Name : PAU_02003 (PAU_02003) Accession : YP_003040839.1 Strain : Photorhabdus asymbiotica ATCC 43949 Genome accession: NC_012962 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2242318 - 2245044 bp Length : 2727 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAACAGACCGGATTAAATAATAAACTTACCGCTATCGTACCGGATACCGATTTTAAACTTGATGAAAGAAGTACATT GGATATTTTAAATTGGCTTAAAACATATGCGGAAAAAATCCCCTTTGATCAAGAGAAAAAACAATTCTGGGACAGTTTCT ACTTTATTCAGGAGAATAATCCTCATCAATTAGCGAGTATTTACCAAAATGCGAATAAAGCAAATGGCCTTTTACCCGCA CATCAGGCATTTTTGCTGGCTTTTTTAAAACTATTAGAAACGACTAAAATATTATTCAATACCTTCCCGGTACGGCATCG TAATCTTTATTACCGGGAGTTATTGGGCTTAAAACCTAGGAAGGCTCAGGCGGATCAGGTTGCGATAGGTATTACCCTGA ATGCTGATTGTGCTGAATATCTTATTCCGAAAGGAACCCTCTTTGATGCTGGGCATGATGGGGCGGGAAATCCTTTACAG TATGTGTCCGAATCCGATTTATTGGCAAATCAGGGGGTATTGACCGATTTGCGTTGGTATCGAAAAGAGGGTGATGGCTG GAAATCAGCAACATCTCTGAATCTTGCAGATGGCATTAAATTACCTGCAAACGATATCCGGCTTTTTAGCCCAACGCCTA ATGATGTCCCGATTCTTGCGGGTTATCTGATTACTTCATCTCTATTTGCTATGTCGTCAGGAAAACGCAGTATTAAAGTG ACACTGGAGAGCAAATGGACGGGTAATGTTGATCACATTACCGCTCAGATCAGCTCGGGAGATCATTGGCTTTCACTACC GAAACCTTCTATAACAACAGAAGTAAAAGAGAATACTAATGTTGATTGCCTTACATTTTACTTGTCAGCTAATGATGATC CCATCACTCCTCCTGATGCCTTGGATAATATGACATTTAAGGTACCGGTATTAAAGTTAGGTGCCACTCGAGGCCCGATT TTACCCAAGATTATAGATATCGAAGTCGGCATTAACGGTAACCATAGTGTGTACTATGCCTCTGATGGCGGTATTGAACA AACGGATACAACTAGCTTTCCCTTTGGTCAATTGCCGTCGTTAGGTTCCGGTTTTAATTTGGTTGCTCCAGAATGGTATG GCACTGAAAACGCAACTCTCACGATTACTCCACAATGGATTGGCTTGCCCCAACAAAATTTTTCACAGTGGTATGCAGCA TATAATACTAAACTCGATAATAAGGCATTTAAAATTCAGGGTTATTTAATTACACCTGAAAAGAGAGAAAAGCTTAATGA GGGACAGTCATTATTCGGTGGAGATAATGAACCACAAGGGCAAAGCCTAAAGTTTACCTTACCGACAATGGATTACCCTA TTGCAAACAATCCAGAGCCCAATGGTTGGCCTGCATCGGTGCGTATAGAACTGGTCGAACAGGATTTTATGCACGCCCAA TACTGGAAAGATCCCAAAGATAAGAATTTACCCTATACGCCACAAATCAGTGCGTTGCAGGTTCAATTCAGCGCTAAAGC TAAGCCGGAGCAATTTGTTGTTTATCCTCTGACGCCTTTTGGTCGGGGCGAGGCGGCAGCGGAAACGCCAGCATTCACCC ATGAAGCATTTTATTTGGGATTTACCGGTGTTTTACCGGGACAAACGCTATCCCTATATTGGCAATTGGAAGGTCTTAAG GCGCTTAATTTATCTTGGTTTTATCTCAATAACAGCAACACTTGGAATCCATTGGATAAGCTAGTTCACGACCAAACCTG