Name : lldP-2 (HPP12_0139) Accession : YP_002300779.1 Strain : Helicobacter pylori P12 Genome accession: NC_011498 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 147873 - 149528 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAACATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTATT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAGCTCAAAGGTTATGCAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACAGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGTGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACCGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCTGGGTTATGT TTGATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCACGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGCAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATCGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATCTCAGCCCTTGTCTCACTCGTTGCGACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCCTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATTTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAACCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC CTTTGTAGAAGCTAATCAAAGCGTGAGTTTTCCTGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTTATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAGTGAGCGTTTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGTTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGTTTGGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGGACTTTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASTVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDAVSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-104 | 52 |