Name : cdu2 (BHWA1_01437) Accession : YP_002721613.1 Strain : Brachyspira hyodysenteriae WA1 Genome accession: NC_012225 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Na(+)/H(+) antiporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0025 EC number : - Position : 1655965 - 1657155 bp Length : 1191 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTTCTCAGTTTAGCTTTGATATTTTTATGCGGAATGATACTCGGAAAAATATTCTCAACTTTAAAACTTCCTTCTCT TTTAGGACTTATAATCACAGGTATAATACTAGGTCCATACTGCTTTAATTTGCTTGATAATTCAATACTTTCAATATCAG CAGATTTAAGAGAATTAGCACTAATAATAATATTAACACGTGCCGGACTTAATCTTGATATAGAAGATTTAAAAAAGGTA GGTAGACCTGCAATACTTATGTGCTTTGTTCCTGCAACATTTGAAATAATAGGAATGATTTTAGTGGCTCCAAAACTTTT TGATATAAGTTTATTGGATGCTGCTTTAATGGGTTCTGTTGTTGCTGCTGTATCCCCTGCTGTGCTTGTACCTAAGATGC TTAAACTCATAGATGAAAAATACGGTACTAATAAAAGCATACCTCAATTACTAATGGCAGGAGCTTCCGTTGATGATATA TTTGTAATAGTATTATTTACATCTTTTACTTCTCTTGTAAAAGGAGGAAGTATATCCTATCTTGATTTTATAAAAATACC TACTTCAATTATATTTGGGCTTTTGTTGGGAATTATTATTGGTTTTATATTATCTAAATTCTTTACTAGATTTCATATAA GAGACAGTGCTAAAGTAGTGATAATACTAAGCATATCATTTATACTTATAAGCATAGAAAATTCAATATCAAATTTATTC GGCGGTATTATAGGAATATCAGGACTTTTAGCCGTTATGAGTATAGGAGCATATCTAAAAAAATCAAAAGAAGAATTATC AAAAAGACTTTCTTTAAAATATTCTAAACTTTGGGTAGCTGCTGAAATTATGCTTTTCGTACTTGTAGGTGCTGCTGTAA ATATTAATTATGCTATGAAAGCAGGTGCATTAGGAATTATATTGATATTTACTGTTTTGATATTCAGAATGTTTGGGGTG CTTGTATCATTAATAAAAACTAAACTAAATAAAAAAGAGAGAATATTTAGTATGATAGCATATTGTCCTAAAGCAACAGT TCAGGCTGCAATAGGTTCAATTCCTTTATCATTAGGTTTTGCTTCAGGAGAGATTATACTTGTTATAGCAGTTCTTGCCA TACTTATAACAGCCCCATTAGGAGCTTTTGCCATAGATGCTACCTATAAAAAATTATTAGTGCATGAATAA Protein sequence : MLLSLALIFLCGMILGKIFSTLKLPSLLGLIITGIILGPYCFNLLDNSILSISADLRELALIIILTRAGLNLDIEDLKKV GRPAILMCFVPATFEIIGMILVAPKLFDISLLDAALMGSVVAAVSPAVLVPKMLKLIDEKYGTNKSIPQLLMAGASVDDI FVIVLFTSFTSLVKGGSISYLDFIKIPTSIIFGLLLGIIIGFILSKFFTRFHIRDSAKVVIILSISFILISIENSISNLF GGIIGISGLLAVMSIGAYLKKSKEELSKRLSLKYSKLWVAAEIMLFVLVGAAVNINYAMKAGALGIILIFTVLIFRMFGV LVSLIKTKLNKKERIFSMIAYCPKATVQAAIGSIPLSLGFASGEIILVIAVLAILITAPLGAFAIDATYKKLLVHE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cdu2 | CAA63558.1 | - | Not tested | PaLoc | Protein | 2e-60 | 64 |