|
Name : PAU_02237 (PAU_02237) Accession : YP_003041073.1 Strain : Photorhabdus asymbiotica ATCC 43949 Genome accession: NC_012962 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2527920 - 2530784 bp Length : 2865 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGGCAGCATAATGAGTTATTTCCTGTAGTAAAAGACGCGATAAGCTTTGAAAACCTGCAAGCTCAGGGTGAGAAGGT TATTAGTGATCAGTCCGGTAACATATGGAGCGATAAAGATAAACATGATCCTGGTATAACATTACTAGACTCTTTAAGTT ACGGTGTTTCGGATTTAGCGTATCGGCACTCATTACCTTTAACCGATTTATTAACCATTGCTGGAAAAGATACGCTTTTT CCAGCCGAATTCGGGCCACAGCAGACGCTAACTTGTGGCCCTATAACACTGGATGATTACCGGCGTGCGTTACTTGATTT ACATGGTAATGATGCATTTAAAATATCAGCTAGTGACCCCAGAGACTTTTTGTTTCAGGATATACAGTTAATTTGTGAGC CAAAAAGTAAGCGTTATAAATACTATTTCAATCCCGAAACGCTTGAATATACATTCACGCCACCTTCAGGGGATAAATTT AAAACTTTAACACTACGAGGGAATTATTGGCTTTATTGGATACCAACCCGTTGGGCAGGTAAATCAGCTAATTTGCCGTT AGTTAAGCGGGTGATGGAAGATTTTCTCCGTGAAAATCGAAATTTGGGGGAAAATGTTGTTCAAGTGACACGGGTGATAT CAACGCCTATTTATCCTGAGCTGGTCATTGAGCTGGCGGATGATATTACAGATGCGGCATCAGTATTAGCATCAATCTAT ATGCTATTAGAACAGTGGGCGATGCCGATGCCTGCTCGCTTTACTACCGAAGCATTACAGGCCAAGGGATTAACAAACGA AGAGATCTTTGATGGGCCGTGGTTGCGTCATGGTTGGATACCTCAGTTACCGACCTCTCAAAACTACCATACAGGCATGG TTCTGAAGATGAATCATCTGATTAACCAATTGCTGGCGGTTGAAGGTATAAAGCGCGTAGTTAGCCTGACGTTGCCAGAA ACAGAATATTTGCATCAGATAAAAGATGATAATTGGTCCTGGCAATTAGATGTTGGTTATTATCCATTATTATGGGGAGC TAATCCACTAGAGGTAATTACAGAGAAAAATAACAATTATGTCAAATTGTTCGCAAAAGGTGGGGTACGATTACAACCTG ATCAGAAAAGTGTTGAGCGGTTATTATCACAGGAATCACTCATTAATAATGCTGCATCCACGTTACCGGCTGGTAAGGTG CGTGATCTCAAAGCCTATACACCTATAAGCCGCAGGTTGCCTGCCTGTTATGGTTTGCAGAATACTTTGCAAAAGTTAAA ACCTGAACAACGACACTTATATCAGTTCCTATTACCATTGGAGCAAATGCTTGCTGATGGATGTGCGCGGCTTGCATTTT TGCCACATTTGTTAGCATTTAGGGACCGAAGCGGAAATATCAGTGATACACTCTGGCCTTTCAAGAATACAGAGGACACA ATTGCCCAACAGGTTCATCAGGAATATGCCGGTACATTAAAAGCCTTTCAACAGCAGGAAATTAGCCTGTTTGATGATAA AAATAGACCGCATCATGGCAATATCAATCGGGAATTAGATATTCTTGATTATCTGCTAGGGTATTTTGGTACACAACGTG CAAAGCGTCCATTAACGCAGGATATTCATGATTTTCTGCAAACCCAGCGAGGTTATTTGGCACAGCAGCCGGAGTTGGGT TATCAGCGTGATAATATCCGTATTGATCGAGTTTCAGCTTTACAAAAACGTATAGCAGCCCGAATTGGGCTAGATGGTAC TATTTTCAAAGAATCGGTTGATTTAAGTAAGTTACCTTTTTATTTGATTGAACATCGTCAGCTTTTACCAAATTTACCCC