Name : nrdE (BDU_1076) Accession : YP_002223483.1 Strain : Genome accession: NC_011247 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 86330 - 88453 bp Length : 2124 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGAGTTATCTGGAACATCACATGATGTTAAGAATTTTATGGAAAGGATTAGTGATGAGACACTTAGAGTTAAATAATGA GATGATGGTTTTAAGAGACGGGTTTTATAGGTTAGAGAAAGATCTTGAGGCTTTGAGTGTTTTTTTGGAAGAAATTAAAA GTAAATCTTTAAAATTTGAAAATCCAAATGAAAGAATGCATTATTTGATTGATAACAATTTATATGAAGATTTTTATCAA AAATATTCTGAAGATCAAATACTTGAAATATATAAAGCTGTTGAGGGAGAGGAATTTAAATTTAAGTCTTATATGAGTGC TTCAAAATTTTATAAGGATTATGCACTTAAAGTAAAAGATACTTATTTTGAGTCTTATGAAGATAGAATTATTGCAGTTA GTTTGTTTCTTGCTGATGGATGTTTTGATTTTGCATTGAGACTTGCTTTAGATATGATAAAGCAGCGATATCAGCCTGCA ACTCCCACTTTTTTAAATGCTGGTAAGTATGTTAGAGGTGAACTTGTATCTTGTTTTTTATTAGAGGTGGGTGATTCATT AAATAGCATTACTTTTAATATTTCTTCTGCTATGCAGCTTTCTAAAATTGGTGGAGGTGTTGCTTTAAATCTTTCAAATA TTAGAGCTAGGGGTGAAGAGATACGGGGAATTTGTAATGTTGCAAAAGGTGTTATTCCCGTTATGAAGCTTTTAGAAGAT GGGTTTAATTATGCAGATCAGATGGGGCAGAGAAAGGGTGCTGGTGCTGTATATTTAAATATTTTTCATTATGATATAGA AGATTTTTTGGATACAAAAAAGATTAATGCTGATGAGAAGAGTCGTGTTCAGACATTGTCATTGGGAGTAATAATTCCAG ATAAATTTTTTGAACTTGCAAAGCAAGATAAAAATTATTATGCATTAGCCCCATATTCAGTTTATAAAGAGACTGGGCTT ATGATGAATGATATTGATTTTGATAAAGATTATGATTTACTTGCAAGTAATCCTCGTATTATAAAAAAAGAAATATCGGC TAGAGATATGCTTGTTCGTATTGCAAAGCTTCAGTTTGAATCAGGATACCCTTATATTATGTATCAAACTTCATGTAATT TAAATCATCCATTAAAAGAAGTTGGACGTGTTAAGATGTCTAATCTTTGTACAGAAATTTTTCAGATTCAAACACCTTCT GTTATTGGCAATTATGGTGAGGGCGATGTTATTGGATATGATGTTAGTTGTATTTTGGGTTCATTAAATATTGTTAATGT CATTAATAGTGATTTTGAATTTACTGTTGACTTGGCTATGAGAGCTTTGACATCTGTTGTTGACAAGTCTTGTATTAATA ATGCTCCAAGTGTACGTAAAGCTAATGATGATTATCGTGCTGTTGGTCTTGGTGTTATGAATTTGCATGGTTTTTTAATT AAAAATAAAATTCCTTATGAGAGTGATGAGGCTTTGGATTTTGTTCGCACATTTTTTATGTTGTTAAATTTTTATTCTCT AAAGAGCAGCATGAATATAGCAAAAGAGAGAAATTCTGTTTTTAAAGATTTTAAGCAGAGTGAATATTATAATGGTAATT ATTTTAATATGTATCTTAATGAAGATTTCTCTCCAAGAAGTGAAGTTGTAAGGGAAATATTTAGCTGTCTTCAAATTCCT TCTAAGAGTGATTGGAACAATCTGAAAGGAGATATTCAACGATATGGACTTTACCATGCTTATAGACTAGCTGTAGCTCC AACTCAGAGTATATCTTATATTCAGAATGCGACAACATCTCTTATGCCTATTGTTGAGCCTGTTGAGGCTAGAGTTTATG GAAATTCTACAACTTATTATCCAATGCCATATCTTAGCAGAGAAAATGCTATTTTCTTTAAGTCTGCATATTATATGGAT ATGAGAAAATTGATTGATCTTGTAAGTGAAGCACAAAGACATGTTGATCAAGGAATTAGTACTTTGCTTTATGTTACAAA TGAAACTAGTACTAGAGAACTTGTAAAACTTTATATTTATGCAAAGAATAAGGGGCTTAAAAGCTTGTATTATACACGTA ATAAAAATCTCTCAGTAGATGAGTGTATTCTTTGTGCAATATAG Protein sequence : MSYLEHHMMLRILWKGLVMRHLELNNEMMVLRDGFYRLEKDLEALSVFLEEIKSKSLKFENPNERMHYLIDNNLYEDFYQ KYSEDQILEIYKAVEGEEFKFKSYMSASKFYKDYALKVKDTYFESYEDRIIAVSLFLADGCFDFALRLALDMIKQRYQPA TPTFLNAGKYVRGELVSCFLLEVGDSLNSITFNISSAMQLSKIGGGVALNLSNIRARGEEIRGICNVAKGVIPVMKLLED GFNYADQMGQRKGAGAVYLNIFHYDIEDFLDTKKINADEKSRVQTLSLGVIIPDKFFELAKQDKNYYALAPYSVYKETGL MMNDIDFDKDYDLLASNPRIIKKEISARDMLVRIAKLQFESGYPYIMYQTSCNLNHPLKEVGRVKMSNLCTEIFQIQTPS VIGNYGEGDVIGYDVSCILGSLNIVNVINSDFEFTVDLAMRALTSVVDKSCINNAPSVRKANDDYRAVGLGVMNLHGFLI KNKIPYESDEALDFVRTFFMLLNFYSLKSSMNIAKERNSVFKDFKQSEYYNGNYFNMYLNEDFSPRSEVVREIFSCLQIP SKSDWNNLKGDIQRYGLYHAYRLAVAPTQSISYIQNATTSLMPIVEPVEARVYGNSTTYYPMPYLSRENAIFFKSAYYMD MRKLIDLVSEAQRHVDQGISTLLYVTNETSTRELVKLYIYAKNKGLKSLYYTRNKNLSVDECILCAI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 8e-136 | 46 |