Name : PAU_02004 (PAU_02004) Accession : YP_003040840.1 Strain : Photorhabdus asymbiotica ATCC 43949 Genome accession: NC_012962 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2245037 - 2247988 bp Length : 2952 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAATCAGGATGCATTGTTTCCCGTCGTTAAAGACGATATTGCCTTTGATACCTTACTTACTCAGGCTAAGACGAT TATTAAGCAACAATCTGAGCAATGCTGGAGCGATATAGGGGAAAATGATCCCGGTATCACGCTATTAGAAGCCTGTTGTT ATGGTGCGTCCGATTTAGCCTATCGCCATTCACTACCACTTCGGGATCTCCTTACTCCCAGACAAGAGGAACAGACATTC GAAGATGGTATTTTTCCCAAAGAGTTTGGCCCGGAACAAGTGCTGACTTGTGGTCCCATTACTACGGAGGATTATCGCCG GGCTTTGCTGGATTTGCATAGTGACGACACGGTTAATGGTTATTTTTTATTTAATGATGTGCGACTGATATGTGAGCCTC AAGATAAACGCTATGAGTACTGGTATAGCAAAGAGGAACGTAAATATAGATTCAAAAATTCTGGAACAGATAGCAAATTA ACTCTAAGAGGAAACTATTGGCTTTATTTACTCCCAAGTCGGAAAACTGAAACCAATAAAACTCAGGCGGAGAAAATCCT GAAAGACTTCTTGCGAAATAACCGTAACTTGGGAGAATTCGTCAGTAAAATTATTTGGCTGGAACCCGTCGATTTACCAT TACAGATTGATATTCAGCTAAATGATGATGTCAAAGATATTGCTGACATATTGGCTAAAATTTATATGACAGCGGAAGAC ATGGTGATTGAAAAGCCATTACGCTATACCACTGAGGCGATGAAGGAGCAGGGTTACAGTAATGAAGAAATTTTTGATGG ACCTTATTTACATCACGGTTGGATACCTAAATTACCGCCGATTAAAAATTACGATGGCTCGATGGAGTTAAATCTAAGCC CCTTGGTTAACCGATTATTGACTATTAAAGGCGTTCAAAGTGTAACCAGGCTGGAATTAGGTGAGTATGATACTAGCATT ATTTCTCCACTATCGAACGATCATTGGTCTTGGAAAATTATTAAAGAACATTATTATCCCAGACTATGGGGTAAAGATCC GTTAGCGTTGATTGCCTCACCAAACAGCCCACTAACTATTATTGCTAAAGGTGGCGTGAAAGTTGCAGTTTCTAAAGAAG TTATAGAGAAAAAACTCATTACAGAACCATTGATTAATACACAGCCAGAATTATTAAACTGGGGAAAACATCGTAAAGTC CGGGACTACTATCCGGTGAGCAATAAATTACCCGCTTGTTATGGATTGCAGACCGATGCCAATACTCAACAACAAAAGCA ATTACATCAATTTATGCTGCCTTTTGAGCAAATATTAGCTAATGGCTGCGCTGAACTCGCTTTATTGCCAAAACTATTGG CATTTAAACAGCGAGGAAATGCGGTATATGGTGTACAATGGCCTTTTAAAACGAATACGATTAGTCAAAAAGTGCATCAG AAAATAATGCCTGACTTAATCAAGCAATTAAATGATTATTCGCAAATCGACAATAATGACGGAAGTTATTCTAAAGAATT GGAAATTCTAGATTACCTGTTAGGCTATTTTGGGACTCATCGTGCAGCCAGACCACTGATACTCAGTCGACAGGATTTTC TATCCACCCAGCGCGGTTATTTGGCTCAACAGCCAGAATTAGCCTATCAACGTAATAATATTCGTATTGATAAAGTGTCA GCATTACAAAAGCGAATTGCGGCCAGACTGGGTTTAGGGAAAAAATGTTTCAATGAAACGCCAGATTTGGCTGACCTTCC TTTTTATCTGATTGAGCATCGTCGGCTTTTACCAATAAAACCTAATGCAAAATTCGATGACGAACAGAAGCCCGAACATC TGGATGTTAAAGATATTCCCGGTTCTAAAAGTCATCATTTAATCATTACCCAAAAAGAAGATGTAGGGCAGCTATTGCAC