Gene Information

Name : SG4104 (SG4104)
Accession : YP_002228833.1
Strain : Salmonella enterica 287/91
Genome accession: NC_011274
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : large repetitive protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG1340
EC number : -
Position : 4317603 - 4334282 bp
Length : 16680 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGAAATAAAAGCATACAAAAGTTTTTTGCCGATCAAAATTCTGTAATTGATTTATCTTCTTTGGGTAATGCCAAAGG
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCCGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAAGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAG
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TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTGCAGATGATAAT
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGTGTGAAAGGCGACAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
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GGCAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAGGCGACTGATAAAGCAGG
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GCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGAT
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CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGCCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAAGACGACGCAGGAACTTGATTTCACCATCGATACC
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GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTGATAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
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GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGCGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
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TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGTATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTACACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCCTGCTGTCAGAACCGACTATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCGACTATACGTTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
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ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
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GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCACCATTGACCATAT
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CGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGTAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGTC
TGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGTAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAA
AACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTACAGCATGGCGGCACGAAAGAGGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTAACACC
GACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACAGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTAACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTTAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACCACG
CTGTCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACGATACCGGTGTCCAGGGCGATAACATGACGAATAGCACCCAGCC
GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGGCGTAGGCGGATGGAGCTTTACGCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTGCATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
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CGACGGATGTTAACGAGGTACGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGC
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CCAGACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCATGCTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGCGAATAAGCCGACGTTTATACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAGTATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
CGCCGCTGACGGTCACGGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
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GGGCTTTACCATTGGCAATATTGACTCCGATGCGCAATCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGTGGCAATAGCCAGGAAG
TGACACTAACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACACTGACGGTA
GAGGTAACGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGATAGTGACGGTAGATACGCAAACCAGCATTACTGA
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CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGGCGCAGGGTATTGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACTATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACCGCGACACAGGGGGCTGGAGGCTGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCATATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTG
ACAAAACATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATTGACGGCGGCAC
GACCTGGGTTACCGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
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ATGACGCCAACCATTGAGCTGGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
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GGCGGGGAATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGACACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACTGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTC
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CCCGAATACTTTGGTTGACGGCACATATACCCTTCGCGTAGAGGCCACGGATGAGGCAGGTAATATTGCGAATAAAGATT
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GATAATATCACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACGCCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
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GGCAGGTAATAAATGGCTGTTTACCCCTGATACACCGTTAGTGGATGGAACTTACAAAATAGAAATAGTGGCTGAAGATA
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CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGTTTGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCGGCAAAC
GCCAATGCGAATGGCGAATGGAGTTGGACGCCGCCATCAGTATTAGCGCCAGGCTCCTATGTTGTGAGCATTGTTGCCAA
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AGCTCAGCGAGGAGAGCGATAGTGGTGCCTTAGGAGACTTTACCACGAATAATAAAACGCCGACCCTGGTTGGGAACACG
TTACCTAATGCGATTGTGAGTATTTATGTGGATGGCGTGAAGGTCGGCGAGGCGACAGCGGATACAGCGGGTCGATATAC
TTTCCAGTTATCGGAAATGAAAGATGGCCATTATGTCGTCCAGGTGGGTATAGTCAACCCTCGCGATAATAGCGAACTGC
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TAACGTTTAAAGTTGAAGATGTTGCCGGCAATATCAGAGAGTTTGGTCCGCAGAATGTGATACTGGATACGGTAATTTCG
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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GCAACTCTGGTTCACTTGACGATCTGATTACTAATCACAACAAGCCTGTGTTAGTTGGCACCGCAGAAGCGGGAGCCACA
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GGGAAGTTTGGGTTAATGAAAAAGGCCACTGGCAGATGCCGGTGAACCCGCTTTATTTCACAGAAGGCCAACTGGATATC
ACTGTTAAATCTACGGACCGTGCTGGTAACGTAAATCAGGAAAAGTATTCCATTTGGGTCGATACGCATATCCAGGTATT
TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTA
TGGGGGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGTTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAG
TGGGAATTATCGACCGATCAGCTTCCGGAAGGTAAATACGATATCACGTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAA
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TAATTATTATGCAGGGGACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACC
GTTCCTGATAATGGTAAATGGAGTATGGCTATCCCGTATCCATCGGAAGGGAAGTTTACCATTACGAGTGTGGATGCGAT
TGGTAACCGGAGTGATGATGTCTCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGATGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTCGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACCGTTA
CTATCGACAGTACGCTGACGGTGCCGGAGATTGCGTTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGTTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
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ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
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CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
TCAGTACCTGAGAATATTGTTAATGTCAGTATTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGC
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Protein sequence :
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DLKDIQLERIDSSLVDSAQVEKKGNGKRRNKKEEEELKKQLDDAENAKKEADKAKEEAEKAKEAAEKALNEAFEVQNSSK
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KAEPNAIISVINSETGEEVIFKANDRGEWTFNFTSDSVEGINNLTFTVEDVAGNKKDFSFSYVIDTIAPVPPTVSLEDFV
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DDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
SG4104 YP_002228833.1 large repetitive protein VFG0581 Protein 0.0 99