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Name : BRE_445 (BRE_445) Accession : YP_002222902.1 Strain : Borrelia recurrentis A1 Genome accession: NC_011244 Putative virulence/resistance : Virulence Product : nucleotide sugar epimerase Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG0451 EC number : 5.1.3.- Position : 482216 - 483274 bp Length : 1059 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGAGTATTATTAACAGGAATTGCAGGGTTTATTGGTTTTCATGTTGCTAAGAAACTTGCTGATGATGGACATGAAGT TTTAGGTATAGACATTTTAAATAATTATTATGATCCTAGTTTGAAATATGAGAGATTGGAAATTTTAGGATTTAATAGTG AAAATATAGATAGTAAAAAGGTTGTGAATAGTCATAAATATAATAATTTAAGTTTTGTTAATCTTGATATTTTGAATAAA GAGCAAGTTTTGTCTCTTTTTAATAATTATAAATTTACTCATATTTGTCATTTAGCAGCTCAGGCAGGTATTAGAGATAG TATTGAAAATCCAGATAGTTATATTGCTATTAATATTGTTGGATTTTTTAATATTTTAGATGCATGTAGGATATATAAAG ATTCTATTGAACATTTTGTTTATGCATCTACTTCTGCAGTTTATGGCTTGAATGAAAAAATGCCATCAAGTGAAGATAGC ATTACAGATCATCCTTTAAATTTGTATGCGGCTAGCAAAAAGTCTAATGAAGTAATAGCTCATGCTTACAGTTCATCTTT TAATATTCCAACAACAGGATTAAGATTTTTTACAGTTTATGGACCTTATGGGAGACCTGATATGGCATTGTATTTATTTG CAGATGGTGTTATGAGACAATCTACAATTAATGTCTTTAATAATGGAGATATGGCTAGAGATTTTACATATGTTGATGAT GTTGTAAATGGTGTTTGTAATGTACTCAAAAAACCGGCTAGGAGTGATAGTAATTTTGATAAGCAAAATCCCAATTCTTC AAGTTCATTTGCTCCATATAGAATATATAATGTGGGTACTGGACAGGCTGTTAAGCTTATGGAATTTATTAATGAGCTTG AAATAAATCTTGAGAATAAAGCTTGTAAAAATTTTTTGCCTATGCAAAAAGCAGATGTTGTAGAGAGTTGTTGTGATATT TCAAAACTTAAAAATGATTTTGCTTATGAAGCTTTAACTTCTATTAAGGACGGGATTCGAAAATTTGCAATTTGGTATAA ATCGAAGATATCTAAGTAA Protein sequence : MRVLLTGIAGFIGFHVAKKLADDGHEVLGIDILNNYYDPSLKYERLEILGFNSENIDSKKVVNSHKYNNLSFVNLDILNK EQVLSLFNNYKFTHICHLAAQAGIRDSIENPDSYIAINIVGFFNILDACRIYKDSIEHFVYASTSAVYGLNEKMPSSEDS ITDHPLNLYAASKKSNEVIAHAYSSSFNIPTTGLRFFTVYGPYGRPDMALYLFADGVMRQSTINVFNNGDMARDFTYVDD VVNGVCNVLKKPARSDSNFDKQNPNSSSSFAPYRIYNVGTGQAVKLMEFINELEINLENKACKNFLPMQKADVVESCCDI SKLKNDFAYEALTSIKDGIRKFAIWYKSKISK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1I | AAA64648.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 9e-73 | 47 |
