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Name : ctaD (BCAH820_3958) Accession : YP_002452908.1 Strain : Bacillus cereus AH820 Genome accession: NC_011773 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 3793965 - 3795827 bp Length : 1863 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00115; match to protein family HMM TIGR02891 DNA sequence : GTGAGTTCTGTAGCAAAAAAACAGGGGATGGGTGCTGTCATATGGGATTATTTAACGACAGTAGACCATAAAAAGATTGC CATTCTCTATTTAATTGCAGGTGGATTGTTTTTTGTAATAGGCGGAATAGAAGCTCTATTTATTCGCCTTCAATTAGCGA TTCCTAACAACGCTTTTCTTGTTGGGGATGCTTATAATCAAGTATTAACTATGCACGGTACAACAATGATTTTCCTCGCA GCTATGCCACTCGTGTTTGCATTTATGAACGCCGCTGTACCACTTCAAATTGGTGCACGTGATGTAGCGTTCCCGTTTTT GAATTCACTCGGATTTTGGTTATTTTTCTTTGGTGGAGTATTTTTAAATTTAAGTTGGTTTTTAGGTGGAGCACCTGATG CAGGATGGACATCTTATGCATCTTTAGCTTTAGCCTCTAAAGGCCATGGTGTTGATTTTTATGTACTCGGCCTGCAAATC TCCGGTATAGGTACATTAATTGGAGGCATCAACTTCCTTGTAACCATTATTAATATGCGTGCGCCAGGAATGACGTATAT GCGTATGCCGATGTTTACATGGACGACATTTGTAACATCTTCGTTAATATTATTTGCTTTTCCGCCGTTAACTGTCGGAT TAGGACTTTTAATGTTAGATCGCTTATTTGGAACAAGTTTCTTTAATCCAGCGCTGGGCGGGAATACAATTATATGGGAG CATTTATTCTGGATTTTTGGTCATCCAGAAGTATACATTCTTATACTCCCAGCTTTCGGAATATTCTCAGAAATCTTCGC TACATTTTCGAAAAAACGATTATTTGGTTATTCGTCGATGGTGTTTGCGACAGTATTAATTGGATTTTTAGGATTTATGG TATGGGCGCATCATATGTTTACTGTTGGACTTGGTCCAGTTGCCAATGCTATTTTCTCAGTTGCAACAATGGCTATTGCG GTTCCGACCGGTATTAAAATATTCAACTGGCTCTTTACAATGTGGGGCGGAAGTATTCGCTTTACGACACCTATGATGTG GGCAGTAGCCTTCATTCCATCATTCGTAATGGGAGGAGTTACAGGTGTTATGCTAGCATCTGCACCAGCTGATTATCAAT TTCATGATAACTATTTCGTAGTAGCTCATTTTCATTATGTAATCGTCGGCGGTGTTGTATTTGGTCTACTTGCAGGAGCG CATTATTATTGGCCACTGATGTTTAATAAAATATTGAATGAGACATTAGGAAAGATAACATTTTGGTTATTCTTTATCGG TTTCCATTTAACGTTCTTCATTCAGCATTTTCTTGGTTTAATTGGTATGCCGCGTCGTTACTACACATACCTTGAGGGAC AAGGATTAGAGATGGGGAATATGATTAGTTCTATTGGAGCGGTATTTATGGCTCTTGGAACGATTGTTCTTTTATTCAAT GTCATTAAAACGACAGTTTCAAAAGAAAAGGCAGGGCGTGATCCATGGGATGCTCGTACATTAGAATGGACAATGCCAGC GCCTACACCGGAATATAACTTTAAACAATTGCCATTTGTTCGCGGGTTGGATCCGTTTTGGATTGAAAAACGCGAAGGGA ATAAAGAGATGACAGCGGCAGAACCAGTTGGTGATATTCATATGCCAAATGCATCATTTTCACCATTTATCATTTCTTTA GGATTGTTTATAGCGGCATTTGGTGCAATGTATATGCAAGGTGGAAAAGATAAGTTTTGGTTATTAGTAGCAATTATTGG TTTAATCATTACGTTTGGTGCAATGTTCCTGCGTTCAGTAATCGATGATCATGGATATCATATTCATAAGGAAGATTTAG AAGATAAGGGGGGCAAGGCGTAA Protein sequence : MSSVAKKQGMGAVIWDYLTTVDHKKIAILYLIAGGLFFVIGGIEALFIRLQLAIPNNAFLVGDAYNQVLTMHGTTMIFLA AMPLVFAFMNAAVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFFFGGVFLNLSWFLGGAPDAGWTSYASLALASKGHGVDFYVLGLQI SGIGTLIGGINFLVTIINMRAPGMTYMRMPMFTWTTFVTSSLILFAFPPLTVGLGLLMLDRLFGTSFFNPALGGNTIIWE HLFWIFGHPEVYILILPAFGIFSEIFATFSKKRLFGYSSMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGLGPVANAIFSVATMAIA VPTGIKIFNWLFTMWGGSIRFTTPMMWAVAFIPSFVMGGVTGVMLASAPADYQFHDNYFVVAHFHYVIVGGVVFGLLAGA HYYWPLMFNKILNETLGKITFWLFFIGFHLTFFIQHFLGLIGMPRRYYTYLEGQGLEMGNMISSIGAVFMALGTIVLLFN VIKTTVSKEKAGRDPWDARTLEWTMPAPTPEYNFKQLPFVRGLDPFWIEKREGNKEMTAAEPVGDIHMPNASFSPFIISL GLFIAAFGAMYMQGGKDKFWLLVAIIGLIITFGAMFLRSVIDDHGYHIHKEDLEDKGGKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 5e-92 | 50 |
