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Name : ctaD (BAA_4178) Accession : YP_002868243.1 Strain : Bacillus anthracis A0248 Genome accession: NC_012659 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 3803533 - 3805395 bp Length : 1863 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00115; match to protein family HMM TIGR02891 DNA sequence : GTGAGTTCTGTAGCAAAAAAACAGGGGATGGGTGCTGTCATATGGGATTATTTAACGACAGTAGACCATAAAAAGATTGC CATTCTCTATTTAATTGCAGGTGGATTGTTTTTTGTAATAGGCGGAATAGAAGCTCTATTTATTCGCCTTCAATTAGCGA TTCCTAACAACGCTTTTCTTGTTGGGGATGCTTATAATCAAGTATTAACCATGCACGGTACAACAATGATTTTCCTCGCA GCCATGCCACTCGTGTTTGCATTTATGAACGCCGCTGTACCACTTCAAATTGGTGCACGTGATGTAGCGTTCCCGTTTTT GAATTCACTCGGATTTTGGTTATTTTTCTTTGGTGGAGTATTTTTAAATTTAAGTTGGTTTTTAGGTGGAGCACCTGATG CAGGATGGACATCTTATGCATCTTTAGCTTTAGCCTCTAAAGGCCATGGTGTTGATTTTTATGTACTCGGCTTGCAAATC TCCGGTATAGGTACATTAATTGGAGGCATCAACTTCCTTGTAACCATTATTAATATGCGTGCGCCAGGAATGACGTATAT GCGTATGCCGATGTTTACATGGACGACATTTGTAACATCTTCGTTAATATTATTTGCTTTTCCGCCGTTAACTGTCGGAT TAGGACTTTTAATGTTAGATCGCTTATTTGGAACAAGTTTCTTTAATCCAGCGCTGGGCGGGAATACAATTATATGGGAG CATTTATTCTGGATTTTTGGTCATCCAGAAGTATACATTCTTATACTCCCAGCTTTCGGAATATTCTCAGAAATCTTCGC TACATTTTCGAAAAAACGATTATTTGGTTATTCGTCGATGGTGTTTGCGACAGTATTAATTGGATTTTTAGGATTTATGG TATGGGCGCATCATATGTTTACTGTTGGACTTGGTCCAGTTGCCAATGCTATTTTCTCAGTTGCAACAATGGCTATTGCG GTTCCGACCGGTATTAAAATATTCAACTGGCTCTTTACAATGTGGGGCGGAAGTATTCGCTTTACGACACCTATGATGTG GGCAGTAGCCTTCATTCCATCATTCGTAATGGGAGGAGTTACAGGTGTTATGCTAGCATCTGCACCAGCTGATTATCAAT TTCATGATAACTATTTCGTAGTAGCTCATTTTCATTATGTAATCGTCGGCGGTGTTGTATTTGGTCTACTTGCAGGAGCG CATTATTATTGGCCACTGATGTTTAATAAAATATTGAATGAGACATTAGGAAAGATAACATTTTGGTTATTCTTTATCGG TTTCCATTTAACGTTCTTCATTCAGCATTTTCTTGGTTTAATTGGTATGCCGCGTCGTTACTACACATACCTTGAGGGAC AAGGATTAGAGATGGGGAATATGATTAGTTCTATTGGAGCGGTATTTATGGCTCTTGGAACGATTGTTCTTTTATTCAAT GTCATTAAAACGACAGTTTCAAAAGAAAAGGCAGGGCGTGATCCATGGGATGGTCGTACATTAGAATGGACAATGCCAGC GCCTACACCGGAATATAACTTTAAACAATTGCCATTTGTTCGCGGGTTGGATCCGTTTTGGATTGAAAAACGCGAAGGGA ATAAAGAGATGACAGCGGCAGAACCAGTTGGTGATATTCATATGCCAAATGCATCATTTTCACCATTTATCATTTCTTTA GGATTGTTTATAGCGGCATTTGGTGCAATGTATATGCAAGGTGGAAAAGATAAGTTTTGGTTATTAGTAGCAATTATTGG TTTAATCATTACGTTTGGCGCAATGTTCCTGCGTTCAGTAATCGATGATCATGGATATCATATTCATAAGGAAGATTTAG AAGATAAGGGGGGCAAGGCGTAA Protein sequence : MSSVAKKQGMGAVIWDYLTTVDHKKIAILYLIAGGLFFVIGGIEALFIRLQLAIPNNAFLVGDAYNQVLTMHGTTMIFLA AMPLVFAFMNAAVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFFFGGVFLNLSWFLGGAPDAGWTSYASLALASKGHGVDFYVLGLQI SGIGTLIGGINFLVTIINMRAPGMTYMRMPMFTWTTFVTSSLILFAFPPLTVGLGLLMLDRLFGTSFFNPALGGNTIIWE HLFWIFGHPEVYILILPAFGIFSEIFATFSKKRLFGYSSMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGLGPVANAIFSVATMAIA VPTGIKIFNWLFTMWGGSIRFTTPMMWAVAFIPSFVMGGVTGVMLASAPADYQFHDNYFVVAHFHYVIVGGVVFGLLAGA HYYWPLMFNKILNETLGKITFWLFFIGFHLTFFIQHFLGLIGMPRRYYTYLEGQGLEMGNMISSIGAVFMALGTIVLLFN VIKTTVSKEKAGRDPWDGRTLEWTMPAPTPEYNFKQLPFVRGLDPFWIEKREGNKEMTAAEPVGDIHMPNASFSPFIISL GLFIAAFGAMYMQGGKDKFWLLVAIIGLIITFGAMFLRSVIDDHGYHIHKEDLEDKGGKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-92 | 50 |