TAACCTATTTGACCGGGGTACCTGGCGGGCCTTATTACCGGAGGACGCTGCAAATCAAGTTGCTCAGATGCCGACGGGAC GGTACTGGTTGAAAGCAGAAATAACCAAGCAGATTGAACCGCGGGATTACCCTCGCATTAAGGGCCTGTTGTATAACGCC ACCGTCGCCACTTTAGTCAATGCAGAAACCGTTGAGCAGGATCATTTTATCAATGGATTGGCCGCCGACAGTATTAAACA ACTGGTTACTGCATCCGTTGCGATCAGTGGTGTTACCCAACCTTGGGCATCCTGGAATGGTCGCCCGCCAGAAACTGAGC AAGCTTTTCTGAAACGGATTCCTACCCGGCTATCTCATCGTAACCGCGTGTTGAGTTGGGGGAATATGGTGACATTGCTA AAAGATCATTTTGTTAGCTTATTTGATGTTAGACACCATTCTGGCAGTAAATTAACCACTATTCCGGCACCAGAAAAGCA GCAATTGATAGTAATCCCGGACAACCGTTACAAAGATAACCATGATGCGCTACGCCCCAAATTGAACGCAGCTCGATTGA AAGAAATGGTCGAATGGTTAGGTCGATTAAGTAGCCCTTGGGCAGCAATTGAAATTAACAATCCTACCTACGTTGATGTC CTGATTAATTATCAGCTGGTATTTGTCCCAGGTATTAATCCCGACTATGGCGATTATCAACTACAGCAAGAATTGAGTCG GCAATATATGCCGTGGGGGGAAAATCCTGTTATTGGTGTCGCAATCGGCAGTCACATTAATTATTACCAATTATTAGCCA CAATTCAGCGCTCACCTTTGGTTGAGCGGGTCACTGGCTTAACTTTGCAAAAGGGTAGCCAGAGTGTAGGTGGTATAGGT AAAAGTATTGAAGCTGACGATAACGAAGTACTGATTTTAGTTTGGCCTGAAAAGAATTCCGCAAACCAAGGAGTTAACAA TGAATAA Protein sequence : MEQTGLNNKLTAIVPDTDFKLDERSTLDILNWLKTYAEKIPFDQEKKQFWDSFYFIQENNPHQLASIYQNANKANGLLPA HQAFLLAFLKLLETTKILFNTFPVRHRNLYYRELLGLKPRKAQADQVAIGITLNADCAEYLIPKGTLFDAGHDGAGNPLQ YVSESDLLANQGVLTDLRWYRKEGDGWKSATSLNLADGIKLPANDIRLFSPTPNDVPILAGYLITSSLFAMSSGKRSIKV TLESKWTGNVDHITAQISSGDHWLSLPKPSITTEVKENTNVDCLTFYLSANDDPITPPDALDNMTFKVPVLKLGATRGPI LPKIIDIEVGINGNHSVYYASDGGIEQTDTTSFPFGQLPSLGSGFNLVAPEWYGTENATLTITPQWIGLPQQNFSQWYAA YNTKLDNKAFKIQGYLITPEKREKLNEGQSLFGGDNEPQGQSLKFTLPTMDYPIANNPEPNGWPASVRIELVEQDFMHAQ YWKDPKDKNLPYTPQISALQVQFSAKAKPEQFVVYPLTPFGRGEAAAETPAFTHEAFYLGFTGVLPGQTLSLYWQLEGLK ALNLSWFYLNNSNTWNPLDKLVHDQTCNLFDRGTWRALLPEDAANQVAQMPTGRYWLKAEITKQIEPRDYPRIKGLLYNA TVATLVNAETVEQDHFINGLAADSIKQLVTASVAISGVTQPWASWNGRPPETEQAFLKRIPTRLSHRNRVLSWGNMVTLL KDHFVSLFDVRHHSGSKLTTIPAPEKQQLIVIPDNRYKDNHDALRPKLNAARLKEMVEWLGRLSSPWAAIEINNPTYVDV LINYQLVFVPGINPDYGDYQLQQELSRQYMPWGENPVIGVAIGSHINYYQLLATIQRSPLVERVTGLTLQKGSQSVGGIG KSIEADDNEVLILVWPEKNSANQGVNNE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf22 | AAN64226.1 | Orf22 | Not tested | necrotizing factor locus | Protein | 0.0 | 69 |