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Name : RPR_05760 (RPR_05760) Accession : YP_002916764.1 Strain : Rickettsia peacockii Rustic Genome accession: NC_012730 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 978676 - 980274 bp Length : 1599 bp Strand : + Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1 DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGACTTTTCAAGATGCCATTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT AACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCAGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG ACCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MDITTTEIYHDGHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP NGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFASWNMVSSIGAGISMF AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGPDTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-95 | 47 |
