|
Name : HPG27_974 (HPG27_974) Accession : YP_002266593.1 Strain : Helicobacter pylori G27 Genome accession: NC_011333 Putative virulence/resistance : Virulence Product : cag island DNA transfer protein Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG3505 EC number : - Position : 1060476 - 1062203 bp Length : 1728 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGAGAAAAATTCAAAACATTAAGAGATAAATTTAAGGATAAAACCAGCAATTTATTCCATAAGCTTAATAGCATTCA AAAAGATTATTACGCTAAAACTCTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAAAGTTATCCTATGA CCTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGACTATATAAAGGTTTAAATTCGCTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG CTTTCTACTTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACCGCAGCTGTGGCTGTGCCTAATCTTTTAAATGTGCCTAG CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGGGAGTTGTTTGATTTAACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA TTTTTGTATTTAATCCCTTAGGAAATGATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGATAAACGCATTGTAGAAAAATTAGAT TTTAACAGAAAGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGCTGAAGATGGGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAATTTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTGTGTGTGCATAACACTAGCACCTTTTTTGAAA TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTACACTGAATTATATGAATGTCAA AGTAGCGATAATGGTTTTATTAAAGAGAATGGGCGTTATATAGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAA TGCCAATGTAGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAACAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATG GATCTGTGAATCATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATGATGAAAGAGGGTATGTTAGATCCTATTATTAGAAAC GAAGCGAACAAATGGGCTAAGGCGAATGATAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTT TACAAGCTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGGTTGATAATATTTCACTTT ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACACTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTT TTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTCTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTT TTTATTAGAAATGCCAGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATTACGCAATCCAACGCTCTTATTGAAA AATATTATGGTAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAGTAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAA TACGCTAAACAAGTGAGCGAAGAAATCGGCAAGATGACCAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCAT TACCGGAGGGACTTCTAGTATAGGTAAAGAGGCGTGGGACTTATTGAGTGCGCAAGATATTATGAATATTGATAAAGATG AAGTGATCGTTTTAGTAAGCGGCCATAAGGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTTAAAAATAAAGAATTA CTCTCTCGTATTAATTGGGAAGTCAAGCCCAATAAAGAAGTGTTTTGA Protein sequence : MREKFKTLRDKFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYAKTLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLNVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFNPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD FNRKRRLVDEVGNTIFAEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ SSDNGFIKENGRYIAKVENGVKKMKPNANVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNHLEKDDQGNIMMKEGMLDPIIRN EANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRVDNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNL LLKESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQSNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKVIFKMDDLE YAKQVSEEIGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIVLVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL LSRINWEVKPNKEVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 98 |
