Gene Information

Name : EFER_3402 (EFER_3402)
Accession : YP_002384482.1
Strain : Escherichia fergusonii ATCC 35469
Genome accession: NC_011740
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : outer membrane export usher protein aufC
Function : -
COG functional category : N : Cell motility
COG ID : COG3188
EC number : -
Position : 3465015 - 3467606 bp
Length : 2592 bp
Strand : -
Note : Evidence 3 : Function proposed based on presence of conserved amino acid motif, structural feature or limited homology; PubMedId : 15213132; Product type pf : factor

DNA sequence :
ATGAACCTAAAGCTCAGAAAACTCGAACACGGGATGGCAAGGCACAAGCAGATGAGGCGGTGTATGCTGCTTCTACTGAC
ACTTTTGCCTACGTGTTCAGTGGCGGGTATGCGCTTTAACCCTGCATTCCTGTCGGGTGATACCGAAGCTGTTGCTGATT
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ATGTAAATCAGTATGTCGGAGTATCTGGATCGCTGCTGGAACAACATAATCTCAACTATAATGTTCAACAAAATTTTGCC
AACCAGAATAATGGCGAAAATGGCTCGGTAGGTTTAAATTACCGTGGTACATATGGTTCACTAAATTCTGGATACAGCTA
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AATAAATATACAGTGGGGAGAAAATTCTTATCAGCAATGTCGGGCAAGCTATCAATTACCAGAAAGCGAGCTAGCTAATG
CTATTAGCTATGCAGACCTGGAGTGCCGCTAA

Protein sequence :
MNLKLRKLEHGMARHKQMRRCMLLLLTLLPTCSVAGMRFNPAFLSGDTEAVADLSRFEKGMTYLPGSYEVEIWVNDSPLT
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TEGTTQITGIVGDSGQVYLSGLPLQGIINIQWGENSYQQCRASYQLPESELANAISYADLECR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
fim2D AFH78429.1 putative fimbrial usher protein Virulence KpGI-5 Protein 0.0 48
sfaF CAC16953.2 SfaF protein Virulence PAI III 536 Protein 2e-177 44

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
EFER_3402 YP_002384482.1 outer membrane export usher protein aufC VFG0446 Protein 0.0 49
EFER_3402 YP_002384482.1 outer membrane export usher protein aufC VFG0876 Protein 0.0 47
EFER_3402 YP_002384482.1 outer membrane export usher protein aufC VFG1645 Protein 1e-177 44
EFER_3402 YP_002384482.1 outer membrane export usher protein aufC VFG0912 Protein 7e-177 44
EFER_3402 YP_002384482.1 outer membrane export usher protein aufC VFG0454 Protein 1e-168 43