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Name : VFMJ11_A1089 (VFMJ11_A1089) Accession : YP_002158637.1 Strain : Genome accession: NC_011186 Putative virulence/resistance : Unknown Product : nucleoside permease NupC Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG1972 EC number : - Position : 1209454 - 1210674 bp Length : 1221 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF01773; match to protein family HMM PF07662; match to protein family HMM PF07670 DNA sequence : ATGTCATTATTCATGAGCTGTGTTGGAATCTTGGTGCTATTGTTCATTGGATTTTTGCTATCCGAGAATAAAAAAGCCAT CAATGTAAGAACGATTGTCATTGCGCTTATTACTCAAATATCATTCGGTGCTTTTGTAATGTACGTTCCTTTAGGTCAAG GAATACTACAAATGATGAGTGATGCCGTTAACCATATTATTAATTTCTCAAATGAGGGATTAACCTTCGTATTTGGCGAT CTCGCTAACTATAAAGTCGGCTTTATTTTTGTAATTAACGTTCTTTGTGTCGTTATCTTTATTTCTGCTCTTATCTCCGT GCTTTATTACCTCAAGATAATGCAGTTCGTAATTAATTTAATCGGTGGTGCGTTATCTAAATTGTTCGGTACGAGTAAGG CGGAATCAATGTCTGCTACAGCCAACATTTTTGTTGGTCCTATCGAAGCGCCTTCAATGGTACGTCCGTTAATCAAAAAA ATGACTCGCTCTGAACTGTTTGCGGTAATGACAGGCGGATTAGCAAGTGTTGCTGGCGGTACAATGATTGGCTACATCAA TTTAGGAATAGACCCAAAGTATATTTTAACCGCTTGCTTTATGACGGCTCCTGCTGGACTTCTGTTTGCCAAATTACTTT GCCCACAAACAGAACAAGAAAAAATCACTAATGAAATCGAAATCGATGATGAAACCACACCTAAATCACTCTTAGATGCG ATAACTGATGGTTCTATCATGGGGATGAATCAAGTCGCCACCGTGACAGCCTTACTTATCTCCTTTGTTGCTTTGATCGC ATTAGTAAATAGCTTAGTTGGCGGTATTGGTGATTTAATCTCGATTGAAGGTTTAAGCCTAGAACTGATTATCGGTTATA TATTATCTCCTCTGGCTTTTTTAATGGGAGTTCCTTGGAGCGAAGCCGTTACCGCAGCATCACTAATTGGCCAAAAAATT GCGGTTAATGAGTTTGTTGCCTATATCAACTTTATTGAAATAGCGGAAACCTTATCTCCAAAGACTCAAGCTATTGTTGT ATTTAGCCTTTGTGGTTTTGCCAACATTGGTTCTTTAGCGATGGTTATTGGTGGCCTTGGTGCTATATGTCCAAATAAAC GCCATATTCTTTCGGAAATTGGACCTCGTGTTTTAATGGCCGCAATTCTTGCAAACTTAATGTCAGGTACCATTGCTGGT GCGCTTCTTTCATTTTCTTAA Protein sequence : MSLFMSCVGILVLLFIGFLLSENKKAINVRTIVIALITQISFGAFVMYVPLGQGILQMMSDAVNHIINFSNEGLTFVFGD LANYKVGFIFVINVLCVVIFISALISVLYYLKIMQFVINLIGGALSKLFGTSKAESMSATANIFVGPIEAPSMVRPLIKK MTRSELFAVMTGGLASVAGGTMIGYINLGIDPKYILTACFMTAPAGLLFAKLLCPQTEQEKITNEIEIDDETTPKSLLDA ITDGSIMGMNQVATVTALLISFVALIALVNSLVGGIGDLISIEGLSLELIIGYILSPLAFLMGVPWSEAVTAASLIGQKI AVNEFVAYINFIEIAETLSPKTQAIVVFSLCGFANIGSLAMVIGGLGAICPNKRHILSEIGPRVLMAAILANLMSGTIAG ALLSFS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 9e-71 | 44 |
