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Name : treC (CLM_2205) Accession : YP_002804377.1 Strain : Clostridium botulinum Kyoto Genome accession: NC_012563 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2271774 - 2273441 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTAGTCTATCAAATCTACCCAAAATCCTTTAATGATACTAATGGTGATGGATTGGGAGA TTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTGGATTATTTAAAAACATTAGGTATAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATCT CCCCTCAAAGGGATAATGGATATGATGTAGCGGATTATTGCAATATTGATCCTCTATTTGGTACCATGGAAGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGCGGCGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAGAACCTAAAGATGGACAGCTCC CTACTAACTGGAAATCTAAATTTGGAGGTCCCGCTTGGGAATATGTTAAAGAGCTTGATGAATATTACCTACATTTATTT GATGCTACTCAAGCAGACCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAACAGAAGTTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAA AAAAGGTGTAAAAGGCTTTCGCTTCGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCAATGGAATATAAGGATGACAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACAGATGGTCCTAATATTCATAACCATATAAAGCAACTAAATAAAAAAACCTTTGGCAGATAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAAATCCTAAAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGAATTTTGATT TTATAAAATTAAAAAATATCTTTAATCATTGGCAGGCTGGAATGGAAGAAGGTAATGGCTGGAATGCAGTATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGCTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATTTACTTAGAGGGACTCCTTATATTTATCAGGGAGAAGAAATCGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAGGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAGTCTGAAGGTAAAACTGAAGAAGAAATAATT AAAATTTTACAGGCAAAATCAAGAGATAATTCCCGTAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAAACAATGCTGGTTTTACTAA AGAAGATCCTTGGATAAAAGTATGCAAAAACTATAAAGATATCAATGTAGAAAATTCCTTAAAAGATAAAGATTCAGTTT TTTATCATTATCAAAAACTGATTAAGTTAAGAAAGGAATATGATATTATATCTTATGGAAATTTTGAATTAATACTAAAA GAAGACAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAACTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTTTATGGAAAAGA AATCTTATTTAAATCGCCTATAGAATTTAAATTAGGTGAATATAAAAACAAAATTTTAATTTCTAATTATAAGGATTCCC CTATAGACTTTAGAAAAATTAATTTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNGDGLGDLKGITVKLDYLKTLGIDYIWLTPFYISPQRDNGYDVADYCNIDPLFGTMEDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSGDKKYKNYYIFKEPKDGQLPTNWKSKFGGPAWEYVKELDEYYLHLF DATQADLNWENEEVRTEVFDIVNFWIKKGVKGFRFDVINLISKPMEYKDDNNGDGRSFYTDGPNIHNHIKQLNKKTFGRY KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSNPKEEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMNFDFIKLKNIFNHWQAGMEEGNGWNAVFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYRDVESINFYNILKSEGKTEEEII KILQAKSRDNSRSPMQWDNSNNAGFTKEDPWIKVCKNYKDINVENSLKDKDSVFYHYQKLIKLRKEYDIISYGNFELILK EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKEILFKSPIEFKLGEYKNKILISNYKDSPIDFRKINLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-128 | 48 |