GGGCAGATGATTGACCTGATTATCAAAGGTGATAATAAATTCAGATTGCGGGGCCAAATAATTACCGAGATTACAGGAAA ATCATTTTATCTTGACACCCGTAACAGCATTGTTTTGGAGTACAGATGGAAAGAAGTCCAGCAGGCATTTAAGGATAATA ATTTGTTCTGGTGTGATAGCCCGGTGTGGTTAGAAGATATGGATTATCAACTGGTTTATGACGATAAATCATATAAAAGT AATGAAAAAGATGAACAGTGGATTGTCTCTAATGCTCACAGTCCTTTTCCTGCAATGATCAATAAAGATGATGAAATTAC TCTGAAATGTGTCATTACACCTCATATATCATCAAGAAATACAAATACGTCGACAGGTTCAGATTCTCCATCAGATTATG AGCTAAAAGCCAAGATAGTAGACTTTGATCGTATTGATGGACGGATAAAACTCGAAAAGATAGCAGGTCAGAACAATATT TTTCCGCTAAAGGAAGAAGCATGGCGTTATCGCTGGTATTTCTCCAGTGAAAAATATGCTCATACCGATCGTTTTTCATT TGTTGTCAGCGTAGTGATTAATCGCCAGTTAATTGGAAATAATAATGTTGATCCTCATAAACTGGAATCATGGGTAAAAA CTGAAATTTTAGCTGAATTCCCGGCGCATATTTCTATGATTATTCATTGGTTATCACCGGAACGTTTTAAAAATTTTGCC AGCACTTATAAGCGTTGGCAAAATAATGGCTCCCCTTTAGGAGACGAGGCATATCATATTTTAGAAATGTTAACCTTGGG ACGTTTGCCTTCGGCATTAACTGGCACAGGAAATTTGCGAATTGCTAGCAAACAACAGGAAAATGAAGTCATCAATGCAC CTAGTGATGAATTGCGTGCTAAGATGATTGAGGCTAATCAGCTATTATATGTGCCAATAGTTAATAAGAATACGGGAATT AATGATAATGAAAAAAATACATTATCTGAACATTCTCCATCTCAGTCTGAAGATGATAAAACCAAGGATTAA Protein sequence : MNNQDALFPVVKDDIAFDTLLTQAKTIIKQQSEQCWSDIGENDPGITLLEACCYGASDLAYRHSLPLRDLLTPRQEEQTF EDGIFPKEFGPEQVLTCGPITTEDYRRALLDLHSDDTVNGYFLFNDVRLICEPQDKRYEYWYSKEERKYRFKNSGTDSKL TLRGNYWLYLLPSRKTETNKTQAEKILKDFLRNNRNLGEFVSKIIWLEPVDLPLQIDIQLNDDVKDIADILAKIYMTAED MVIEKPLRYTTEAMKEQGYSNEEIFDGPYLHHGWIPKLPPIKNYDGSMELNLSPLVNRLLTIKGVQSVTRLELGEYDTSI ISPLSNDHWSWKIIKEHYYPRLWGKDPLALIASPNSPLTIIAKGGVKVAVSKEVIEKKLITEPLINTQPELLNWGKHRKV RDYYPVSNKLPACYGLQTDANTQQQKQLHQFMLPFEQILANGCAELALLPKLLAFKQRGNAVYGVQWPFKTNTISQKVHQ KIMPDLIKQLNDYSQIDNNDGSYSKELEILDYLLGYFGTHRAARPLILSRQDFLSTQRGYLAQQPELAYQRNNIRIDKVS ALQKRIAARLGLGKKCFNETPDLADLPFYLIEHRRLLPIKPNAKFDDEQKPEHLDVKDIPGSKSHHLIITQKEDVGQLLH GQMIDLIIKGDNKFRLRGQIITEITGKSFYLDTRNSIVLEYRWKEVQQAFKDNNLFWCDSPVWLEDMDYQLVYDDKSYKS NEKDEQWIVSNAHSPFPAMINKDDEITLKCVITPHISSRNTNTSTGSDSPSDYELKAKIVDFDRIDGRIKLEKIAGQNNI FPLKEEAWRYRWYFSSEKYAHTDRFSFVVSVVINRQLIGNNNVDPHKLESWVKTEILAEFPAHISMIIHWLSPERFKNFA STYKRWQNNGSPLGDEAYHILEMLTLGRLPSALTGTGNLRIASKQQENEVINAPSDELRAKMIEANQLLYVPIVNKNTGI NDNEKNTLSEHSPSQSEDDKTKD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf23 | AAN64227.1 | Orf23 | Not tested | necrotizing factor locus | Protein | 0.0 | 71 |