Gene Information

Name : PAU_02003 (PAU_02003)
Accession : YP_003040839.1
Strain : Photorhabdus asymbiotica ATCC 43949
Genome accession: NC_012962
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2242318 - 2245044 bp
Length : 2727 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGAACAGACCGGATTAAATAATAAACTTACCGCTATCGTACCGGATACCGATTTTAAACTTGATGAAAGAAGTACATT
GGATATTTTAAATTGGCTTAAAACATATGCGGAAAAAATCCCCTTTGATCAAGAGAAAAAACAATTCTGGGACAGTTTCT
ACTTTATTCAGGAGAATAATCCTCATCAATTAGCGAGTATTTACCAAAATGCGAATAAAGCAAATGGCCTTTTACCCGCA
CATCAGGCATTTTTGCTGGCTTTTTTAAAACTATTAGAAACGACTAAAATATTATTCAATACCTTCCCGGTACGGCATCG
TAATCTTTATTACCGGGAGTTATTGGGCTTAAAACCTAGGAAGGCTCAGGCGGATCAGGTTGCGATAGGTATTACCCTGA
ATGCTGATTGTGCTGAATATCTTATTCCGAAAGGAACCCTCTTTGATGCTGGGCATGATGGGGCGGGAAATCCTTTACAG
TATGTGTCCGAATCCGATTTATTGGCAAATCAGGGGGTATTGACCGATTTGCGTTGGTATCGAAAAGAGGGTGATGGCTG
GAAATCAGCAACATCTCTGAATCTTGCAGATGGCATTAAATTACCTGCAAACGATATCCGGCTTTTTAGCCCAACGCCTA
ATGATGTCCCGATTCTTGCGGGTTATCTGATTACTTCATCTCTATTTGCTATGTCGTCAGGAAAACGCAGTATTAAAGTG
ACACTGGAGAGCAAATGGACGGGTAATGTTGATCACATTACCGCTCAGATCAGCTCGGGAGATCATTGGCTTTCACTACC
GAAACCTTCTATAACAACAGAAGTAAAAGAGAATACTAATGTTGATTGCCTTACATTTTACTTGTCAGCTAATGATGATC
CCATCACTCCTCCTGATGCCTTGGATAATATGACATTTAAGGTACCGGTATTAAAGTTAGGTGCCACTCGAGGCCCGATT
TTACCCAAGATTATAGATATCGAAGTCGGCATTAACGGTAACCATAGTGTGTACTATGCCTCTGATGGCGGTATTGAACA
AACGGATACAACTAGCTTTCCCTTTGGTCAATTGCCGTCGTTAGGTTCCGGTTTTAATTTGGTTGCTCCAGAATGGTATG
GCACTGAAAACGCAACTCTCACGATTACTCCACAATGGATTGGCTTGCCCCAACAAAATTTTTCACAGTGGTATGCAGCA
TATAATACTAAACTCGATAATAAGGCATTTAAAATTCAGGGTTATTTAATTACACCTGAAAAGAGAGAAAAGCTTAATGA
GGGACAGTCATTATTCGGTGGAGATAATGAACCACAAGGGCAAAGCCTAAAGTTTACCTTACCGACAATGGATTACCCTA
TTGCAAACAATCCAGAGCCCAATGGTTGGCCTGCATCGGTGCGTATAGAACTGGTCGAACAGGATTTTATGCACGCCCAA
TACTGGAAAGATCCCAAAGATAAGAATTTACCCTATACGCCACAAATCAGTGCGTTGCAGGTTCAATTCAGCGCTAAAGC
TAAGCCGGAGCAATTTGTTGTTTATCCTCTGACGCCTTTTGGTCGGGGCGAGGCGGCAGCGGAAACGCCAGCATTCACCC
ATGAAGCATTTTATTTGGGATTTACCGGTGTTTTACCGGGACAAACGCTATCCCTATATTGGCAATTGGAAGGTCTTAAG
GCGCTTAATTTATCTTGGTTTTATCTCAATAACAGCAACACTTGGAATCCATTGGATAAGCTAGTTCACGACCAAACCTG
