|
Name : RPR_00540 (RPR_00540) Accession : YP_002916133.1 Strain : Rickettsia peacockii Rustic Genome accession: NC_012730 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+) Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 90724 - 92133 bp Length : 1410 bp Strand : - Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases DNA sequence : ATGAACTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAATTTTTCTTTATGGTCACAAAGTTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAACACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTGCT TGCAAGGTAATACCTGCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTT AGTACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAG GTAAGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAA AATGCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCAGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTT AGAGAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTA TAGAAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCTGGTGACGGATTTGAT AAGGAATCGGATGTAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAA AGGAGCTACATTAATTTGCGGCGGTAAAACTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATA TGGATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACAT GCAAATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCT TGATTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTT TTGGAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATATATAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTNFSLWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ENIEELSHILTLEQGKVLAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSNTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIA CKVIPAAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGATNVGKILYQ NAANTLKRLSLELGSNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFD KESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGATLICGGKTVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEH ANNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 1e-89 | 46 |
