Gene Information

Name : VCM66_0779 (VCM66_0779)
Accession : YP_002809550.1
Strain :
Genome accession: NC_012578
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 837580 - 842181 bp
Length : 4602 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTTCAATAAAAAAATTACAATAACTTCAACTGGTATTACGTTGTCTATTTTTTCCTTTATGGCTAAAGCTGATCCTAA
AATTAATTTCGCAGTGGATTATTTCTCTTATGGTAGTAATGGAAGATGTATGGTTGCTATGGAGATCGAAAAAAGTAATT
TAAATGAAATATATAATATAATTAATAAAAATCACTTTGATATCGATTTTGAAGTTTTACTGTATGAGAAAGATAAAAAT
GGAAAAATTGAGAAGCCTCATGGTACAGAGATGGTTAAATTCAAATTTAATGAATTTGATAACCTTGTTCATGATCATGT
TATTGTCATGTCAAAAATGGAACTTCCATATTCATGGTGGCATGAATGTAAAGTCTTAAGTGTTAATTTATCAGATAAGA
AATATGCTAAAGTTACAATATATGACGATTTTAATGGCGACGTTTCATTTAGAAATATAGTTGAAAATAATAAGATTTCC
AGTTTTGATTTCTTTTCTGATATAGTAAACATGGCATTCGCCTATAGAATGAAAGATGAAAAACCAACAGAGAATGAGAT
CCTCCAGAACATATCCAAAATGAAAAGTTATAATAAGGGAAAGTCAGGGAATGAATCACTAAATAGAAAAATTATTGGAT
ATACAAACACTATATCTTTAGGAGATAGTGGTATAAATGGTTCTATAGGTTTTAATATATCTGAAGATTTCATTAAATTA
CGAACAAAAGATAAGATCAATAATTTTATAAAAGAAAAAATCGTAAAACCTGCAGTAGAAGTTGGTATCGTTGATCGTAA
ATTTCAAGAATCAAAGTATATTGATGAATTAAGACAGAGACTACTAAAAAGTTTAAATCAAGATCATTACTTTGAATATG
GTTCAGAGAAAAATTTGCAATTATCATTGGTAATGATGTTCTCAGACTTGTACAGTCAGCCTATATTATCCTACGGAAAA
ACGATACCTGCATACAGCGATTCCTTTTTTAGTGATTTATGGGAGTCAATGTTAAGTGGATTCATCAATAGTATTGAACC
TGTGAAATTATATGAACATGAGTCATATCATGGGCATTCGATATCATTAAACATGGATAGTGAATTTTTGCATGGCTTTA
ATGATATTGCTTCATCAATAAAAATTCCGAAAGGGTGGCAAGTTACTTTATTTGAACATGGCGGATATACTGGTTCTTCT
ATTGTAGCTAATAGTGATATTAAGGCATTAGGAGAGAAGAATCTGAATGATACGGTAAGTTCTTTGATGGTTGAGTATGT
CGGTGATGATCCTTCCGAACTCTATGACATGTTATTGTTGACCATCAATTATGGTAACCTCTCAGGTATAGATTTTTCTC
GCGAAATTTTTAATAAAAATAAGGATATTATAGTTGACTATAAAAAGGGTACCATTAACCATAGAGGTATTACTGGTGGA
TTTTTGGGGAAGACTTTTGCTCAAGTTGCAGCCATTTTGTATCAAAAATCTATTGAGGAGCTCAGCTATATTGAGTTACT
GAGTACTAAAAATGCATTAGAAAGTATTGGTATTGACACCGTATACCCTTATGGCAGTATGGATAATATAAAAGCAAGTC
TATTCTTGAGGGTCAACAATAATCTATCAAAAAGGTTACTTCCTGAAGAGGTCGGTATTGGATCTGAGCCATTTATTATT
GATGAATTATTGGCAAGAAATAATCAATTAACAATGTTTAACTTTTCTAATGCATTAGATAAGCTTACTGAAGATATTTA
TTCTAATGCTAATTTATATCGTTCAGATAATGTTGTAAGACTCTATGCTGATCATAACTATACAGGTCACTATATAGATA
TTGAAAATTCGACGAAATTCCTACATGGATTTAATGATACACTTTCGTCTTGGACTATCCCACATGGCTGGTCTGTACGA
