Name : wzs (HAPS_0051) Accession : YP_002474704.1 Strain : Haemophilus parasuis SH0165 Genome accession: NC_011852 Putative virulence/resistance : Unknown Product : tyrosine kinase, chain length regulator in capsular polysaccharide biosynthesis Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : - Position : 61928 - 64015 bp Length : 2088 bp Strand : + Note : COG:M;COG3206 DNA sequence : ATGAATGAAAATAATCATGATGAAATTGATTTAGTAAAGTTGTTGGGGGCTTTATTAGATTATAAGTGGTGGATAGCTCT TTTTACATTGTTGGTGACGTTATTTAGTGTTGCTTATGTTTTACTAGCTCCGCCTGTTTACACTGCGAATGCTTCAATTC AAGTAGAAAGTAAATCTTCAAGGGGGCTTTTAAACGATTTCCCAGGAGTTTTAGAGGGTGAATCATCTTCAAGTACTGAA ATTGCAATTTTAAAATCAAGAATGGTTTTATCTAATACTGTTGAGCAACTTAATTTAACTACGGTAGTTGAACCTCAATT CTCGATCCCTTTTCTTAGTAAAGGTCTTCATCGTTTGATGGGATATGAACCACAATTGTCGCTCTCTTTATTTGAGCCTA AGAATCCTCAGATGAAAGAGATGATTTTGGAGGTTGGGGAGAATGCTGGAGAGTTCTCATTATTTTTCGCAGATGAAAAA GTTCTTGAAGGGAGCATTGGGAAAAAGTATCAAACGGAAGATTTTTCGTTTGCGATTTCTGAATTAGAGGCTAAGCCAGG ACAATTATTTAAAATTAAAAAGAATGATGTGTTGTTAGCAATTAACTCTTTACAAAAACAAATTTCGGTAACAGAGAGTG GTAAGCAGACAGGCATTATTGAAATTTCTATTAATGGAGAGAATAAAGCTCAAATTAAGAAGATAGTAAAGAGTGTATCT GAAAATTATTTGCTGCAAAATATTGTTCGTGATTCTGCAGAAGCGTCTAAGAGTTTAGAGTTTTTGTCTAAACAATTACC AGAACTTAAAGCTCGTTTGGCAGAGTCTGAGAATAATTTGAATGAATTCCGCTTAAAAAATGAATCAGTAGATCTCAGTC TAGAAGCTAAATCAGCATTAGATACTATAGTTCAGTTAGAAGCAGATTTAAATGAGTTAACATTAAAGGAGAGTGAAATT TCTCAGAAGTTCACTCGAAATCACCCTGCTTATGTTGCTTTGATTGATAAGCGTAAAGTATTAAATGAGGAAAAAATTCG TTTAAATAAACAAGTAGAACGTTTACCTAATACTCAAAAAGAGGTTATTCGGTTAACTCGAGATTTGGAGGTAAACCAGC AAATTTATATTCAATTGTTGAATAAAATGCAAGAGTTAGAAATTGTTAAGGCTAGTACGGTAGGAAATGTTCGTATTTTA GATGAGGCGCAAGTTTTGCCTAATGCCGTTTCACCTAGAAAAATGATTGTGGTTGCCTCGGCATTTATGTTAGGACTTAT CTTTGCCTCAGTTACTGCGATAGCGAAAACGCTACTGCATAGAGGTATTGAGGGAACATCTGAATTAGATGTGTTAGGCT TGCCAACGTATGCTACGATTCCATATTCAAATGAACAGCCTATTTTTTCTAAGCATAAGGTTCAGCATTTTAAATTATTG TCGGAGTCAACGCCTACAGATCCAGCAGTTGAGGCTTTGCGTAGTTTGCGTACAAGTTTGCATTTTGCAATGTTAGAAGC TAAAAATAATATATTAATGATTTCTGGAGCTTCTCCGTCTGTGGGAAAAAGTTTTATTTCAACCAATTTGGCTAATGTTC TTGCTAAAGCTGGGCACAAGGTGTTGTTAATTGATGCAGATTTAAGAAGGAGTTATTTGCGTCGATTATTAGGTTTAGCA AAAGGGGTTGGATTGAGTGATGTGATTGCACAGCAGATTCCTTTTGAACAAGTGATTCAACATTATGATAATTTTGATAT TATTGTTAAAGGAGAAACTCCACCAAATCCATCTGAATTACTATCTAATGCTCGTTTTCAGGCACTATTAGAATGGGCGG CAAAAGAATATGATTTAGTGATAGTGGATACAGCGCCTATTTTGGCTGTTACAGATGCAGCTATTATTGGTAGGTATGCA GGAACATCTTTACTTGTTGGGCGTTTTGGTGAAACTACACTTAAAGAAGTTGGATTAGCTAAAGAACGTTTTGAACGTGC AGGGGTCTTTATTAAAGGTTTTATTTTGAATGGTATAAAACGTAAGGCTTCTAATCGTTATGATTATTATCAATATGATT ACAAATAG Protein sequence : MNENNHDEIDLVKLLGALLDYKWWIALFTLLVTLFSVAYVLLAPPVYTANASIQVESKSSRGLLNDFPGVLEGESSSSTE IAILKSRMVLSNTVEQLNLTTVVEPQFSIPFLSKGLHRLMGYEPQLSLSLFEPKNPQMKEMILEVGENAGEFSLFFADEK VLEGSIGKKYQTEDFSFAISELEAKPGQLFKIKKNDVLLAINSLQKQISVTESGKQTGIIEISINGENKAQIKKIVKSVS ENYLLQNIVRDSAEASKSLEFLSKQLPELKARLAESENNLNEFRLKNESVDLSLEAKSALDTIVQLEADLNELTLKESEI SQKFTRNHPAYVALIDKRKVLNEEKIRLNKQVERLPNTQKEVIRLTRDLEVNQQIYIQLLNKMQELEIVKASTVGNVRIL DEAQVLPNAVSPRKMIVVASAFMLGLIFASVTAIAKTLLHRGIEGTSELDVLGLPTYATIPYSNEQPIFSKHKVQHFKLL SESTPTDPAVEALRSLRTSLHFAMLEAKNNILMISGASPSVGKSFISTNLANVLAKAGHKVLLIDADLRRSYLRRLLGLA KGVGLSDVIAQQIPFEQVIQHYDNFDIIVKGETPPNPSELLSNARFQALLEWAAKEYDLVIVDTAPILAVTDAAIIGRYA GTSLLVGRFGETTLKEVGLAKERFERAGVFIKGFILNGIKRKASNRYDYYQYDYK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 6e-146 | 46 |