|
Name : treC (CLJ_B2193) Accession : YP_002862973.1 Strain : Clostridium botulinum 657 Genome accession: NC_012658 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2180214 - 2181881 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTTGTCTATCAAATATATCCAAAATCCTTTAATGATACTAATGGTGATGGATTGGGAGA CTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTAGATTATTTAAAAACATTAGGTGTAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATCT CGCCTCAAAAAGACAATGGATATGATGTTGCAGATTATTGTAATATTGATCCCCTATTTGGAACCATGGGGGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGTGACGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAGAACCTAAAAATGAACAGCTCC CTACCAATTGGGAATCTAAATTTGGAGGTTCCGCTTGGGAATATGTTAAAGAATTTGATGAATATTATTTACATTTATTT GATACTACCCAAGCAGACCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAAAAGAAATTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAA AAAAGGTGTAAAAGGCTTTCGTTTTGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCGATGGAATATAAGGATGACAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACAGATGGTCCTAATATTCATAACTATATAAAGCAACTAAATAAAGAAACTTTTGGCAGAGAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAAATCCTAAAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGGATTTTGATT TTATAAAATTAAAGAATCTCTTTAATCATTGGCAAGTTGGAATGGAAGAAGGTAATGCTTGGAATGCAGTATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGTTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATTTACTTAGAGGAACTCCTTATATTTATCAGGGAGAAGAAATCGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAGGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAGTCTGAAGGTAAAACCAAAGAAGAAATAATT AAAATTTTACAGGCAAAATCAAGAGATAATTCCCGTAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAGGCAATGCTGGATTTACTAA AGAAGAGCCCTGGATAGAAATATGTAAAAATTATAAATCCATTAATGTAGAAAACTCTTTAAAGGATAAGGACTCTATTT TTTATCACTATCAAACATTAATTAGATTAAGAAAAGAATACGATATTATATCTTATGGAAATTTTGAATTAATATTAGAA GAAGATAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAATTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTCTATGGTAAGGA ATCCTTATTTAAATTTCCTGCTGAATTAAAATTAGATAAATATAAAAACAAAATTTTAATTTCTAATTATAAGGATTCTC CTATAGATTTTAGAGAATTTAATTTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNGDGLGDLKGITVKLDYLKTLGVDYIWLTPFYISPQKDNGYDVADYCNIDPLFGTMGDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSDDKKYKNYYIFKEPKNEQLPTNWESKFGGSAWEYVKEFDEYYLHLF DTTQADLNWENEEVRKEIFDIVNFWIKKGVKGFRFDVINLISKPMEYKDDNNGDGRSFYTDGPNIHNYIKQLNKETFGRD KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSNPKEEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMDFDFIKLKNLFNHWQVGMEEGNAWNAVFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYRDVESINFYNILKSEGKTKEEII KILQAKSRDNSRSPMQWDNSGNAGFTKEEPWIEICKNYKSINVENSLKDKDSIFYHYQTLIRLRKEYDIISYGNFELILE EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKESLFKFPAELKLDKYKNKILISNYKDSPIDFREFNLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-125 | 47 |
