Name : VCM66_0779 (VCM66_0779) Accession : YP_002809550.1 Strain : Genome accession: NC_012578 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 837580 - 842181 bp Length : 4602 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTCAATAAAAAAATTACAATAACTTCAACTGGTATTACGTTGTCTATTTTTTCCTTTATGGCTAAAGCTGATCCTAA AATTAATTTCGCAGTGGATTATTTCTCTTATGGTAGTAATGGAAGATGTATGGTTGCTATGGAGATCGAAAAAAGTAATT TAAATGAAATATATAATATAATTAATAAAAATCACTTTGATATCGATTTTGAAGTTTTACTGTATGAGAAAGATAAAAAT GGAAAAATTGAGAAGCCTCATGGTACAGAGATGGTTAAATTCAAATTTAATGAATTTGATAACCTTGTTCATGATCATGT TATTGTCATGTCAAAAATGGAACTTCCATATTCATGGTGGCATGAATGTAAAGTCTTAAGTGTTAATTTATCAGATAAGA AATATGCTAAAGTTACAATATATGACGATTTTAATGGCGACGTTTCATTTAGAAATATAGTTGAAAATAATAAGATTTCC AGTTTTGATTTCTTTTCTGATATAGTAAACATGGCATTCGCCTATAGAATGAAAGATGAAAAACCAACAGAGAATGAGAT CCTCCAGAACATATCCAAAATGAAAAGTTATAATAAGGGAAAGTCAGGGAATGAATCACTAAATAGAAAAATTATTGGAT ATACAAACACTATATCTTTAGGAGATAGTGGTATAAATGGTTCTATAGGTTTTAATATATCTGAAGATTTCATTAAATTA CGAACAAAAGATAAGATCAATAATTTTATAAAAGAAAAAATCGTAAAACCTGCAGTAGAAGTTGGTATCGTTGATCGTAA ATTTCAAGAATCAAAGTATATTGATGAATTAAGACAGAGACTACTAAAAAGTTTAAATCAAGATCATTACTTTGAATATG GTTCAGAGAAAAATTTGCAATTATCATTGGTAATGATGTTCTCAGACTTGTACAGTCAGCCTATATTATCCTACGGAAAA ACGATACCTGCATACAGCGATTCCTTTTTTAGTGATTTATGGGAGTCAATGTTAAGTGGATTCATCAATAGTATTGAACC TGTGAAATTATATGAACATGAGTCATATCATGGGCATTCGATATCATTAAACATGGATAGTGAATTTTTGCATGGCTTTA ATGATATTGCTTCATCAATAAAAATTCCGAAAGGGTGGCAAGTTACTTTATTTGAACATGGCGGATATACTGGTTCTTCT ATTGTAGCTAATAGTGATATTAAGGCATTAGGAGAGAAGAATCTGAATGATACGGTAAGTTCTTTGATGGTTGAGTATGT CGGTGATGATCCTTCCGAACTCTATGACATGTTATTGTTGACCATCAATTATGGTAACCTCTCAGGTATAGATTTTTCTC GCGAAATTTTTAATAAAAATAAGGATATTATAGTTGACTATAAAAAGGGTACCATTAACCATAGAGGTATTACTGGTGGA TTTTTGGGGAAGACTTTTGCTCAAGTTGCAGCCATTTTGTATCAAAAATCTATTGAGGAGCTCAGCTATATTGAGTTACT GAGTACTAAAAATGCATTAGAAAGTATTGGTATTGACACCGTATACCCTTATGGCAGTATGGATAATATAAAAGCAAGTC TATTCTTGAGGGTCAACAATAATCTATCAAAAAGGTTACTTCCTGAAGAGGTCGGTATTGGATCTGAGCCATTTATTATT GATGAATTATTGGCAAGAAATAATCAATTAACAATGTTTAACTTTTCTAATGCATTAGATAAGCTTACTGAAGATATTTA TTCTAATGCTAATTTATATCGTTCAGATAATGTTGTAAGACTCTATGCTGATCATAACTATACAGGTCACTATATAGATA TTGAAAATTCGACGAAATTCCTACATGGATTTAATGATACACTTTCGTCTTGGACTATCCCACATGGCTGGTCTGTACGA TTTTATGAACATGGTGACTATCAAGGACGTTATTGGACAAGAGATGCTTCTGGAAATGAATCAGGATTTAATGATGTAAT