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Name : lldP-1 (HPP12_0138) Accession : YP_002300778.1 Strain : Helicobacter pylori P12 Genome accession: NC_011498 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 146167 - 147816 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCACTTTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAGGGGTATAGCGCGGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACTCCGGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCTGGGTTGTGCTTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGCATTCCTATTACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTGCCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCCGTTACTGGGTTTAGCTTCGCTATCGCACAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCGCAACTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTTCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCACGATAAACACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTGATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGCTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCAGCCAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTTAGATTTACAGTAAAATACTCCATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTATTTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCCATCATTCCTAAATAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSILIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLISTTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTINTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFDSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIIFTLIAYVFPFIIPIIPK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-133 | 56 |
