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Name : wza (HAPS_0049) Accession : YP_002474702.1 Strain : Haemophilus parasuis SH0165 Genome accession: NC_011852 Putative virulence/resistance : Unknown Product : polysaccharide export protein, periplasmic protein involved in capsular polysaccharide export Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1596 EC number : - Position : 60308 - 61462 bp Length : 1155 bp Strand : + Note : COG:M;COG1596 DNA sequence : ATGTGTAAGTTAACTAAAGCTCTTGTTTTTACTGGTGTGATTTTATCTCTTTCTGGGTGTGGGATGATTTTCCCTGCAAC GCATTCTCCTATTGTTGATACGGAAGTGAGGGGAGAGAATGTGGACTTTAAGAAGGTTGTGGATGCTTATTTAATTACGC CTCAGTTAGTAAAGCAATTAGCTCCTCGTACGGTGAAAGCAAGTGATAACATTGGTTTAGAACAACAAATTAAGCGTTAT CAATATAAGATAGGTGTTGGCGACATATTAAATGTCACAGTTTGGGAGCATCCTGAATTGACAACTCCTGCGGGTGCTTA TCGTTCTGCCGCTGAATCAGGTAATCAAGTGCATGCTAATGGAGCTATCTTTTATCCATATGTTGGGCAGCTTAATGTTG TTGGCTTAACAGTAAATCAAGTTCGTGATAAATTGGCAAAAGCTCTTTCAGCCTATGTCACTGATCCTCAAATTGAGGTA ACAATTGCCTCATACCAATCTAAAAAAGCATATATAACAGGCGAAATCAAGAATCCAGGACAGCAATTTTTAACTAATAT TCCTCTAACTTTGTTAGATGCTGTAAATAAGGCTGGAGGATTGTCTGATAATGCGGATTGGCATAATGTGACTATTACTC GTCATGGCAAAGAGGAGAAAGTCTCTTTAGCAGAATTGATTCAATTTGGTAATTTAACGCAGAATCGTTTGTTATCTGAT GGCGATGTGGTTCATATTCCACGCAATGATGCGAATAAGGTGTTTATTGTGGGGGAAGTGTCAAAACCTCAGATGTTGAA AATTACTCATTATGGTATGACGTTAACTGAAGCAATTGCTCAAAGTGGGGGAATTGATAAATTATCTGCAGATGCAACGG GTATTTTTGTTATTCGTGGTCAACGTGATGTAAATAAGTCAACGGTTTCAAATGAAGCTGAAAAAATAGATAAGATTGCA GATATTTATCAATTGGATTTGACTAATGCAACTTCCTATGTATTAGGAACAGAGTTTTATTTAAAACCTTATGACATTGT TTATGTGACAACAGCGCCAGCAACTCGTTGGAATAGAGTGATTGCCCATGTTGTTCCGTCATTATCTGGTTTCAATAATC TAACAGAGTCTATCTTAAGAGTGAGGAATTGGTAA Protein sequence : MCKLTKALVFTGVILSLSGCGMIFPATHSPIVDTEVRGENVDFKKVVDAYLITPQLVKQLAPRTVKASDNIGLEQQIKRY QYKIGVGDILNVTVWEHPELTTPAGAYRSAAESGNQVHANGAIFYPYVGQLNVVGLTVNQVRDKLAKALSAYVTDPQIEV TIASYQSKKAYITGEIKNPGQQFLTNIPLTLLDAVNKAGGLSDNADWHNVTITRHGKEEKVSLAELIQFGNLTQNRLLSD GDVVHIPRNDANKVFIVGEVSKPQMLKITHYGMTLTEAIAQSGGIDKLSADATGIFVIRGQRDVNKSTVSNEAEKIDKIA DIYQLDLTNATSYVLGTEFYLKPYDIVYVTTAPATRWNRVIAHVVPSLSGFNNLTESILRVRNW |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf39 | AAO18064.1 | Orf39 | Not tested | TTSS locus | Protein | 5e-95 | 50 |
