Name : VFMJ11_A0243 (VFMJ11_A0243) Accession : YP_002157800.1 Strain : Genome accession: NC_011186 Putative virulence/resistance : Unknown Product : integral membrane protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG2194 EC number : - Position : 276644 - 278272 bp Length : 1629 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00884; match to protein family HMM PF08019 DNA sequence : ATGCTTGTTTTGTCTAATCTGATCTCAAAAATTAAAAGCCATAAAATATCGATGAATATGGTGTCACTTATCACGATAGT TTCACTTTATTTTGCTGTGGTATTTAACTATCCAATCAATGAAAAAATTTATCAACTCTCACAAGGACAAGAGGTTTTTC TCTTTTTAACGCCGGCGCTGCTTACTTGTGCTTTTATTATTATCTTCTCCTTTATTGCTTTTCCTTATGTGTTTAAAGGT ATTGTCGTTGTATTGACCATAACGTCTGCTATGGCGTTTTATGCAGCTCTTCAATATAACACCATGTTTGATTACGCAAT GATAGAAAACATTTTTGAAACCAATGTAGATGAAGCTTCGTCATATTTAAGCTCCGCATCTATTGGTTATTTAATTGTGT TTGGACTTATTCCATCGATTTTATTATTGAAAGTGAATATTGTGCGTCATGCCTCTTGGTTAAAAGAGCTTTTTCATCGT GCGATACTAATGAGTGTTGCGATTGTTGGTTTACTTTTAATCTCAGTTTTTTATTTTAAAGATTACGCATCGATTGGTCG TAATAATTCCTATTTAAATAAAATGATTAACCCTGCTGATGCATTTAATACTGTTAAATACATTAAAAATGAATACCTGA CTGCACCTTTAGAGTACATCACGATTGGAGAAGACGCCGTTGTTACCCCTGCTAAAAATGGCAAACCAACGTTAATGGTT ATTTTAGTTGGTGAAACGGCTCGAGCACAGAACAGTGCTTATAACGGTTATGAAAGAGAAACAAACCCATATACAAAAGA CCTTGGGTTAATTACTTTTCAGAATGTGACTTCTTGTGGAACCGCAACGGCACACTCTTTACCTTGTATGTTCTCTAATA TGACACGAACTAGTTACAATAAAGATCGTGCGAATAATCAAGATAATGCATTAGACGTATTAACCCACGCTGGTGTGAAA GCAGTATGGATTGATAACGATGGTGGTGATAAAGCAGTAGCAAAAAATATCGAAAAAGAGATGATTACGGATCATTCAGA ATCTAACTTATGTAATGGTTCGAGCTGCTATGATGAAATTTTATTAAAAGGATTGGATAAACGAATTGCAAAGGCACAAG GTAACCAAGTGTATGCTCTGCATATGATAGGAAGTCATGGTCCTACTTACTGGAAGCGCTATCCAAAAGAGATGGCGGTG TTTGGTCCTGCATGTAACCGCAGCGATATTGAGAATTGCAGTGATGCCGAAATAACGAATGTATATGATAATACCTTGGT TTATACCGATTATGTTATAGCTCAAACGGTTAAAAAATTACAAAGCTATTCAGATAAATACAACGTAGTTATGCTTTATA TTTCTGACCATGGTGAGTCATTAGGAGAGAATGGACTTTACCTTCATGGCGCACCTTATATGATGGCACCTAAAGAGCAA ACTCATGTGCCATGGTATATCTGGATGAGTGATGATTATGCAAATCAAAAAGGTATTGATAAAGCGGCGGTAATCGATAA TTCAGCAACGGGTGATTATTCACATGATAATTTATTCCATACTATTTTGGGCTTATATGGTGTAACAACAAAAGCCAAAG ATAATGCGTTAGATATTATGGCAAATTAA Protein sequence : MLVLSNLISKIKSHKISMNMVSLITIVSLYFAVVFNYPINEKIYQLSQGQEVFLFLTPALLTCAFIIIFSFIAFPYVFKG IVVVLTITSAMAFYAALQYNTMFDYAMIENIFETNVDEASSYLSSASIGYLIVFGLIPSILLLKVNIVRHASWLKELFHR AILMSVAIVGLLLISVFYFKDYASIGRNNSYLNKMINPADAFNTVKYIKNEYLTAPLEYITIGEDAVVTPAKNGKPTLMV ILVGETARAQNSAYNGYERETNPYTKDLGLITFQNVTSCGTATAHSLPCMFSNMTRTSYNKDRANNQDNALDVLTHAGVK AVWIDNDGGDKAVAKNIEKEMITDHSESNLCNGSSCYDEILLKGLDKRIAKAQGNQVYALHMIGSHGPTYWKRYPKEMAV FGPACNRSDIENCSDAEITNVYDNTLVYTDYVIAQTVKKLQSYSDKYNVVMLYISDHGESLGENGLYLHGAPYMMAPKEQ THVPWYIWMSDDYANQKGIDKAAVIDNSATGDYSHDNLFHTILGLYGVTTKAKDNALDIMAN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
Z1140 | NP_286675.1 | hypothetical protein | Not tested | TAI | Protein | 1e-101 | 43 |
Z1579 | NP_287083.1 | hypothetical protein | Not tested | TAI | Protein | 1e-101 | 43 |