|
Name : mutS (BUAP5A_422) Accession : YP_002468166.1 Strain : Buchnera aphidicola 5A Genome accession: NC_011833 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 467817 - 470225 bp Length : 2409 bp Strand : - Note : This protein performs the mismatch recognition step during the DNA repair process DNA sequence : ATGAAAAAAAAAAATATTAAGAATAGTATGAACAATCATACTCCAATGATAAAACAGTATTTATCTTTAAAATCACAGTA TCCTGATATGCTTCTTTTTTATCAAATGGGTGATTTTTATGAGTTGTTTTACGAAGATGCAGAACGTATTTCGGAACTAC TGAAAATTACTTTAACAAAAAAAGGATACTCAAATCATAAGATCATACCGATGGCTGGAGTCCCATGCCATAAATCAGAA TATTATTTATCTAAACTTGTAAAATTAGGTGAATCTATTGCGATATGTGATCAACAAAAAGAAACTGATTGTAAAAAAAA ATTAATTTCTCGTAAAGTAGTTCGCATAATCACGCCTGGAACTGTTACAGATGAAGTACTTCTTGAAGAAAATGAAGATA ATTTTATAGCTGCTATCTGGAAAGAAAATAATCAATTTGGATACTCCGTATTAGATTTATCATTAGGTTTTTTTGGTGTA TCTAAGATTTTTTCTTCTTGTGATTTGCTTTCAGAAATTGAACGAACTAATCCTAAAGAAATACTCTATCCGGAAAATTT TTCAGATGTTTTTTTAATTGAAAGTAGAAAGTGTATTAGAAAACGCTCATTATTAGAATTCGATTTAGAGACATCATATA AGTTACTTAATTTGCAATTTAATACTTGTAGTTTGGATGGATTTGGTATAGAGAAAAACAATTTTGTAATACGTGCTGCT GGTTGTTTATTACAATATGTTAAATCAATGAATATGACTGTCTTGCCTAATATTCGTCAGTTAAAATATAATTACATGGA AGATAGCATTTTTATGAATTTTAGTACGCGTAAAAGCTTGGAAATTACTCAAAATATTTCAGGAGAAAAAAAAAATACTT TATCTGCAATATTAAATAAAACAGTTACATCTATGGGTAGTAGAATGTTAAATAGATGGTTAAATTCTCCACTAAAAAAC TTTAAAATAGTTAGAAATCGTCATGAAAGTGTGGAAGCTTTGAAGTTTTTTTATAAAGAATTACAATTTATTTTACGTCA AGTTAATGATTTAGAAAGAATTTATTCTCGTTTAGCTTTACGTACTGCTTCGCCTCATGATTTCGTACGAATGCGTTCTA CATTAGAAATCTTACCTAATTTACATTTAATATTAAAAAAAATAAAATCAAAACATATAAAAAAAATACGTTTATCTATT GGTTATTTTGAAGAAGTTTTATGTTTATTAAAAAAAGCAATTAGTTTGAAGCCATCTAAATGTATTCGAGATGGTGGTGT AATAGCAGAATTATATAATATTGAACTTGATGAGTTACGATCTATTAAAATAAATTCCAAAGAATATATTAAAAATTTTG AACAGAAAGAAAAAAAAAAATTAATGATTGAATCATTTAAGATAAAATTTAATAAAATTATTGGGTATTATATTCAAATA AGCAAACGTCATACTCATTTAATTCCAAAATATTATGTCATAATACAAACATTAAAAAATACAGAACGTTATAGTGTTCC TTTATTAAAAGAATATGAAGAAAAAGTTTTAAATTCAGAAATGCGATCTTTATTACTAGAAAAAAAATTGTATGCAGAAA TTTTTAATATTATTGAACCTTTTTTAGAAAAATTACAAAATAGTGCATTAGCATTGTCAGAATTAGATGTGTTAGTAAAT TTATCTGAACGTGCTATATCTCTAAATTATACGCGTCCTATTATGAGCGAAAAATATGGAATTTCTTTACTAGAAAGTCG TCATCCAGTTGTTGAATGTTTTTTAAAAACACCATTTATAAAAAATTCTGTTTTTTTATCCAGAACACAAAGAATGATCA TTATAACAGGTCCTAATATGGGTGGAAAAAGTACATACATGCGTCAAATTGCACTCATTGTAATTATGGCCGGTATAGGT AGTTTTGTTCCTGCTAGATATGCTTTAATTGGTTCGATTGATAAAATTTTTACAAGAATAGGTTCTGCAGATGACTTAAG CAATGGATATTCAACATTTATGATGGAAATGATGGAAATATCTAATATTCTACACAATGCAACATCTAATAGTTTAGTTT TAATCGATGAATTAGGAAGAGGAACTTCAACTAATGAGGGTTTATCTTTAGCTTGGTCGTGTTCTAGGTATTTAATAAAC ATAAATAAATCTATGACGTTATTATCTACTCATTTTGTTGAATTAACAAAATTAGAAGAAAAAGAAAAATTTGTAAAAAA TTTTCATTTTTCTGCTATTAAAAGCGATTTACATATAGCTTTTTTATATAAAATTAAAAATGGTATATCAAAAAAAAGTT ATGGTATATCAGTAGCTTCATTGTCTGGATTACCAGATTCTGTTCTAGAAGACGCAGAGAAAAAATTAATAGAAATAGAA AATACATAA Protein sequence : MKKKNIKNSMNNHTPMIKQYLSLKSQYPDMLLFYQMGDFYELFYEDAERISELLKITLTKKGYSNHKIIPMAGVPCHKSE YYLSKLVKLGESIAICDQQKETDCKKKLISRKVVRIITPGTVTDEVLLEENEDNFIAAIWKENNQFGYSVLDLSLGFFGV SKIFSSCDLLSEIERTNPKEILYPENFSDVFLIESRKCIRKRSLLEFDLETSYKLLNLQFNTCSLDGFGIEKNNFVIRAA GCLLQYVKSMNMTVLPNIRQLKYNYMEDSIFMNFSTRKSLEITQNISGEKKNTLSAILNKTVTSMGSRMLNRWLNSPLKN FKIVRNRHESVEALKFFYKELQFILRQVNDLERIYSRLALRTASPHDFVRMRSTLEILPNLHLILKKIKSKHIKKIRLSI GYFEEVLCLLKKAISLKPSKCIRDGGVIAELYNIELDELRSIKINSKEYIKNFEQKEKKKLMIESFKIKFNKIIGYYIQI SKRHTHLIPKYYVIIQTLKNTERYSVPLLKEYEEKVLNSEMRSLLLEKKLYAEIFNIIEPFLEKLQNSALALSELDVLVN LSERAISLNYTRPIMSEKYGISLLESRHPVVECFLKTPFIKNSVFLSRTQRMIIITGPNMGGKSTYMRQIALIVIMAGIG SFVPARYALIGSIDKIFTRIGSADDLSNGYSTFMMEMMEISNILHNATSNSLVLIDELGRGTSTNEGLSLAWSCSRYLIN INKSMTLLSTHFVELTKLEEKEKFVKNFHFSAIKSDLHIAFLYKIKNGISKKSYGISVASLSGLPDSVLEDAEKKLIEIE NT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 0.0 | 50 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | YP_002468166.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 0.0 | 53 |