TTTTATGAACATGGTGACTATCAAGGACGTTATTGGACAAGAGATGCTTCTGGAAATGAATCAGGATTTAATGATGTAAT
TAGCTCTATTGAGATATTGAAAAAAACATCTGGGATAAAAGGTAGCTTAATACGTAATGAGCTTGAATCATTAAAAAATA
GCTACAGAGAAATAGATAAATTTCAAGTAATTGTCGGTTATGAAAATGAAACACCAATTTATGCCCTTCCTTTAACTGAT
GAGCTTTTTGCTAAAGCTCAGCTGTACAGTTATGGATTAGATGCCAACTTTGTTGACAAACACTGGAAGTCATACCTAAA
AAAAGGCCGCTTGTCTCTTATCCCCGGGGTTCGTGTAGGGAAGGATATTCTTAAAAAGGATGCTGCTGCATTAGGAGGAG
ATGTAACAACAAAAGGTGCACAAGATTTATGGAGAAGAAAATACCAAGAAATCAGCCAAGTTATGGCAAAGTATATTGCA
ACTCTTATTTCATTTAAAGCAAAGCTAGAGGGAAAAGAATCATGGGATATTCAATCTGAAAATAAAAATCGTTCAGTTAG
ATTTAATTTTGGATTCGGAATTACATATTATAATATGGGTAATAATGGTAAAGCCCATTCAAGATATGAAAATATTCCAA
CTCAAAGCTGGGTCATGACGGGTAAGGATATAAGTTATTCGGTTACGACACCTGGTGATTTGTTGAGCCTGTTCAGTCTT
AATAATTTTAAAGTGATAGAACCTATCGATTTTAATTCAGGCTCGAATAATTATCCACTTTATCAATTGATGAACTCCGA
TTACGCCGATAAGTGTTCATATTATCAAGATGGATGGTATCCTCGGTGGAATGTGTGTGATACAAAATTTATAACGAGAA
ATAAAAAATCATATAATACAAAAGACATCATGTCATATGGATGGCAAGAGTTTCTAAATTTTAAAATGAACGATTTGAAG
ACTGTACAAACAGATAGAGATATAGCATATCAAGTATTGATGGCGATTCTTCCTGTATGGGGAACTGTTGAAGATATTAA
ATCGGGTGATGCAGGAATGGCAACCCTTGGTGTGTTAGGTGACGTAATGTTTTTTTTACCCATAGCAAAAAGTGTTTCTA
GTATCGGAAAACTATCTGCTAAAGCTGCGTCGTCTAAACTACTACCGAGAAATGTTAAGTTTGTTAGAAATGTCATTGGC
CTAAACAAACAAGGTAAGTATTCATTAACATCATCGCAAGCTGATAGAGCTTTCTATAAATTAAAAATACAAGGAAAACT
AAAGGAACTCCCTAAAGTTATATTAAATGAACTTAATCCTATCGCAGGTTTGGATCAGCTCGTTGTTACAGGGACAAGTA
AATTATATAAAAAATATTCATCGCGGGTTAGTATACCTAAAAAAAATATAATAGGTGATAACTCAGTTGTGTTTTACGAT
GATTTAAAGTTTAAATCAGAGGTGTTTTCAGTATCATATTTAGATGATGGTTATTTAATTATTAATAATCAATATCGAGC
TGTTTATATTGATGGTAACTACTATAGGGTCGAATATGATCCAATACTACGTGCTAATTTTATTTATGAACAAAATAGTG
GGAGAAGGATAGAAATTATTAAAGATAAAAATGGCAATTGGTCTATTAAAGAAATTAATAATGGGATTTGTCCACTTGTT
TCGTTAATGAATAATACTAAAGTATGTCATTTCACCAACATTGATGATGCATTAATAAGTATGGGGTTTGACCCAAAAAC
CAGAACAGCATCAGGATTATTGGAGTTGATTAATGGTCGATATGGACCTGATATTAAAGAATACTTATTAAAATTAAATT
CTTCGCTATCTCTTAATTATAATATCGATATAGATACTCTAAATTGGGTTTTCGATACTATAGAAAATTCTGGCATGTCT
AGATATGCATTTACTCCATTTGTAAAAAATACTGATGCCATCATGTATGATATGCTAGGTAAGTTTTATAATAATAACAT
GAGTATTAAACCTGTTTTTTTGAACAAATCGCAGTACAAAAAATTAAAAAAAACTTTAGACTCTGATAAAGAATTAATTA
TAAATGTAATTTCAGAACAAAGGAAAATTAATCTAAATGAGGCACAGCAGCTCTTCGATGAATTTTATGCTTCTGTTACG
AAAGATCCTATTTTTGGTTTGGATTCTATAACACATGATAGACCGGTTATTCATGTCGTCGGACATGGTGATGCTGGTGA
