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Name : coxA (RAF_ORF0515) Accession : YP_002845179.1 Strain : Rickettsia africae ESF-5 Genome accession: NC_012633 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 546079 - 547677 bp Length : 1599 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATTGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCGGAGGTTTGTTTTCACTGCTTTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGAGC TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGCCTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTCTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC AGGCTTTGGTATAATAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCGCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGCGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAACTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCACCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MDITTTEIYHDCHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIISQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMF AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-94 | 46 |