TAGCTCTATTGAGATATTGAAAAAAACATCTGGGATAAAAGGTAGCTTAATACGTAATGAGCTTGAATCATTAAAAAATA GCTACAGAGAAATAGATAAATTTCAAGTAATTGTCGGTTATGAAAATGAAACACCAATTTATGCCCTTCCTTTAACTGAT GAGCTTTTTGCTAAAGCTCAGCTGTACAGTTATGGATTAGATGCCAACTTTGTTGACAAACACTGGAAGTCATACCTAAA AAAAGGCCGCTTGTCTCTTATCCCCGGGGTTCGTGTAGGGAAGGATATTCTTAAAAAGGATGCTGCTGCATTAGGAGGAG ATGTAACAACAAAAGGTGCACAAGATTTATGGAGAAGAAAATACCAAGAAATCAGCCAAGTTATGGCAAAGTATATTGCA ACTCTTATTTCATTTAAAGCAAAGCTAGAGGGAAAAGAATCATGGGATATTCAATCTGAAAATAAAAATCGTTCAGTTAG ATTTAATTTTGGATTCGGAATTACATATTATAATATGGGTAATAATGGTAAAGCCCATTCAAGATATGAAAATATTCCAA CTCAAAGCTGGGTCATGACGGGTAAGGATATAAGTTATTCGGTTACGACACCTGGTGATTTGTTGAGCCTGTTCAGTCTT AATAATTTTAAAGTGATAGAACCTATCGATTTTAATTCAGGCTCGAATAATTATCCACTTTATCAATTGATGAACTCCGA TTACGCCGATAAGTGTTCATATTATCAAGATGGATGGTATCCTCGGTGGAATGTGTGTGATACAAAATTTATAACGAGAA ATAAAAAATCATATAATACAAAAGACATCATGTCATATGGATGGCAAGAGTTTCTAAATTTTAAAATGAACGATTTGAAG ACTGTACAAACAGATAGAGATATAGCATATCAAGTATTGATGGCGATTCTTCCTGTATGGGGAACTGTTGAAGATATTAA ATCGGGTGATGCAGGAATGGCAACCCTTGGTGTGTTAGGTGACGTAATGTTTTTTTTACCCATAGCAAAAAGTGTTTCTA GTATCGGAAAACTATCTGCTAAAGCTGCGTCGTCTAAACTACTACCGAGAAATGTTAAGTTTGTTAGAAATGTCATTGGC CTAAACAAACAAGGTAAGTATTCATTAACATCATCGCAAGCTGATAGAGCTTTCTATAAATTAAAAATACAAGGAAAACT AAAGGAACTCCCTAAAGTTATATTAAATGAACTTAATCCTATCGCAGGTTTGGATCAGCTCGTTGTTACAGGGACAAGTA AATTATATAAAAAATATTCATCGCGGGTTAGTATACCTAAAAAAAATATAATAGGTGATAACTCAGTTGTGTTTTACGAT GATTTAAAGTTTAAATCAGAGGTGTTTTCAGTATCATATTTAGATGATGGTTATTTAATTATTAATAATCAATATCGAGC TGTTTATATTGATGGTAACTACTATAGGGTCGAATATGATCCAATACTACGTGCTAATTTTATTTATGAACAAAATAGTG GGAGAAGGATAGAAATTATTAAAGATAAAAATGGCAATTGGTCTATTAAAGAAATTAATAATGGGATTTGTCCACTTGTT TCGTTAATGAATAATACTAAAGTATGTCATTTCACCAACATTGATGATGCATTAATAAGTATGGGGTTTGACCCAAAAAC CAGAACAGCATCAGGATTATTGGAGTTGATTAATGGTCGATATGGACCTGATATTAAAGAATACTTATTAAAATTAAATT CTTCGCTATCTCTTAATTATAATATCGATATAGATACTCTAAATTGGGTTTTCGATACTATAGAAAATTCTGGCATGTCT AGATATGCATTTACTCCATTTGTAAAAAATACTGATGCCATCATGTATGATATGCTAGGTAAGTTTTATAATAATAACAT GAGTATTAAACCTGTTTTTTTGAACAAATCGCAGTACAAAAAATTAAAAAAAACTTTAGACTCTGATAAAGAATTAATTA TAAATGTAATTTCAGAACAAAGGAAAATTAATCTAAATGAGGCACAGCAGCTCTTCGATGAATTTTATGCTTCTGTTACG AAAGATCCTATTTTTGGTTTGGATTCTATAACACATGATAGACCGGTTATTCATGTCGTCGGACATGGTGATGCTGGTGA