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Name : potB (CLM_0666) Accession : YP_002802905.1 Strain : Clostridium botulinum Kyoto Genome accession: NC_012563 Putative virulence/resistance : Unknown Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG1176 EC number : - Position : 722325 - 723284 bp Length : 960 bp Strand : + Note : identified by similarity to SP:P0AFK4; match to protein family HMM PF00528 DNA sequence : ATGTGGGGGAAATTTAGCAGTGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTATTTTAGA AGACAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGCTCA TTACATTTTTTATTGTACCTTTACTTCTTGTATTAGTGGTTAGTTTTCTATCAAGAGGTGAATACGGAGATGTAAGATTA CCTTTTACGCTAAAAAATTATAAAAGACTCATGGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATAATTTCTAT TAGTACTACTTTAGGGTGTTTGATCATAGGTTATCCCTTTGCATATTTTATTGGAAGATCAGATAAAAAACATAGAGGAA TACTATTATTATTAGTTATACTACCTTTTTGGACTAATTCTTTAGTTCGAACTTATGCATGGATAATACTTTTAAAAACA GAGGGAGTAATTAACACATATCTTATGAAATTTGGATTAATTCACTCTCCATTGCAAATGCTTTATACAGATGGTGCTGT ATTTATAGGAATGCTTTATATAATGTTACCTTTTATGGTGCTACCTATTTATACATCTATAGAAAAATTAGATATGAGTT ATATAGAAGCTGCCAATGATCTTGGAGCATCGCCTTTTAAAACCTTTAAAGAAATAACATTGCCTTTAACTCTATCGGGT ATTATAGCAGGATGTATGCTTGTATTTATACCAACTTTAGGTTATTTCTTCATATCTGATTTAATGGGTGGAAGTAAAAC TATGTTAATTTCAAATCTAATCAAAAATCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCAGCTATAGCAGTAATAT TAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAGGTTTTTATTTTAAAGGAAATAAACCAAAGAAGGGGATAAAGGAGGTTAGCTAA Protein sequence : MWGKFSSAFSNIFKKQLHNKNTDIILEDKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVRL PFTLKNYKRLMDPMYGQILIKTLIISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSDKKHRGILLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLKT EGVINTYLMKFGLIHSPLQMLYTDGAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYIEAANDLGASPFKTFKEITLPLTLSG IIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAIGFYFKGNKPKKGIKEVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| potB | BAA36746.1 | - | Not tested | LIM | Protein | 4e-53 | 52 |
