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Name : virD4-1 (HPP12_0454) Accession : YP_002301090.1 Strain : Helicobacter pylori P12 Genome accession: NC_011498 Putative virulence/resistance : Virulence Product : VirD4 coupling protein Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG3505 EC number : - Position : 476105 - 477832 bp Length : 1728 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGAGAAAAATTCAAAACATTAAGAGATAAATTTAAGGATAAAACCAGCAATTTATTCCATAAGCTTAATAGCATTCA AAAAGATTATTACACTAAAACTCTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAGAGTTATCCTATGA CCTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGCTGTATAAAGGTTTAAATTCGCTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG CTTTCTACTTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACCGCAGCTGTGGCTGTGCCTAATCTTTTAAGTGTGCCTAG CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGGGAGTTGTTTGATTTAACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA TTTTTGTATTTGATCCTTTAGGAAATGATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGATAAACGCATTGTAGAAAAATTAGAT TTTAACAGAAAGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGCTGAAGATGGGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAATTTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTGTGTGTGCATAACACTAGCACCTTTTTTGAAA TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTATACTGAATTATATGAATGCCAA AGTAGCGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAATGGGCGTTATATGGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAA TGCCAATGTGGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAACAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATG GATCTGTGAATCATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATGTTATAATGAAAGAGGGTATGTTAGATCCTATTATTAGAAAC GAAGCGAACAAATGGGCTAAGGCGAATGATAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTT TACAAGCTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGGCTGACAATATTTCACTCT ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACACTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTT TTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTCTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTT TTTATTAGAAATGCCAGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATCACGCAACCCAACGCTCTTATTGAAA AATATTATGGCAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAATAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAA TATGCTAAACAAGTGAGCGAAGAAGTCGGTAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCAT TACCGGAGGGACTTCTAGCATAGGTAAAGAGGCGTGGGACTTATTGAGCGCGCAAGATATTATGAATATTGATAAAGATG AAGTGATCGTTTTAGTAAGCGGTCATAAGGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTA CTCTCTCGTATTAACTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTTGA Protein sequence : MREKFKTLRDKFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKTLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLSVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD FNRKRRLVDEVGNTIFAEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNANVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNHLEKDDQGNVIMKEGMLDPIIRN EANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRADNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNL LLKESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQPNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKIIFKMDDLE YAKQVSEEVGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIVLVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL LSRINWEVKPNEEVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 100 |
