|
Name : ctaD (BCAH187_A4061) Accession : YP_002339996.1 Strain : Bacillus cereus AH187 Genome accession: NC_011658 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 3792962 - 3794824 bp Length : 1863 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00115; match to protein family HMM TIGR02891 DNA sequence : GTGAGTTCTGTAGCAAAAAAACAGGGGATGGGTGCTGTCATATGGGATTATTTAACGACAGTAGACCATAAAAAGATTGC CATTCTCTATTTAATTGCAGGTGGATTGTTTTTTATAATAGGCGGAATAGAAGCTCTATTTATTCGCCTTCAATTAGCGA TTCCTAACAACGCTTTTCTTGTTGGGGATGCTTATAATCAAGTATTAACTATGCACGGTACAACAATGATTTTCCTCGCA GCTATGCCACTCGTGTTTGCATTTATGAACGCCGCTGTACCACTTCAAATTGGTGCACGTGATGTAGCGTTCCCGTTTTT GAATTCACTCGGATTTTGGTTATTTTTCTTTGGTGGAGTATTTTTAAATTTAAGTTGGTTTTTAGGTGGAGCGCCTGATG CAGGATGGACATCTTATGCATCTTTAGCTTTAGCCTCTAAAGGCCATGGTGTTGATTTTTATGTGCTTGGCTTGCAAATC TCCGGTATAGGTACATTAATTGGAGGTATTAATTTCCTTGTAACCATTATTAATATGCGTGCGCCAGGGATGACGTATAT GCGTATGCCGATGTTTACGTGGACGACATTTGTAACATCTTCATTAATATTATTTGCTTTTCCACCGTTAACTGTAGGAT TAGGACTTTTAATGTTAGACCGCTTATTTGGAACAAGTTTCTTTAATCCAGCACTGGGCGGGAATACAATTATATGGGAG CACTTATTCTGGATTTTCGGTCATCCAGAAGTATACATTCTTATACTCCCAGCTTTCGGAATATTCTCAGAAATCTTCGC GACGTTTTCGAAAAAACGATTATTTGGTTATTCGTCGATGGTGTTTGCGACAGTATTAATTGGATTTTTAGGGTTTATGG TATGGGCGCATCATATGTTTACTGTTGGGCTTGGTCCAGTTGCAAATGCTATTTTCTCAGTTGCAACAATGGCGATTGCC GTTCCGACCGGTATTAAAATATTCAACTGGCTCTTTACAATGTGGGGCGGAAGTATTCGTTTTACGACACCGATGATGTG GGCAGTAGCCTTCATTCCATCATTCGTAATGGGAGGAGTTACAGGTGTTATGCTAGCATCTGCACCAGCTGATTATCAAT TTCATGATAACTATTTCGTAGTAGCTCACTTTCATTATGTAATTGTCGGTGGTGTTGTATTTGGTTTACTTGCAGGAGCC CATTATTATTGGCCGCTGATGTTTAATAAAGTATTGAATGAAACGTTAGGAAAGATAACATTTTGGTTATTCTTTATCGG TTTCCATTTAACGTTCTTTATTCAGCATTTCCTTGGCTTAATTGGTATGCCACGTCGTTACTACACATATCTTGAAGGTC AAGGGTTGGAAATGGGCAATATGATTAGTTCTATTGGAGCGGTATTTATGGCTCTTGGAACGATTGTTCTTCTATTCAAT GTAATTAAAACAACAGTATCAAAAGAAAAGGCTGGTCGTGATCCGTGGGATGGACGTACATTAGAATGGACAATGCCAGC ACCTACACCAGAATATAACTTTAAACAATTACCATTTGTTCGCGGGTTAGATCCGTTTTGGATTGAAAAACGTGAAGGGA ATAAAGAGATGACAGCGGCGGAACCAGTGGGTGATATTCATATGCCAAATCCATCATTTTCACCATTTATCATTTCTTTA GGATTGTTTATAGCGGCATTCGGTGCAATGTATATGCAGGGTGGAAAAGATAAGTTTTGGTTATTAGTAGCAATTATCGG TTTAATTATTACGTTTGGTACAATGTTCCTACGTTCAGTAATTGATGATCATGGATATCATATTCATAAAGAAGATTTGG AAGATAAGGGGGGCAAGGCGTAA Protein sequence : MSSVAKKQGMGAVIWDYLTTVDHKKIAILYLIAGGLFFIIGGIEALFIRLQLAIPNNAFLVGDAYNQVLTMHGTTMIFLA AMPLVFAFMNAAVPLQIGARDVAFPFLNSLGFWLFFFGGVFLNLSWFLGGAPDAGWTSYASLALASKGHGVDFYVLGLQI SGIGTLIGGINFLVTIINMRAPGMTYMRMPMFTWTTFVTSSLILFAFPPLTVGLGLLMLDRLFGTSFFNPALGGNTIIWE HLFWIFGHPEVYILILPAFGIFSEIFATFSKKRLFGYSSMVFATVLIGFLGFMVWAHHMFTVGLGPVANAIFSVATMAIA VPTGIKIFNWLFTMWGGSIRFTTPMMWAVAFIPSFVMGGVTGVMLASAPADYQFHDNYFVVAHFHYVIVGGVVFGLLAGA HYYWPLMFNKVLNETLGKITFWLFFIGFHLTFFIQHFLGLIGMPRRYYTYLEGQGLEMGNMISSIGAVFMALGTIVLLFN VIKTTVSKEKAGRDPWDGRTLEWTMPAPTPEYNFKQLPFVRGLDPFWIEKREGNKEMTAAEPVGDIHMPNPSFSPFIISL GLFIAAFGAMYMQGGKDKFWLLVAIIGLIITFGTMFLRSVIDDHGYHIHKEDLEDKGGKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 1e-84 | 50 |