TGAAGTCATCTACCCTGGTGATGCAAGCCATTACTTTTACGCTTTCGAGTTAGCTGATATGCTGAAAAATAAAGGATTAA
AGCCGGATTCAATCATAAAACTTGACTTTTGTTGGAGTGCTTGCTCTCTCAAACCAAGTGATTATTCAAAAACAGAAGTA
CTGACTCGTATGAATAAGGGGGATTACACTCCTTTATTTGGTGACATTGATGATAGCTTTCTGGGGGAGTTTGCTAAAGA
ATTAACGGCAATGTACCCTACATTCCGTGGACCAATAATCGGATACGTAGGGACAGTATTAAACACAATTCAAGATAATG
TGTTAACTTTAGCTAATACACAAGGTCGGTTTCATGCTGTAGAAATGAACTTTTCTGATGGTAAATTTTTTTTCAAGAAA
GAGGATGCAGAAGTTATTTATGGGAGTTATAAAAATAAATGA

Protein sequence :
MFNKKITITSTGITLSIFSFMAKADPKINFAVDYFSYGSNGRCMVAMEIEKSNLNEIYNIINKNHFDIDFEVLLYEKDKN
GKIEKPHGTEMVKFKFNEFDNLVHDHVIVMSKMELPYSWWHECKVLSVNLSDKKYAKVTIYDDFNGDVSFRNIVENNKIS
SFDFFSDIVNMAFAYRMKDEKPTENEILQNISKMKSYNKGKSGNESLNRKIIGYTNTISLGDSGINGSIGFNISEDFIKL
RTKDKINNFIKEKIVKPAVEVGIVDRKFQESKYIDELRQRLLKSLNQDHYFEYGSEKNLQLSLVMMFSDLYSQPILSYGK
TIPAYSDSFFSDLWESMLSGFINSIEPVKLYEHESYHGHSISLNMDSEFLHGFNDIASSIKIPKGWQVTLFEHGGYTGSS
IVANSDIKALGEKNLNDTVSSLMVEYVGDDPSELYDMLLLTINYGNLSGIDFSREIFNKNKDIIVDYKKGTINHRGITGG
FLGKTFAQVAAILYQKSIEELSYIELLSTKNALESIGIDTVYPYGSMDNIKASLFLRVNNNLSKRLLPEEVGIGSEPFII
DELLARNNQLTMFNFSNALDKLTEDIYSNANLYRSDNVVRLYADHNYTGHYIDIENSTKFLHGFNDTLSSWTIPHGWSVR
FYEHGDYQGRYWTRDASGNESGFNDVISSIEILKKTSGIKGSLIRNELESLKNSYREIDKFQVIVGYENETPIYALPLTD
ELFAKAQLYSYGLDANFVDKHWKSYLKKGRLSLIPGVRVGKDILKKDAAALGGDVTTKGAQDLWRRKYQEISQVMAKYIA
TLISFKAKLEGKESWDIQSENKNRSVRFNFGFGITYYNMGNNGKAHSRYENIPTQSWVMTGKDISYSVTTPGDLLSLFSL
NNFKVIEPIDFNSGSNNYPLYQLMNSDYADKCSYYQDGWYPRWNVCDTKFITRNKKSYNTKDIMSYGWQEFLNFKMNDLK
TVQTDRDIAYQVLMAILPVWGTVEDIKSGDAGMATLGVLGDVMFFLPIAKSVSSIGKLSAKAASSKLLPRNVKFVRNVIG
LNKQGKYSLTSSQADRAFYKLKIQGKLKELPKVILNELNPIAGLDQLVVTGTSKLYKKYSSRVSIPKKNIIGDNSVVFYD
DLKFKSEVFSVSYLDDGYLIINNQYRAVYIDGNYYRVEYDPILRANFIYEQNSGRRIEIIKDKNGNWSIKEINNGICPLV
SLMNNTKVCHFTNIDDALISMGFDPKTRTASGLLELINGRYGPDIKEYLLKLNSSLSLNYNIDIDTLNWVFDTIENSGMS
RYAFTPFVKNTDAIMYDMLGKFYNNNMSIKPVFLNKSQYKKLKKTLDSDKELIINVISEQRKINLNEAQQLFDEFYASVT
KDPIFGLDSITHDRPVIHVVGHGDAGDEVIYPGDASHYFYAFELADMLKNKGLKPDSIIKLDFCWSACSLKPSDYSKTEV
LTRMNKGDYTPLFGDIDDSFLGEFAKELTAMYPTFRGPIIGYVGTVLNTIQDNVLTLANTQGRFHAVEMNFSDGKFFFKK
EDAEVIYGSYKNK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAC12276.1 putative inner membrane protein Not tested VPI Protein 0.0 100
unnamed AAK20779.1 putative inner membrane protein Not tested VPI Protein 0.0 100