAACCCAATAGTCAGTTTGATAAGGAACAGAAACCAG CCTCGGTGACAGAGGAGGGGGGCAGCCAAACAGGTCAACATTATGTGGTCATTGAACAGAAGGGCATTGATGGCAAGCTG ACACAGGGGCAAGTGATCAATTTAATTCTGTATGAAGGAGAGCAGGGAGAAACCCAATTTACGATACGCGGTCAGATGGT ATTCAAAACCGAGGGGGATAAGTTTTGGTTGGATGTGAATAATAGTGCGCAACTGGAATATAATCTGGCGCGGGTAATGA CAGCAGCCAAGGCGAGTAAACTCTTTTGGCAAAACAGCCCGGTATGGATGGAGGATATGGGCTATCGTCTGGCCTATGCT AGTGACCAATCCTCATTGCCTGTGAATCAACGGCGCTTGACCCGCACAGTGCAAACTCCATTCCCGCCGATGGTTGTTGT AGGTAGCGAAATCACCCTGTTAAAGCAGGTGGGGATAGTCAATTTAAAAAAAGCGGAGTCAGAAAAACTTTATGCAAAAG TTGTTAGCTTTGATCGCATTGAAGGGACCTTGATTATTGAGCGTTTGGGTAATTCCACTCTGGCTTTTCCTACCTCGGAA GAGGCGTGGCGGTATAGTTGGTATTTTTCGGGGGAGAAATATGAAAGGACTGACCGCTTTTCATTTGTGATTAGCGTAGT AGTGAACAGTGACTTAATTAAATTGCCCGGTGTTGATCCCTATAAATTGGAAGAATGGGTGAAAGAAACGATTCTTACCG AATTTCCAGCTCATATTTCTATGATTATCCATTGGATGGATCGGGAAGCCTTTTTAAATTTCGCCAATACCTATCAGCGT TGGCAAAATAATGGTACGCCACTGGGGGATGCGGCTTATTCCATTCTAGAAAGTTTGACACTTGGTAAATTGCCATCTGC CTTAAAAGGTGTTGGCACAATGCGTATTGCCACATCTAGTCAAAGAGAAGAAGTGGTGGGTAGTAATGGTGATCAATGGA ATACAGATGGAATAACCCAGAATGAATTATTCTATGTTCCTAAAGAGAGCTAG Protein sequence : MSNQDALFHSVKDDIHFDTLLEQAHQVIEKQAEKLWSDTAEHDPGITFLQGISYGVSDLAYRHTLPLKDLLTPAPDEQQQ EGIFPAEFGPHNTLTCGPVTADDYRKALLDLHSSDSLDGTQQDEGDFLFRSVQLVREPEKQRYTYWYDATKREYSFVNSE GAKEFTLRGNYWLYLEPTRWTQGNIAAATRQLTEFLTKNRNIGESVSNIIWLQPVDLPLLLDVELDDDVGAQDVPGIFAA VYSTAEQYLMPGAQRYRTEVLQNAGMSNDQIFEGPLLEHGWIPELPAARDYTQRLTLNLSRLVNSLLEIEGIKHVNRLRL DDSFDKTAIEPVKGDTWSWSIKEGYYPRLWGEDPLNQLAQQNGPLRVIAKGGISVSVSKEQIQASLPSQSLIQNEPVILA YGQHRDVGSYYPVSDTLPPCYGLQHSLSESEHLLPLHQFMLPFEQLLACGCQQIAMLPRLLAFQREGYEVWGDQWPFKSG SVNDDAHQDYAPALKDLLGQIALDSDHELDIINYLLGYFGTQRAPRTFTTQLDDFRAVQQGYLAQQPTLTYHRSNIRIDQ VSSLQKRIAARMGLGGELFKPQPDLSQLPFYLIEHRALLPVKPNSQFDKEQKPASVTEEGGSQTGQHYVVIEQKGIDGKL TQGQVINLILYEGEQGETQFTIRGQMVFKTEGDKFWLDVNNSAQLEYNLARVMTAAKASKLFWQNSPVWMEDMGYRLAYA SDQSSLPVNQRRLTRTVQTPFPPMVVVGSEITLLKQVGIVNLKKAESEKLYAKVVSFDRIEGTLIIERLGNSTLAFPTSE EAWRYSWYFSGEKYERTDRFSFVISVVVNSDLIKLPGVDPYKLEEWVKETILTEFPAHISMIIHWMDREAFLNFANTYQR WQNNGTPLGDAAYSILESLTLGKLPSALKGVGTMRIATSSQREEVVGSNGDQWNTDGITQNELFYVPKES |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf23 | AAN64227.1 | Orf23 | Not tested | necrotizing factor locus | Protein | 0.0 | 53 |
