Gene Information

Name : aufC (ECUMN_3889)
Accession : YP_002414540.1
Strain : Escherichia coli UMN026
Genome accession: NC_011751
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : putative outer membrane export usher protein AufC
Function : -
COG functional category : N : Cell motility
COG ID : COG3188
EC number : -
Position : 3992978 - 3995569 bp
Length : 2592 bp
Strand : -
Note : Evidence 3 : Function proposed based on presence of conserved amino acid motif, structural feature or limited homology; PubMedId : 15213132; Product type pf : putative factor

DNA sequence :
ATGAACCTAAAGCTCAGAAAACTCGAACACAGGATGGCAAGGCAGAAGCAGATGAGGTGGTGTATGCTGCTTCTACTGAC
ACTTTTGCCTGCGTGTTCAGTGGCGGGTATGCGCTTTAACCCTGCATTCCTGTCGGGTGATACAGAAGCTGTTGCTGATT
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GCTTATAATTATAGTAAGTCACCAGGTTCAGATGCGGACAGAATCTTATCCGTAAATGTCTCATTGCCGATCAGCAATTG
GTTATCACTAGCTGTCGATGGGCGTACTGCGACAAATTCTATGACAGCAACTTATGGTTATAGTCAGGATAATAGCGGTC
ATGTAAATCAGTATGCCGGAGTATCTGGATCGCTGATGGAACAACATAATCTCAACTATAATATTCAACAAAATTTTGCC
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AATAAATATACAGTGGGGAGAAAGTTCTTATCAGCAATGTCGGGCAAACTATCAATTACCGGAAAGTGAGTTGGATAATG
CCATTAGCTATGCAAATCTGGAGTGCCGCTAA

Protein sequence :
MNLKLRKLEHRMARQKQMRWCMLLLLTLLPACSVAGMRFNPAFLSGDTEAVADLSRFEKGMTYLPGSYEVEIWVNDSPLT
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SELTLGDTWSSSDVFDSVSIRGAKLESDENMLPDSQSGFAPTVRGIAKSNAQVTIKQNGYVIYQTYTPPGPFEINDLNPT
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
fim2D AFH78429.1 putative fimbrial usher protein Virulence KpGI-5 Protein 0.0 48
sfaF CAC16953.2 SfaF protein Virulence PAI III 536 Protein 4e-178 45

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
aufC YP_002414540.1 putative outer membrane export usher protein AufC VFG0446 Protein 0.0 49
aufC YP_002414540.1 putative outer membrane export usher protein AufC VFG0876 Protein 0.0 47
aufC YP_002414540.1 putative outer membrane export usher protein AufC VFG1645 Protein 2e-178 45
aufC YP_002414540.1 putative outer membrane export usher protein AufC VFG0912 Protein 8e-178 45
aufC YP_002414540.1 putative outer membrane export usher protein AufC VFG0454 Protein 8e-168 43