Gene Information

Name : amt (LMHCC_1053)
Accession : YP_002350015.1
Strain : Listeria monocytogenes HCC23
Genome accession: NC_011660
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1090765 - 1091970 bp
Length : 1206 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGAATCAGTATTTATGTTCTTTTGTACTTTATTGGTTTGGTTAATGACACCAGGAATTGCATTATTTTACGGTGGTAT
GGTTCGACGCAAAAATGTGTTGAGTACGGCCATGTATAGTTTTAGTTCGATGGCAATTATTTCTATCCTTTGGGTGATTG
TTGGGTATTCGTTAGCTTTTGCCCCTGGAAACGGCTTTATAGGAAGTTTTGACTGGACCTTCCTTCATAATGTTGGCTTC
GCAGCAAATGATACTTACTCAGATGCTATTCCACATATTCTATTCATGATGTTTCAAATGACTTTTGCAATTTTGACTGT
AGCTATCATTTCTGGGGCATTTGCAGAAAGAATGAATTTCTCCGCTTATTTGATCTTCATTATCTTATGGTCGTTACTTG
TTTATTCCCCTGTTGCTCACTGGGTTTGGGGTGATGGTGGTTGGTTACGTAATCTCGGTGCACTTGATTTCGCTGGTGGG
AATGTTGTTCATATTAGTTCAGGTGTAACAGGGTTAGTCCTCGCAATTATGATTGGGCGTAGAAAAGAAGCCGATTCCGC
TTCACCGCATAATTTACCTTTAGCACTTATTGGCGGCATTCTAGTTTGGTTTGGTTGGTACGGATTTAATGTAGGTAGTG
CCTTAACAATTGATAATGTAGCCATGATAGCCTTTGTAAACACAAACACGGCCGCTGCAGCAGGTATTATCGGTTGGGGA
CTCGTTGAATGGTTAACGAATAAAAAGCCCACTATGCTTGGAACCATTTCTGGAGCAATTGCTGGTTTAGTATCCATTAC
GCCTGCCGCTGGATTTGTCACTGTGCCAAGTTCGCTAATTATCGGTTTCCTCGGCGGAGCACTTTGCTTCTGGGCTGTAT
TCTGGTTAAAAGGAAAAGTAAAATACGATGATGCACTTGATGCGTTTGGCCTTCACGGCATTGGCGGCATTTGGGGCGGC
ATTGCAACCGGACTTTTCGCCACAACAAAAGTAAATGAAGCTGGAGCAGATGGATTATTCTATGGCAATGCTTCTCTCGT
AGTAAAACAATTAATCGCCATTGGTTCGACGGTAGCATATGTAGCTGTAGCAACGGCTATAATCGTCGTAATTATCAAAC
TATTTTTACCAATTCGTGTAAATGAAGAACAAGAATACAAAGGACTTGATTTGACGCTGCACGGCGAAAAAGCATATCAA
GAATAA

Protein sequence :
MESVFMFFCTLLVWLMTPGIALFYGGMVRRKNVLSTAMYSFSSMAIISILWVIVGYSLAFAPGNGFIGSFDWTFLHNVGF
AANDTYSDAIPHILFMMFQMTFAILTVAIISGAFAERMNFSAYLIFIILWSLLVYSPVAHWVWGDGGWLRNLGALDFAGG
NVVHISSGVTGLVLAIMIGRRKEADSASPHNLPLALIGGILVWFGWYGFNVGSALTIDNVAMIAFVNTNTAAAAGIIGWG
LVEWLTNKKPTMLGTISGAIAGLVSITPAAGFVTVPSSLIIGFLGGALCFWAVFWLKGKVKYDDALDAFGLHGIGGIWGG
IATGLFATTKVNEAGADGLFYGNASLVVKQLIAIGSTVAYVAVATAIIVVIIKLFLPIRVNEEQEYKGLDLTLHGEKAYQ
E

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 6e-75 50
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 6e-75 50