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Name : PC1_1298 (PC1_1298) Accession : YP_003016881.1 Strain : Pectobacterium carotovorum PC1 Genome accession: NC_012917 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular exopolysaccharide family Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : 2.7.10.2 Position : 1514743 - 1516917 bp Length : 2175 bp Strand : + Note : KEGG: eca:ECA1419 tyrosine kinase; TIGRFAM: capsular exopolysaccharide family; PFAM: lipopolysaccharide biosynthesis protein DNA sequence : ATGGCAGAGAAAATTTCAGTAAAAGCATCCGAAACCAATACGGATGAGATTGATTTAGGACGTTTGTTGGGAACATTGCT GGATAATCGCTGGTTAATTATTGGTGTTACTGCAGTTTTCACAATTTTTGGTATTCTTTATGCGACCTTTGCCACGCCGA TTTATAAAGCAGATGCACTCATTCAGGTGGAACAAAGTTCAGGTAACTCTTTGCTGAAAGATATTTCCAGCGTGTTACCC GATGCTAAACCAGAATCGGCTGCTGAAATCGAGTTGATAAAGTCTCGTATGGTTGTGGGTAAGACTGTGAAGGATTTGTC GTTGGATATTGTTGTCCAACAAAAGTACTTTCCGATTTTTGGCAAAGGATTCGCTCGTCTGATGGACGATGAACCTGGAA AAATTGCTGTTTCACGGCTTGAAGTTCCTCAATCTTGGCAAGAAAAGTTAATTAAGTTAACTGTTTTGGATTTACAGACG TATCAAGTCGAAGTCGGTGATGTTGTAAAATTTAAGGGCAAAGTTGGGCAAATAGAAAAACATGATGGACTCTCTATATT GCTGAGTGAGATTCAGGCTGAACCAGGAATGGTATTCCGTGTACAAAAGCTGAATACGCTTACGGCAATTAACAATGTCC TGGGTAATCTGTCTGTCGCCGATAAAGGTAAAGATACTGGTGTGCTATCGTTGAGCTTTGAAGGTGAAGAGGCTGAGCTT ACTAATAAAATACTTAATAGTATTAGTCAAAATTACTTACAGCAAAACGTTGAGCGTAAGTCAGAAGAAGCAGGGAAGAG TCTGGAATTTTTGAAAGAGCAGCTTCCTAGTGTACGTTTAAATTTGGATGATGCAGATAATAAGTTAAATAGCTATCGTC AAAAAAATGAATCTGTAGATTTGTCGTTAGAGGCAAAAGCAGTTTTGGATACGATGGTTGCAGTTGAATCTCAATTAAAT GAATTAACTTTTAAAGAAGCTGAAATATCGAAACTTTATACTAAGGAACACCCAGCCTACCGTGCTTTGATGGAAAAGCG TAAAACGTTAGAAGAAGAACGTGAGAAAATTAATAAACGAGTAGGCGTTATGCCTAAAACCCAACAGGAAATATTACGCT TAACGCGTGATGTAAACGTTGGGCAAGAAGTCTACATGCAGTTACTTAATAAGCAGCAAGAGCTTAGTATTAACAAAGCG AGTACTGTAGGAAATGTTCGAATTATTGACCCGTCTGCAATTCAATTAAGCCCCGTAAAACCTAAAAAAGCACTTATTGT GCTACTGGCTATCTTACTCGGTGGAATGGTATCAACGGCATTTGTTGTACTAAAAACTTTATTACATAAAGGTATTGAAA GCCCTGAGCAGTTGGAGGAATTAGGGATCAATGTTTATGCGAGTGTGCCACTTTCTGAATGGCAACAGAAAAAAGACAGA GTGTTATTAGCAAGATCGAATAAAAGTAATACACGGGCCACTGAATTACTAGCGATTGGTAACCCTACAGATCTTGCTAT TGAAGCAATTAGAAGCCTCCGTACCAGTCTGCATTTTGCCATGATGGAAGCCAAAAATAATGTACTGATGATTTCTGGTG CTAGCCCGGCAATTGGTAAAACATTTATCAGTGCAAACCTTGGGGCTGTTATTTCTCAATCTGGTCAACGCGTTCTAATT GTTGATTGTGACATGCGTAAAGGCTACGCCCACGAGCTGATGGGTACGCAGAGCGTTGATGGCTTGTCGGATATTTTGTC TGGGCAGATAGAAGTAGAGAAAAGTATTCGGAAAACGGCACTGGAGAATATGGATTTTATTCCTCGCGGCCAAATTCCAC CTAATCCGTCCGAGCTTTTAATGCATAGTCGGTTCCCGCAATTTATTAAGTGGGCTGCGGAGCATTACGATATTGTATTA TTAGATACACCGCCGATACTCGCTGTAACGGATGCTGCTATTATTAGCCGTCATGCAGGAACTTCTCTCTTAGTTGCACG CTTTGAAGTGAATACACTCAAAGAAATTGAAGTCAGTATTCGTCGTTTTGAACAGAATGGTGCAGAAATAAAAGGCGTTA TTCTGAATGCTATTGTAAAACGTGCGGCAAGTTACTACGGGTATGGAAACTATCACTACTATACCTATGACTATAAGTCA GAAAAAAATAATTAA Protein sequence : MAEKISVKASETNTDEIDLGRLLGTLLDNRWLIIGVTAVFTIFGILYATFATPIYKADALIQVEQSSGNSLLKDISSVLP DAKPESAAEIELIKSRMVVGKTVKDLSLDIVVQQKYFPIFGKGFARLMDDEPGKIAVSRLEVPQSWQEKLIKLTVLDLQT YQVEVGDVVKFKGKVGQIEKHDGLSILLSEIQAEPGMVFRVQKLNTLTAINNVLGNLSVADKGKDTGVLSLSFEGEEAEL TNKILNSISQNYLQQNVERKSEEAGKSLEFLKEQLPSVRLNLDDADNKLNSYRQKNESVDLSLEAKAVLDTMVAVESQLN ELTFKEAEISKLYTKEHPAYRALMEKRKTLEEEREKINKRVGVMPKTQQEILRLTRDVNVGQEVYMQLLNKQQELSINKA STVGNVRIIDPSAIQLSPVKPKKALIVLLAILLGGMVSTAFVVLKTLLHKGIESPEQLEELGINVYASVPLSEWQQKKDR VLLARSNKSNTRATELLAIGNPTDLAIEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNVLMISGASPAIGKTFISANLGAVISQSGQRVLI VDCDMRKGYAHELMGTQSVDGLSDILSGQIEVEKSIRKTALENMDFIPRGQIPPNPSELLMHSRFPQFIKWAAEHYDIVL LDTPPILAVTDAAIISRHAGTSLLVARFEVNTLKEIEVSIRRFEQNGAEIKGVILNAIVKRAASYYGYGNYHYYTYDYKS EKNN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 8e-163 | 52 |
