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Name : treA (BHWA1_00502) Accession : YP_002720683.1 Strain : Brachyspira hyodysenteriae WA1 Genome accession: NC_012225 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 593943 - 595607 bp Length : 1665 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATTTTAAAAATAAAGTTGTTTATCAAATATATCCGAAATCTTTTATGGACAGTAATAATGACGGACTAGGAGATAT AAAAGGAATAATATCAAAATTAGACTATTTACAAAATTTAGGTGTAGATATTATTTGGAGTACTCCTTTCTTTGTTTCTC CTCAAAAAGATAATGGATACGATGTTGCTGATTATTATAATATAGATCCTTCTTATGGAACTATGGAAGATGTTGAAGAA CTTATAAAAGAAGCTAAAAAAAGAAATATAGATATAATGTTTGATATGGTATTCAATCATACTTCTACAGAGCATGAATG GTTTAAGAAGGCTATGAATGGAGAAGAAAAATATAAGAATTATTATATATTCAAAAAGGGCAGAGTAGTTAACGGAAAAA AAGAACCTCCTACAAATTGGGTATCTAAATTCGGAGGCAATGCTTGGCAATATGTAGAAAAATTTGATGAATATTATTTG CATTTATTCGATGTTAGTCAAGCTGATTTGAATTGGGATAATGAAGAAGTAAGAAAAGAACTTTTTGATATAGTTAACTT CTGGATAAAAAAAGGAGTTTACGGATTCAGATTTGATGTTATAAACCTTATATCAAAGCCTGAAGTTTTTGAAGATGATT TTGAAGGAGACGGAAGACGTTTCTATACTGACGGAATAAATATACATAAATATTTGAAAGAGTTAAATAAAAATACTTTC GGAAAATATGATAATGCTATCACAGTAGGTGAGATGTCATCAACAAGCATAGAAAACTGCATTAAATATTCAGGTGAAAA AGAAAATGAACTTAGTATGGTATTTAGTTTTCATCATTTGAAAGTTGATTATAAAAATAATGATAAATGGCAGTTAATGG ATTTTGATTTTCAAGAGTTAAAAAATATTTTATTCTCTTGGCAGGAAGGAATGCAGGATAATAATGCATGGTCAGCTTTA TTTTGGTGCAATCATGATCAGCCTAGAATAGTATCAAGATTCGGAGATGATAAAAAATATCATAAAGAATCTGCTAAAAT GCTAGCTACAGTTATGCATTGTTTGAGAGGTACTCCTTATATTTATCAAGGTGAAGAAATAGGTATGACTAATGCTTATT TTGATAATATCAATCAATATAAAGATGTTGAATCAATAAACTATTTTAATATACTTAAAAATAATGGTATAGAAGAAAAA GAAATATATAAAATACTTCAAAGTAGATCAAGAGATAATTCTAGAACTCCTATGCAATGGAATGACAAAGAGAATGCAGG ATTTTCAAATGCTAAGCCTTGGATAGAAGTTATTTATAATTATAAAGAGATTAATGCAGACAATAATATTAAAGATGAAA ACTCTATATTTAATCATTATAAAAAATTAATAAAATTAAGAAAAGATTATAAAGTTATTTCAGAAGGTAAAACTATACCT ATACTAAAAGATGATAAAAATGTATTTGCTTTTATAAGAGAATATAACAATGAAAAACTTTTAGTAATAAATAATTTTTA TGGTAATGAGTGCACTATAGATTTAAGCAATATTGATTTCGACATAAAAAAATCAAAATGCATTCTTTCAAATTATGATG ATGCAGAACTTAATAATATTTTAAATTTAAAACCTTATGAGTCTATAGTATTATATAACAATTAA Protein sequence : MNFKNKVVYQIYPKSFMDSNNDGLGDIKGIISKLDYLQNLGVDIIWSTPFFVSPQKDNGYDVADYYNIDPSYGTMEDVEE LIKEAKKRNIDIMFDMVFNHTSTEHEWFKKAMNGEEKYKNYYIFKKGRVVNGKKEPPTNWVSKFGGNAWQYVEKFDEYYL HLFDVSQADLNWDNEEVRKELFDIVNFWIKKGVYGFRFDVINLISKPEVFEDDFEGDGRRFYTDGINIHKYLKELNKNTF GKYDNAITVGEMSSTSIENCIKYSGEKENELSMVFSFHHLKVDYKNNDKWQLMDFDFQELKNILFSWQEGMQDNNAWSAL FWCNHDQPRIVSRFGDDKKYHKESAKMLATVMHCLRGTPYIYQGEEIGMTNAYFDNINQYKDVESINYFNILKNNGIEEK EIYKILQSRSRDNSRTPMQWNDKENAGFSNAKPWIEVIYNYKEINADNNIKDENSIFNHYKKLIKLRKDYKVISEGKTIP ILKDDKNVFAFIREYNNEKLLVINNFYGNECTIDLSNIDFDIKKSKCILSNYDDAELNNILNLKPYESIVLYNN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 5e-119 | 47 |
