Name : deoA (MCJ_005580) Accession : YP_002961060.1 Strain : Mycoplasma conjunctivae HRC/581 Genome accession: NC_012806 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0213 EC number : - Position : 646218 - 647522 bp Length : 1305 bp Strand : - Note : similar to sequence:SWISS-PROT:Q4A8S9|Q4A8S9_MYCH7[Mycoplasma hyopneumoniae] DNA sequence : ATGTCAATAATTGATCTAATTGAAAAGAAAGTAAATAAAAATTCATTAACCCAAGAAGAGTATGATTTTGTTGTACAAAA TTTTATATCTGGGGAGATTAAAGACTACCAAATGTCTTCTTTTTTAATGGCTATCAAACTTCAAGGCATGAGTGATCAAG AACTTTTTTATTGAACAAATTCCTTCATAAATTCAGGTGAAATTCTTGATTTGTCAGCAATTGAAGGTATTAAAATTGAT AAACATTCAACAGGTGGGGTAGGGGATAAAATTTCATTAATTCTTTGCCCCATTTTAGCCGCTATGGGTTATAAAATTCC CAAAATGTCAGGTCGAGGTTTAGGACACACAGGTGGAACTATTGATAAATTAGAATCCATTCCCGGCCTAAATACAGATT TAAGTATTTCTCAATTTATTAATCAAACTAAACAAATTGGTTATTCTGCTATTTCGCAAAGTGGATCTTTAGTTCCAGCT GACAAAAAAATCTATGCCTTGCGTGATGTAACAGGAACAGTAAATTCAATTCCTTTGATAGCATCATCAATTATGTCTAA AAAAATAGCTGTTGGCGCAGATGTCATTTTAATTGATGTAAAGTGTGGCAATGGTGCTTTTATGACTAATTTAAGGGATG CCAAATTACTTGCACAGAAATTAATTTCAATTGGAGAACACTTTGGTAAACGAACAATTGTCGAAATTACCAATATGTCA GTTCCACTAGGAAAAATGATTGGTAACAAAAATGAAGTTTTAGAAGCCGTTGATGTTTTATCAGGAAAAGGTTCTACCTC ACTTACTAAATTTATATATAAATTGGTAGAAAATTTTCTTGTAAACGTGATTAAAAAGAGCCCAAGTGTTGCAAGAAGAG AAATTAAAGATGTAATTGAGAGTAAAAAAGCACTTAATAAATTTTTTGCAATGGTCAAAAGTCAAGGTGGAAATGTTGAT TTAATTCAAGCTGATTCCTTTTGAAAACCAAAATATTCATATGATGTTAAATCTGAAAAATCTGGTTACATTAAATGAGA ATCAGCACTTGCTTTTGGAAAAATATCTTTACTTTTAGGAGCAGGACGCCTTAAAAAAGAAGACAAAATTGACAATGAAG CTGGTATTGAATTAAAAGTTGAAAATGGCGACTATGTTGGTACAAACCAAACACTTTTTACCCTTTATTCTTCTAAACCA ATTGATCGACGAAGCATGAAAAATCTTATCGAACAAGCATATACAATTTTGGAAAAACAACACCAAACAAAAATGTTTTT AACAAGGATGACTAATGAATTTTAG Protein sequence : MSIIDLIEKKVNKNSLTQEEYDFVVQNFISGEIKDYQMSSFLMAIKLQGMSDQELFYWTNSFINSGEILDLSAIEGIKID KHSTGGVGDKISLILCPILAAMGYKIPKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGLNTDLSISQFINQTKQIGYSAISQSGSLVPA DKKIYALRDVTGTVNSIPLIASSIMSKKIAVGADVILIDVKCGNGAFMTNLRDAKLLAQKLISIGEHFGKRTIVEITNMS VPLGKMIGNKNEVLEAVDVLSGKGSTSLTKFIYKLVENFLVNVIKKSPSVARREIKDVIESKKALNKFFAMVKSQGGNVD LIQADSFWKPKYSYDVKSEKSGYIKWESALAFGKISLLLGAGRLKKEDKIDNEAGIELKVENGDYVGTNQTLFTLYSSKP IDRRSMKNLIEQAYTILEKQHQTKMFLTRMTNEF |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 5e-69 | 43 |