Gene Information

Name : SeD_A4656 (SeD_A4656)
Accession : YP_002218156.1
Strain : Salmonella enterica CT_02021853
Genome accession: NC_011205
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4497933 - 4514612 bp
Length : 16680 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCTGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAGGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAA
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TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTTCAGATGATAAT
TTAACGAATATCGTTAAACCTACCTTGCACCTAAAAGATATTGATCCGGACATTATCAGTGTTCAGGTATGGGATGCCGC
GTCTGATACGCAGATCGGTGTTGCCACGCAACAACCTGATGGTTCATGGGCCTATACCTTTACTTCAGATTTAACGGAAG
GCTTGCATCAGGTTTATGTCAAGGTTGAGGACATTGCGGGTAATAAAGCGAACAGCGCGGTATTCGATTTTACTATCGAT
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGCGTGAAAGGCGATAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
CGGTACCTACGGATGTCAATGAAGTCCGTCTGAGCATTGACGGTGGTAATTCGTGGGTTCAGGCAACTCCGGGCGTGGCA
GGAAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAGGCGACTGATAAAGCAGG
CAATACCGTGACGAAGACCATCGATTTCGCGGTGGATACCACGCTGTCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACG
ATACCGGTGTCCAGGGCGATAACATGACGAATAGCACCCAGCCGACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTT
CGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACATTTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGAGCTTTAC
GCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGTTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCAACGAT
AATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGACGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGG
CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGCCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGACAAGGCGGGAAACAAGACGACGCAGGAACTTGATTTCACCATCGATACC
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GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTGATAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGACAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
CCGTATTGAACTGGTTAACGACAGCGGTATCCCCGGCGATAATCTGACCAATGAAGCGCGCCCGCACTTTCAGGTGACAG
TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGTATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTACACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCACCATCGATACCATTCTGTCAGAACCGACTATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCGACTATACGTTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
CATCAACTGGGTTAACGCAACGCTGACGTCTGACGGCGTTTGGGAGTATATATGGCCGACAGATCTGGTCGAAAATACGT
ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCGCCATTGACCATAT
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AACGACGCAGCAACTGGACTTTATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTGCAGCATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCTACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTAACACC
GACCGGTACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACAGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGCTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTTAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACCACG
CTATCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACGATACCGGTGTCCAGGGCGATAACATGACCAATAGCACCCAGCC
GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGAGCTTTACGCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTGCATCGTTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
CATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGAAGGTAC
CGACGGATGTTAACGAGGTACGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGC
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CCAGACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCATGCTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGCGAATAAGCCGACGTTTATACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAGTATGGCGGCACGAAAAAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATATGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
CGCCGCTGACGGTCACGGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
CTGTCAACGCCTACCATCACTATGGATAGCAGGGACGATACAGGTGCCATTGGCGATCATATTACGAGCGTCAAAAGACC
GGGCTTTACCATTGGCAATATTGACTCCGATGCGCAATCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAG
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GAGGTAACGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGATAGTGACGGTAGATACGCAAACCAGCATTACTGA
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CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGGCGCAGGGTATTGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACTATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACCGCGACACAGGGGGCTGGAGGCTGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCATATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTG
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GACCTGGGTTACCGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACTTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
ATACCCTGACCGTGGAAGTGACTGACGGTGCGGGTAATAAGATGACGGAGACGCTCAATTTCACTATCGACATCACGTTG
ATGACGCCAACCATTGAGCTGGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
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TGGTACTCACCGAATCAGCCGACGGCTGGCGCTATCGACCGGATTCTGCTTTGGCGGACGGTAGCTACACATTCACCGTG
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GGCGGGGAATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGACACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACTGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTC
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GATAATATCACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACGCCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
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AAGCTGCCCTTTACCATTGATACCACGACAAGCGTCAGTGTCAGAATGGAGCCAGCGTCTGATACCGGAAATTCCAATAG
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CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGTTTGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCCGCAAAC
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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GGGAAGTTTGGGTTAATGAAAAAGGCCACTGGCAGATGCCGGTGAACCCGCTTTATTTCACAGAAGGCCAACTGGATATC
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TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTA
TGGGGGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGTTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAG
TGGGAATTATCGACCGATCAGCTTCCGGAAGGTAAATACGATATCACGTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAA
GGAAGAGGTACATGAAATATTTATTGATCGAACGCCGCCAAACGCTCCGGTCGTAACGTATTCAGATATTGTCAACGATC
TAATTATTATGCAGGGAACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACC
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TGGTAACCGGAGTGATGATGTCCCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTCGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACCGTTA
CGATCGACAGTACGCTGACGGTGCCGGAGATTGCGTTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGTTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
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ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
TGAAACAGTGAATGCCGAAAGCGCTACGCATCTTCGTACAGTGCCGTCTGCGGCGGAAGAAAGCGTGGTGAAGGAGACAG
CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
TCAGTACCTGAGAATATTGTTAATGTCAGTATTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGC
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Protein sequence :
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KTEPNAIISVINSETGEEVIFKANDKGEWTFNFTSDSVEGINNLTFTVEDVAGNKKDFSFSYVIDTIAPVPPTVSLEDYV
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DDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 99
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
SeD_A4656 YP_002218156.1 hypothetical protein VFG0581 Protein 0.0 99