TGAAGTCATCTACCCTGGTGATGCAAGCCATTACTTTTACGCTTTCGAGTTAGCTGATATGCTGAAAAATAAAGGATTAA AGCCGGATTCAATCATAAAACTTGACTTTTGTTGGAGTGCTTGCTCTCTCAAACCAAGTGATTATTCAAAAACAGAAGTA CTGACTCGTATGAATAAGGGGGATTACACTCCTTTATTTGGTGACATTGATGATAGCTTTCTGGGGGAGTTTGCTAAAGA ATTAACGGCAATGTACCCTACATTCCGTGGACCAATAATCGGATACGTAGGGACAGTATTAAACACAATTCAAGATAATG TGTTAACTTTAGCTAATACACAAGGTCGGTTTCATGCTGTAGAAATGAACTTTTCTGATGGTAAATTTTTTTTCAAGAAA GAGGATGCAGAAGTTATTTATGGGAGTTATAAAAATAAATGA Protein sequence : MFNKKITITSTGITLSIFSFMAKADPKINFAVDYFSYGSNGRCMVAMEIEKSNLNEIYNIINKNHFDIDFEVLLYEKDKN GKIEKPHGTEMVKFKFNEFDNLVHDHVIVMSKMELPYSWWHECKVLSVNLSDKKYAKVTIYDDFNGDVSFRNIVENNKIS SFDFFSDIVNMAFAYRMKDEKPTENEILQNISKMKSYNKGKSGNESLNRKIIGYTNTISLGDSGINGSIGFNISEDFIKL RTKDKINNFIKEKIVKPAVEVGIVDRKFQESKYIDELRQRLLKSLNQDHYFEYGSEKNLQLSLVMMFSDLYSQPILSYGK TIPAYSDSFFSDLWESMLSGFINSIEPVKLYEHESYHGHSISLNMDSEFLHGFNDIASSIKIPKGWQVTLFEHGGYTGSS IVANSDIKALGEKNLNDTVSSLMVEYVGDDPSELYDMLLLTINYGNLSGIDFSREIFNKNKDIIVDYKKGTINHRGITGG FLGKTFAQVAAILYQKSIEELSYIELLSTKNALESIGIDTVYPYGSMDNIKASLFLRVNNNLSKRLLPEEVGIGSEPFII DELLARNNQLTMFNFSNALDKLTEDIYSNANLYRSDNVVRLYADHNYTGHYIDIENSTKFLHGFNDTLSSWTIPHGWSVR FYEHGDYQGRYWTRDASGNESGFNDVISSIEILKKTSGIKGSLIRNELESLKNSYREIDKFQVIVGYENETPIYALPLTD ELFAKAQLYSYGLDANFVDKHWKSYLKKGRLSLIPGVRVGKDILKKDAAALGGDVTTKGAQDLWRRKYQEISQVMAKYIA TLISFKAKLEGKESWDIQSENKNRSVRFNFGFGITYYNMGNNGKAHSRYENIPTQSWVMTGKDISYSVTTPGDLLSLFSL NNFKVIEPIDFNSGSNNYPLYQLMNSDYADKCSYYQDGWYPRWNVCDTKFITRNKKSYNTKDIMSYGWQEFLNFKMNDLK TVQTDRDIAYQVLMAILPVWGTVEDIKSGDAGMATLGVLGDVMFFLPIAKSVSSIGKLSAKAASSKLLPRNVKFVRNVIG LNKQGKYSLTSSQADRAFYKLKIQGKLKELPKVILNELNPIAGLDQLVVTGTSKLYKKYSSRVSIPKKNIIGDNSVVFYD DLKFKSEVFSVSYLDDGYLIINNQYRAVYIDGNYYRVEYDPILRANFIYEQNSGRRIEIIKDKNGNWSIKEINNGICPLV SLMNNTKVCHFTNIDDALISMGFDPKTRTASGLLELINGRYGPDIKEYLLKLNSSLSLNYNIDIDTLNWVFDTIENSGMS RYAFTPFVKNTDAIMYDMLGKFYNNNMSIKPVFLNKSQYKKLKKTLDSDKELIINVISEQRKINLNEAQQLFDEFYASVT KDPIFGLDSITHDRPVIHVVGHGDAGDEVIYPGDASHYFYAFELADMLKNKGLKPDSIIKLDFCWSACSLKPSDYSKTEV LTRMNKGDYTPLFGDIDDSFLGEFAKELTAMYPTFRGPIIGYVGTVLNTIQDNVLTLANTQGRFHAVEMNFSDGKFFFKK EDAEVIYGSYKNK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | AAC12276.1 | putative inner membrane protein | Not tested | VPI | Protein | 0.0 | 100 |
unnamed | AAK20779.1 | putative inner membrane protein | Not tested | VPI | Protein | 0.0 | 100 |