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Name : ctaD (BCA_4048) Accession : YP_002751303.1 Strain : Bacillus cereus 03BB102 Genome accession: NC_012472 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase, subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 3807207 - 3809069 bp Length : 1863 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00115; match to protein family HMM TIGR02891 DNA sequence : GTGAGTTCTGTAGCAAAAAAACAGGGGATGGGTGCTGTCATATGGGATTATTTAACGACAGTAGACCATAAAAAGATTGC CATTCTCTATTTAATTGCAGGTGGATTGTTTTTTGTAATAGGCGGAATAGAAGCTCTATTTATTCGCCTTCAATTAGCGA TTCCTAACAACGCTTTTCTTGTTGGGGATGCTTATAATCAAGTATTAACCATGCACGGTACAACAATGATTTTCCTCGCA GCTATGCCACTCGTGTTTGCATTTATGAACGCCGCTGTACCACTTCAAATTGGTGCACGTGATGTAGCGTTCCCGTTTTT GAATTCGCTCGGATTTTGGTTATTTTTCTTTGGTGGAGTATTTTTAAATTTAAGTTGGTTTTTAGGTGGAGCACCTGATG CAGGATGGACATCTTATGCATCTTTAGCTTTAGCCTCTAAAGGCCATGGTGTTGATTTTTATGTACTCGGCTTGCAAATC TCCGGTATAGGTACATTAATTGGAGGCATCAACTTCCTTGTAACCATTATTAATATGCGTGCGCCAGGAATGACGTATAT GCGTATGCCGATGTTTACATGGACGACATTTGTAACATCTTCGTTAATATTATTTGCTTTTCCGCCGTTAACTGTCGGAT TAGGACTTTTAATGTTAGATCGCTTATTTGGAACAAGTTTCTTTAATCCAGCGCTGGGCGGGAATACAATTATATGGGAG CATTTATTCTGGATTTTTGGTCATCCAGAAGTATACATTCTTATACTCCCAGCTTTCGGAATATTCTCAGAAATCTTCGC TACATTTTCGAAAAAACGATTATTTGGTTATTCGTCGATGGTGTTTGCGACAGTATTAATTGGATTTTTAGGATTTATGG TATGGGCGCATCATATGTTTACTGTTGGACTTGGTCCAGTTGCCAATGCTATTTTCTCAGTTGCAACAATGGCTATTGCG GTTCCGACCGGTATTAAAATATTCAACTGGCTCTTTACAATGTGGGGCGGAAGTATTCGCTTTACGACACCTATGATGTG GGCAGTAGCCTTCATTCCATCATTCGTAATGGGAGGAGTTACAGGTGTTATGCTAGCATCTGCACCAGCTGATTATCAAT TTCATGATAACTATTTCGTAGTAGCTCATTTTCATTATGTAATCGTCGGCGGTGTTGTATTTGGTCTACTTGCAGGAGCG CATTATTATTGGCCACTGATGTTTAATAAAATATTGAATGAGACATTAGGAAAGATAACATTTTGGTTATTCTTTATCGG TTTCCATTTAACGTTCTTCATTCAGCATTTTCTTGGTTTAATTGGTATGCCGCGTCGTTACTACACATACCTTGAGGGAC AAGGATTAGAGATGGGGAATATGATTAGTTCTATTGGAGCGATATTTATGGCTCTTGGAACGATTGTTCTTTTATTCAAT GTCATTAAAACGACAGTTTCAAAAGAAAAGGCAGGGCGTGATCCATGGGATGCTCGTACATTAGAATGGACAATGCCAGC GCCTACACCGGAATATAACTTTAAACAATTGCCATTTGTTCGCGGATTGGATCCGTTTTGGATTGAAAAACGCGAAGGGA ATAAAGAGATGACAGCGGCAGAACCAGTTGGTGATATTCATATGCCAAATGCATCATTTTCACCATTTATCATTTCTTTA GGATTGTTTATAGCGGCATTTGGTGCAATGTATATGCAAGGTGGAAAAGATAAGTTTTGGTTATTAGTAGCAATTATTGG TTTAATCATTACGTTTGGTGCAATGTTCCTGCGTTCAGTAATCGATGATCATGGATATCATATTCATAAGGAAGATTTAG AAGATAAGGGGGGCAAGGCGTAA Protein sequence : MSSVAKKQGMGAVIWDYLTTVDHKKIAILYLIAGGLFFVIGGIEALFIRLQLAIPNNAFLVGDAYNQVLTMHGTTMIFLA AMPLVFAFMNAAVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFFFGGVFLNLSWFLGGAPDAGWTSYASLALASKGHGVDFYVLGLQI SGIGTLIGGINFLVTIINMRAPGMTYMRMPMFTWTTFVTSSLILFAFPPLTVGLGLLMLDRLFGTSFFNPALGGNTIIWE HLFWIFGHPEVYILILPAFGIFSEIFATFSKKRLFGYSSMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGLGPVANAIFSVATMAIA VPTGIKIFNWLFTMWGGSIRFTTPMMWAVAFIPSFVMGGVTGVMLASAPADYQFHDNYFVVAHFHYVIVGGVVFGLLAGA HYYWPLMFNKILNETLGKITFWLFFIGFHLTFFIQHFLGLIGMPRRYYTYLEGQGLEMGNMISSIGAIFMALGTIVLLFN VIKTTVSKEKAGRDPWDARTLEWTMPAPTPEYNFKQLPFVRGLDPFWIEKREGNKEMTAAEPVGDIHMPNASFSPFIISL GLFIAAFGAMYMQGGKDKFWLLVAIIGLIITFGAMFLRSVIDDHGYHIHKEDLEDKGGKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 4e-92 | 50 |
