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Name : gabD (RAF_ORF0578) Accession : YP_002845230.1 Strain : Rickettsia africae ESF-5 Genome accession: NC_012633 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : 1.2.1.16 Position : 604963 - 606390 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAACTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTAGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAGTTTTTCTTTATGGTCACAAAGTTCATTTGGAGCGAGAATAGCAATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGGAATTTTATA TGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAACACTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCTAATGCAATGATTACT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCAGAAATTATCATTTACCGGCGCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTAAAACTAGGAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAG GAATCGGATATAGGTCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAACTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAATAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACATGCA AGTAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGCACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA TTTTGTTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCGAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCGGGTTTTG GAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGAATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGAATTAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFSLWSQSSFGARIAILRRWYNLVI ENIEELSHILTLEQGKVLAESKKGILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSNTHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLQKLSFTGATNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDIGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKTVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRIEIFGPVVACYKFKDLDEVIEHA SNTEYGLQGYVYSNNISVAQMIASKLDFVMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 2e-92 | 46 |
