Gene Information

Name : VFMJ11_A0243 (VFMJ11_A0243)
Accession : YP_002157800.1
Strain :
Genome accession: NC_011186
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : integral membrane protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG2194
EC number : -
Position : 276644 - 278272 bp
Length : 1629 bp
Strand : +
Note : identified by match to protein family HMM PF00884; match to protein family HMM PF08019

DNA sequence :
ATGCTTGTTTTGTCTAATCTGATCTCAAAAATTAAAAGCCATAAAATATCGATGAATATGGTGTCACTTATCACGATAGT
TTCACTTTATTTTGCTGTGGTATTTAACTATCCAATCAATGAAAAAATTTATCAACTCTCACAAGGACAAGAGGTTTTTC
TCTTTTTAACGCCGGCGCTGCTTACTTGTGCTTTTATTATTATCTTCTCCTTTATTGCTTTTCCTTATGTGTTTAAAGGT
ATTGTCGTTGTATTGACCATAACGTCTGCTATGGCGTTTTATGCAGCTCTTCAATATAACACCATGTTTGATTACGCAAT
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TTGGACTTATTCCATCGATTTTATTATTGAAAGTGAATATTGTGCGTCATGCCTCTTGGTTAAAAGAGCTTTTTCATCGT
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TAATAATTCCTATTTAAATAAAATGATTAACCCTGCTGATGCATTTAATACTGTTAAATACATTAAAAATGAATACCTGA
CTGCACCTTTAGAGTACATCACGATTGGAGAAGACGCCGTTGTTACCCCTGCTAAAAATGGCAAACCAACGTTAATGGTT
ATTTTAGTTGGTGAAACGGCTCGAGCACAGAACAGTGCTTATAACGGTTATGAAAGAGAAACAAACCCATATACAAAAGA
CCTTGGGTTAATTACTTTTCAGAATGTGACTTCTTGTGGAACCGCAACGGCACACTCTTTACCTTGTATGTTCTCTAATA
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GCAGTATGGATTGATAACGATGGTGGTGATAAAGCAGTAGCAAAAAATATCGAAAAAGAGATGATTACGGATCATTCAGA
ATCTAACTTATGTAATGGTTCGAGCTGCTATGATGAAATTTTATTAAAAGGATTGGATAAACGAATTGCAAAGGCACAAG
GTAACCAAGTGTATGCTCTGCATATGATAGGAAGTCATGGTCCTACTTACTGGAAGCGCTATCCAAAAGAGATGGCGGTG
TTTGGTCCTGCATGTAACCGCAGCGATATTGAGAATTGCAGTGATGCCGAAATAACGAATGTATATGATAATACCTTGGT
TTATACCGATTATGTTATAGCTCAAACGGTTAAAAAATTACAAAGCTATTCAGATAAATACAACGTAGTTATGCTTTATA
TTTCTGACCATGGTGAGTCATTAGGAGAGAATGGACTTTACCTTCATGGCGCACCTTATATGATGGCACCTAAAGAGCAA
ACTCATGTGCCATGGTATATCTGGATGAGTGATGATTATGCAAATCAAAAAGGTATTGATAAAGCGGCGGTAATCGATAA
TTCAGCAACGGGTGATTATTCACATGATAATTTATTCCATACTATTTTGGGCTTATATGGTGTAACAACAAAAGCCAAAG
ATAATGCGTTAGATATTATGGCAAATTAA

Protein sequence :
MLVLSNLISKIKSHKISMNMVSLITIVSLYFAVVFNYPINEKIYQLSQGQEVFLFLTPALLTCAFIIIFSFIAFPYVFKG
IVVVLTITSAMAFYAALQYNTMFDYAMIENIFETNVDEASSYLSSASIGYLIVFGLIPSILLLKVNIVRHASWLKELFHR
AILMSVAIVGLLLISVFYFKDYASIGRNNSYLNKMINPADAFNTVKYIKNEYLTAPLEYITIGEDAVVTPAKNGKPTLMV
ILVGETARAQNSAYNGYERETNPYTKDLGLITFQNVTSCGTATAHSLPCMFSNMTRTSYNKDRANNQDNALDVLTHAGVK
AVWIDNDGGDKAVAKNIEKEMITDHSESNLCNGSSCYDEILLKGLDKRIAKAQGNQVYALHMIGSHGPTYWKRYPKEMAV
FGPACNRSDIENCSDAEITNVYDNTLVYTDYVIAQTVKKLQSYSDKYNVVMLYISDHGESLGENGLYLHGAPYMMAPKEQ
THVPWYIWMSDDYANQKGIDKAAVIDNSATGDYSHDNLFHTILGLYGVTTKAKDNALDIMAN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
Z1140 NP_286675.1 hypothetical protein Not tested TAI Protein 1e-101 43
Z1579 NP_287083.1 hypothetical protein Not tested TAI Protein 1e-101 43