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Name : swp_1574 (swp_1574) Accession : YP_002310944.1 Strain : Shewanella piezotolerans WP3 Genome accession: NC_011566 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis) Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : 2.7.10.1 Position : 1619587 - 1621797 bp Length : 2211 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGGATTATATTAACGCTATGAGCAGTAATACCCCCTTTCAAGCAAACCAGTCACAGCCGTTACCCCAAAGCAATTCTAA TGGTGATATTGATTTAGGAAAGTTATTTGGCATATTACTCGACGCTCGCTGGTTAATTATTGCAGTAACGTCACTATTCA CAACAATCGGTGTGATCTACGCGCTATTGGCTACGCCAGTGTATAAAGCTGATGCATTGATCCAAGTTGAACAAAAAAGT AGCGGTATGTCAGCGCTGGTCGGTGACATGGGTGATATGTTTTCCAGTGAGTCTTCGGCAACCACCGAAGTTGAAATTAT AAAATCAAGGATGGTGTTAGGCAAAACCGTAGACAAATTAAACCTAACCACTTTAGCACAGCCTCAATACTTAGCCGTTA TTGGTAAAGGGCTGAGTAGACTCACGGGTGAATCAAATGCCATCAAAATTAGTCGTTTTCAAACGCCTAATAATACTGTA GCGAATTTTATTCTGAGTGTTGATGATAGCGCCAAAGGTGCATATACACTTTATAATCAAGAAGGCCGAAAAGTATTAGC CGGCTTAGTTGGCGAGCTAGCGACTAAAGGTGACTATAGCTTGTTTGTTCAGCAGCTAGTGGGCAGCAAGGGTGATGAGT TTGCAGTTAGTAAACGCTCAAAACTGGATGCTATACAGTGGTTACAAAAAAATCTCAGTGTAAGTGAGCGTGGCAAGCAA ACGGGCATACTGCAGTTGTCTTTTGCGGGCGAAGAAAAACAGCTGATTGAAGAGATTCTTAATAATGTAAGTGAGAACTA TTTTCTACAAAATGTGGCTAGAGACTCGGCGGAAGCGCAAAAAAGTTTAAATTTTCTGCAAAGTCATTTGCCAAGTATAA AAACTGAATTAACCGACTACGAAGACACGCTTAATCGTTACCGTCAAGACAATGACTCAATAGACTTAGGCTTAGAAGCG CAATCAACCCTAAAAGTCATGGTAGAGCTTGAGGCGCAATTAAACGAGTTAACCTTTAAAGAGAGTGAAATTAGCCAGCG CTTTACTAAAGACCATCCAGCTTATAAATCTTTGCTAGATAAACGTCAGGTTTTACTTGCTGAAAAAGAGCGCCTAAACA GGCGAGTACAACAGTTACCGAAAACACAACGTGAAGTGCTCCGCATGACGCGCGATGTTGAAGTCAATCAACAAATATAT ATTCAATTACTGAATAAAGTACAAGAGCTAAGTATCTTAAAAGCTGGCACGGTAGGCAATGTACGCATACTCGACAAGGC GCAATCCTATTCACAGGCGATAAAACCTAAAAAGCCACTTATTGTTGTACTCGCAACACTTTTAGGCGCCATGCTGGCAA TTGCTGTTGTATTAGTTAAAGCTGCACTACATAAAGGCATCGAAAACCCAGACGAAATCGAAGCAATAGGCTTAGCAGTT TATGCCAGCATTCCTTTATCTGAGTCGCAAAATACTATTGATGAGAAATATAAAAGAAACAGACATAGAAGTAAACGACA GGTCAGTGAATCATTATTAGCTGAATTTAACCCTGCTGACTTATCTATTGAGGCATTACGCGGTCTTAGAACCAGTATGC ATTTTGCCATGATGGAAGCGAAAAATAATGTGGTGATGATTTCAGGCGCCTCACCAGAAATCGGTAAGTCATTTATATCA GCCAATTTTGCAGCTGTTATCGCTAAAAGCGGTCAAAAGGTACTAGTAATAGATGGTGACATGCGCAAAGGATACCTTCA GCGGCACTTTAATCTTGACTGGGATAATGGGCTTTCAGAGTTCCTATCTGGCAAATTACCAGCGGAAAGCGTTATTAAAA AATCAGGTATAGAAAACCTAGATGTAATTACCCGTGGCCAAGTGCCACCGAACCCCTCTGAACTGCTCATGAACCCACGC TTAGCGAGCTTTTTTGAGTGGGCATCAAGTGAATACGATCTAGTGATTATTGATACACCGCCAGTATTAGCGGTGACAGA CCCAAGTATTGTTGGTGCTATCGCAGGCACAACCTTAATGGTAGGCCGCTTTGGACTAAACACAGTCAAAGAGATTGACG TTGCACGTAACCGCTTTGACATTGCCGGCGTTGAAGTCAAAGGCTTTATTCTCAATGCGGTAGAGAAAAAAGCGAGCGCA TCATATGGCTATGGTTACTATAACTACAGTTATGAAAGTGATAAAAAATAG Protein sequence : MDYINAMSSNTPFQANQSQPLPQSNSNGDIDLGKLFGILLDARWLIIAVTSLFTTIGVIYALLATPVYKADALIQVEQKS SGMSALVGDMGDMFSSESSATTEVEIIKSRMVLGKTVDKLNLTTLAQPQYLAVIGKGLSRLTGESNAIKISRFQTPNNTV ANFILSVDDSAKGAYTLYNQEGRKVLAGLVGELATKGDYSLFVQQLVGSKGDEFAVSKRSKLDAIQWLQKNLSVSERGKQ TGILQLSFAGEEKQLIEEILNNVSENYFLQNVARDSAEAQKSLNFLQSHLPSIKTELTDYEDTLNRYRQDNDSIDLGLEA QSTLKVMVELEAQLNELTFKESEISQRFTKDHPAYKSLLDKRQVLLAEKERLNRRVQQLPKTQREVLRMTRDVEVNQQIY IQLLNKVQELSILKAGTVGNVRILDKAQSYSQAIKPKKPLIVVLATLLGAMLAIAVVLVKAALHKGIENPDEIEAIGLAV YASIPLSESQNTIDEKYKRNRHRSKRQVSESLLAEFNPADLSIEALRGLRTSMHFAMMEAKNNVVMISGASPEIGKSFIS ANFAAVIAKSGQKVLVIDGDMRKGYLQRHFNLDWDNGLSEFLSGKLPAESVIKKSGIENLDVITRGQVPPNPSELLMNPR LASFFEWASSEYDLVIIDTPPVLAVTDPSIVGAIAGTTLMVGRFGLNTVKEIDVARNRFDIAGVEVKGFILNAVEKKASA SYGYGYYNYSYESDKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 2e-157 | 48 |
