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Name : recG (SSUBM407_0304) Accession : YP_003028076.1 Strain : Streptococcus suis BM407 Genome accession: NC_012926 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 334368 - 336386 bp Length : 2019 bp Strand : + Note : Orthologue of S. suis P17 (AM946016) SSU0314 DNA sequence : ATGAAAAGACTATGTGATGAATTATCGGTTTTGCCAGGGATTGGTCCAAAATCGGCTGAAAAATTCTTAAAAATTAGCAT TCAGAATATTAATGATTTGCTGACTTACTATCCATTTAGATATGAAGATTTTGAGAGTAAGTCTATTTATGATTTGCAGG ATGGGGAGAAGGCAGTGGTAGTTGGGGAGGTGGTATCTCCAGCTAATGTACAGTATTATGGTTACAAAAGAAATAGACTC CGTTTTTCAATGAAACAGGGTGAGGTTGTCTTAGCAGTTTCGTTTTTTAATCAGCCTTATTTAGCAGATAAGATTGTTTT GGGGCAGGATATTGCAGTTTGGGGAAAGTGGGATAAGGCTAAGGCAAGTTTGACAGGAATGAAAATTTTGGCTCAAGTAT CAGATGAGCTCCAACCTGTCTATCATGTGGCGCAAGGGATTTCGCAAGTAAATTTGGTTAAGGCTATTAAAACAGCTATT GATCAGGGATATTTGCATTTATTAGAGGAGAACTTGCCATCAGTTTTACGAGAGCGCTATCGGTTAATGAATCGCCGAGA GGCGGTTTTTGCGATGCATTTTCCTACAAATTTAGAAGAGTATAGACAAGCTTTGCGACGTATGAAGTTTGAGGAATTAT TTTATTTTCAATTACAGTTGCAAATGCTGAAAGCCAACAATCGTGATATTTTGAATGGTTTGAAGATTGCCTATGATGCT GATAGATTGGCTATGCAAATAAGACAATTGCCGTTTGTCTTAACAGATGCTCAGTCTGGGGCTTTGGCTGAAATACTATC AGATATGAAGTCCTATGGGCACATGAATCGTTTGTTACAAGGGGATGTTGGTTCAGGGAAGACAGTAGTTGCTGGATTGG CTATGTTTGCTGCTGTGACTGCGGGGATGCAGGCTGCAATTATGGTGCCGACAGAAATTTTGGCTGAGCAACACTTTGAG AGTTTGCGCCAGCTTTTTCCAGAACTTTCTATTGCTCTTTTGACAGGTGGAATGAAAGCTGCGGAGCGTCGTACTGCTTT AGAGGCGATTTCTAGTGGTCAGGTAGACATCATTGTAGGAACTCATGCTCTTATACAGGAAAGTGTGACGTACCATAAGC TTGGTTTGGTTGTGACGGATGAGCAACATCGTTTTGGTGTTAAACAGCGCCGTCTGTTTCGTGAGAAGGGTGATAATCCG GATGTGCTTATGATGACTGCTACACCTATTCCTCGGACGTTAGCCATTACAGCTTTTGGAGATATGGATGTATCAATTAT TAATCAGTTACCTGCTGGTCGAAAGCCAATTATCACTCGCTGGGTCAAACATCAACAGCTGCCCACGGTCTTAGATTGGT TGGAGCGGGAGTTAGAAGTGGGTGCTCAGGTTTATTTTATCTCTCCGCTGATTGAAGAATCTGAGGCTCTAGATTTAAAG AATGCTGTAGATCTACAATCTGATTTACAGGCGCATTTTGGAGAGCAAGTTACAGTGGATTTGTTACACGGTAAGATGAA GAATGACGAGAAAGATGCCATCATGCAGGCTTTTAAGGAGCGAAAAACGAATATTTTGGTTTCTACCACTGTTATTGAAG TCGGAGTCAATGTGCCCAATGCAACGGTGATGGTTATTATGGATGCTGATCGTTTTGGTTTAAGCCAATTACATCAGTTG AGAGGGCGTGTAGGACGTGGTCATAAGCAGTCTTATGCAGTGTTAGTTGCTAATCCTAAAACAGAGTCTGGTAAGGAACG CATGAAAATTATGACAGAGACGACAGATGGTTTTATTTTGGCTGAAGCTGACTTAAAAATGCGTGGGTCTGGAGAAATAT TTGGAACTCGTCAATCAGGTTTGCCAGAATTTCAAGTTGCAAATATTATCGAGGACTATCCAATTTTAGAGGAAGCAAGG CGAGTTGCTAGTCAGATTGTTAGCGTGGAAAATTGGCAGGAGGACCCTAATTGGTCGATTTTGCTTGCTAATTTGAAAGA TCGAGAGGAATTGGACTAG Protein sequence : MKRLCDELSVLPGIGPKSAEKFLKISIQNINDLLTYYPFRYEDFESKSIYDLQDGEKAVVVGEVVSPANVQYYGYKRNRL RFSMKQGEVVLAVSFFNQPYLADKIVLGQDIAVWGKWDKAKASLTGMKILAQVSDELQPVYHVAQGISQVNLVKAIKTAI DQGYLHLLEENLPSVLRERYRLMNRREAVFAMHFPTNLEEYRQALRRMKFEELFYFQLQLQMLKANNRDILNGLKIAYDA DRLAMQIRQLPFVLTDAQSGALAEILSDMKSYGHMNRLLQGDVGSGKTVVAGLAMFAAVTAGMQAAIMVPTEILAEQHFE SLRQLFPELSIALLTGGMKAAERRTALEAISSGQVDIIVGTHALIQESVTYHKLGLVVTDEQHRFGVKQRRLFREKGDNP DVLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIINQLPAGRKPIITRWVKHQQLPTVLDWLERELEVGAQVYFISPLIEESEALDLK NAVDLQSDLQAHFGEQVTVDLLHGKMKNDEKDAIMQAFKERKTNILVSTTVIEVGVNVPNATVMVIMDADRFGLSQLHQL RGRVGRGHKQSYAVLVANPKTESGKERMKIMTETTDGFILAEADLKMRGSGEIFGTRQSGLPEFQVANIIEDYPILEEAR RVASQIVSVENWQEDPNWSILLANLKDREELD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-96 | 44 |