TAACCTATTTGACCGGGGTACCTGGCGGGCCTTATTACCGGAGGACGCTGCAAATCAAGTTGCTCAGATGCCGACGGGAC
GGTACTGGTTGAAAGCAGAAATAACCAAGCAGATTGAACCGCGGGATTACCCTCGCATTAAGGGCCTGTTGTATAACGCC
ACCGTCGCCACTTTAGTCAATGCAGAAACCGTTGAGCAGGATCATTTTATCAATGGATTGGCCGCCGACAGTATTAAACA
ACTGGTTACTGCATCCGTTGCGATCAGTGGTGTTACCCAACCTTGGGCATCCTGGAATGGTCGCCCGCCAGAAACTGAGC
AAGCTTTTCTGAAACGGATTCCTACCCGGCTATCTCATCGTAACCGCGTGTTGAGTTGGGGGAATATGGTGACATTGCTA
AAAGATCATTTTGTTAGCTTATTTGATGTTAGACACCATTCTGGCAGTAAATTAACCACTATTCCGGCACCAGAAAAGCA
GCAATTGATAGTAATCCCGGACAACCGTTACAAAGATAACCATGATGCGCTACGCCCCAAATTGAACGCAGCTCGATTGA
AAGAAATGGTCGAATGGTTAGGTCGATTAAGTAGCCCTTGGGCAGCAATTGAAATTAACAATCCTACCTACGTTGATGTC
CTGATTAATTATCAGCTGGTATTTGTCCCAGGTATTAATCCCGACTATGGCGATTATCAACTACAGCAAGAATTGAGTCG
GCAATATATGCCGTGGGGGGAAAATCCTGTTATTGGTGTCGCAATCGGCAGTCACATTAATTATTACCAATTATTAGCCA
CAATTCAGCGCTCACCTTTGGTTGAGCGGGTCACTGGCTTAACTTTGCAAAAGGGTAGCCAGAGTGTAGGTGGTATAGGT
AAAAGTATTGAAGCTGACGATAACGAAGTACTGATTTTAGTTTGGCCTGAAAAGAATTCCGCAAACCAAGGAGTTAACAA
TGAATAA

Protein sequence :
MEQTGLNNKLTAIVPDTDFKLDERSTLDILNWLKTYAEKIPFDQEKKQFWDSFYFIQENNPHQLASIYQNANKANGLLPA
HQAFLLAFLKLLETTKILFNTFPVRHRNLYYRELLGLKPRKAQADQVAIGITLNADCAEYLIPKGTLFDAGHDGAGNPLQ
YVSESDLLANQGVLTDLRWYRKEGDGWKSATSLNLADGIKLPANDIRLFSPTPNDVPILAGYLITSSLFAMSSGKRSIKV
TLESKWTGNVDHITAQISSGDHWLSLPKPSITTEVKENTNVDCLTFYLSANDDPITPPDALDNMTFKVPVLKLGATRGPI
LPKIIDIEVGINGNHSVYYASDGGIEQTDTTSFPFGQLPSLGSGFNLVAPEWYGTENATLTITPQWIGLPQQNFSQWYAA
YNTKLDNKAFKIQGYLITPEKREKLNEGQSLFGGDNEPQGQSLKFTLPTMDYPIANNPEPNGWPASVRIELVEQDFMHAQ
YWKDPKDKNLPYTPQISALQVQFSAKAKPEQFVVYPLTPFGRGEAAAETPAFTHEAFYLGFTGVLPGQTLSLYWQLEGLK
ALNLSWFYLNNSNTWNPLDKLVHDQTCNLFDRGTWRALLPEDAANQVAQMPTGRYWLKAEITKQIEPRDYPRIKGLLYNA
TVATLVNAETVEQDHFINGLAADSIKQLVTASVAISGVTQPWASWNGRPPETEQAFLKRIPTRLSHRNRVLSWGNMVTLL
KDHFVSLFDVRHHSGSKLTTIPAPEKQQLIVIPDNRYKDNHDALRPKLNAARLKEMVEWLGRLSSPWAAIEINNPTYVDV
LINYQLVFVPGINPDYGDYQLQQELSRQYMPWGENPVIGVAIGSHINYYQLLATIQRSPLVERVTGLTLQKGSQSVGGIG
KSIEADDNEVLILVWPEKNSANQGVNNE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf22 AAN64226.1 Orf22 Not tested necrotizing factor locus Protein 0.0 69