ATCTTGACTTTCAACATGATCAAACTCCCCAATCTTTTGTGATTTCCGACAACATTGTTAAAGTGAAACAAGCGGGAATA GCAGATAAAATCGTTCGTGGACAGCTTATTGATTTTATAGATATTGAAAGCAAATTTACCGTTCGTGCCCAAATGATTGT CGCTGTAGAGGGAAATGAATTTTCTCTGGATACAAAAAATAGTATTCAACTTGAAAAGAATCTGCAGTTATTACAATCAG CGTCTGAGAAAAACAATTTACGATGGAGAAATAGCACGGCGTGGTTAGAGGATATGACGTATCGTATCAATTATACTGAC GATCAGGTTATAGACGATAAAACAAAACAATGTCGTTTACAAAGTAATACTAAATCGCCTTTTCCAGCCTTAATTGCACC AAAAAATAAGATTACGATTATTAAGCAATCTTCTCCACTCTCCAGTATTGCTGAATTTACTGATGAACCAGAATTCAAAT TAGTTGCAACGGTGACAGAGATTGATCGGATTGAAGGGATATTGACTATCGAACGGGATGACAACCAACTCCCTTTCCCG ACTAAAGAAGAGAGTAATCAATATATATGGTACATATCTGATGAAAACTATATTTCAAGTGATCGTTTCTCTTTTGTGGT GAGCGTCGTGCTGAATCGCGGTTTGGTTGAAAGGGAAGATATTGATCAATATAAGCTAGAGGAATGGATAGAGCGTGAAA CACTTGCAGAGTTTCCTGCACATATTTCGTTAATTACTCATTGGCTGGCATCTGAAAATTTCGATGATTTTGCGAAGACA TATCAACGTTGGCAAAACAATGGGGCGCAGTTAGGGGATGAATCCTACACCATTTTGGAAAAACTGACATTAGGGCATTT ACCAACAGGACTTACTGGCATTAGTAATATGTTTATTGCTACAGAAGCTCAGCGTCTAGAAGTTGTTGGCGAGAGTGGTA ATGAGTGGAATACCCAGGCAATTATTAACAACGAACTATTCTATGTTCCCTCACAGAATAGTTAA Protein sequence : MRQHNELFPVVKDAISFENLQAQGEKVISDQSGNIWSDKDKHDPGITLLDSLSYGVSDLAYRHSLPLTDLLTIAGKDTLF PAEFGPQQTLTCGPITLDDYRRALLDLHGNDAFKISASDPRDFLFQDIQLICEPKSKRYKYYFNPETLEYTFTPPSGDKF KTLTLRGNYWLYWIPTRWAGKSANLPLVKRVMEDFLRENRNLGENVVQVTRVISTPIYPELVIELADDITDAASVLASIY MLLEQWAMPMPARFTTEALQAKGLTNEEIFDGPWLRHGWIPQLPTSQNYHTGMVLKMNHLINQLLAVEGIKRVVSLTLPE TEYLHQIKDDNWSWQLDVGYYPLLWGANPLEVITEKNNNYVKLFAKGGVRLQPDQKSVERLLSQESLINNAASTLPAGKV RDLKAYTPISRRLPACYGLQNTLQKLKPEQRHLYQFLLPLEQMLADGCARLAFLPHLLAFRDRSGNISDTLWPFKNTEDT IAQQVHQEYAGTLKAFQQQEISLFDDKNRPHHGNINRELDILDYLLGYFGTQRAKRPLTQDIHDFLQTQRGYLAQQPELG YQRDNIRIDRVSALQKRIAARIGLDGTIFKESVDLSKLPFYLIEHRQLLPNLPHLDFQHDQTPQSFVISDNIVKVKQAGI ADKIVRGQLIDFIDIESKFTVRAQMIVAVEGNEFSLDTKNSIQLEKNLQLLQSASEKNNLRWRNSTAWLEDMTYRINYTD DQVIDDKTKQCRLQSNTKSPFPALIAPKNKITIIKQSSPLSSIAEFTDEPEFKLVATVTEIDRIEGILTIERDDNQLPFP TKEESNQYIWYISDENYISSDRFSFVVSVVLNRGLVEREDIDQYKLEEWIERETLAEFPAHISLITHWLASENFDDFAKT YQRWQNNGAQLGDESYTILEKLTLGHLPTGLTGISNMFIATEAQRLEVVGESGNEWNTQAIINNELFYVPSQNS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf23 | AAN64227.1 | Orf23 | Not tested | necrotizing factor locus | Protein | 0.0 | 49 |
