Name : VFMJ11_0156 (VFMJ11_0156) Accession : YP_002154927.1 Strain : Genome accession: NC_011184 Putative virulence/resistance : Unknown Product : tyrosine-protein kinase wzc Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3206 EC number : 2.7.10.2 Position : 172774 - 174936 bp Length : 2163 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF02706; match to protein family HMM TIGR01007 DNA sequence : ATGTCACAAGCAATCAACACTACCCGTGATACCTCTACCTCTGATGAAATCGATTTAGCAAAACTGTTTGGTCAGCTAAT TGATGGTCGTTGGCTTATTCTTTCTATTACCACTTTATTTGCCATTGCGGGTATTGTGTTCGCACTTTTATCGACACCCA TTTATAAAGCCGATGCCCTTGTTCAAGTAGAGCAAAAAAGTAACGGTGGCATGTCAGCACTTGTGGGTGATATGGGGGAA ATGTTTGCCTCTGAATCATCATCAACCACTGAAATTGAGATCATCAAATCACGTATGATCTTAGGTGATACTGTCGATGC CTTGAACCTAACAACCATCGCCTCTCCACAATACATGCCTATTATTGGCAAAGGGCTGTCTCGTTTAATGGGTGAAGAGA AAGCGATTAAAGTAAGTCGCTTTGATATTCCAAGATACGTAGATAAGCCGAATTTCATTGTAGTTTTAGATAATGCCGAA CAAGGCACTTACACCTTATTTGATGGACAAGAGCGAAAAATCCTAGCAGGTAAAGTGGGTGTACTTGCAGAAAAAAACGA TTACCGCATGTTTGTTATGCAATTAGGAGGCAACAGTGGTGACGTATTTGAAGTGTCTAAAATTTCTCGTTTTGATGCAA TTTTAGCGTTACAACAATCTCTATCTATTAGTGAAAAAGGCAAGCAATCAGGTGTATTACAGTTTTCTCTAGAAGGTGAA AACAAAGCACAAATTGAAGCGATTATTAACGACGTAAGCCAAAATTACTTTTTACAAAACATTGCCCGCAACAGTGCAGA AGCAGAGCAAAGCCTTGAATTCTTGCAAGCCCAACTTCCTGCCATTAAAGATAAGCTGACTACCTCTGAAAATGTATTAA ATGATTTTAGATTAGAGCGAAAATCCGTCGATCTAAGTTTAGAAGCTCGCTCAGCATTGGATGTGCTAGTAAAGCTAGAA GCGCAATTAAATGAACTGACTTTTAAAGAGAGTGAAATTAGCCAACGCTTTACTAAAGATCACCCCGCTTACAAATCATT AATTGATAAACGCAAAGTTTTATTGGCAGAGAAAGAACGTTTAAACGGACAAGTACAAAAGCTACCAAAAACCCAACGAG AAGTACTGCGCATGCAACGTGATGTAGAGCTAAATCAAGAGATCTACATTCAGCTACTGAACAAAACCCAAGAATTAAAC ATAGTGAAAGCCGGTACCGTAGGTAATGTGCGTATTTTAGATACCGCACAGGCTTATACTCATGCAGTAAAACCGAAAAA ACCGTTAATTGTGGTATTAGCAACCTTGTTAGGCGGCATGTTAAGTGTAGCTATTGTGTTACTTAAAGCGGCACTCCACC GTGGTGTAGAAAACCCAGATGAGATTGAAGCCTTAGGGATTCCTGTTTATGCCAGCATTCCAAAATCAAACTGGCAAGAA AAGCTAGATATTCGCTATAACAAAAAGAAAGTGAAACATTTAGAGACGCTATTAGCAGAATCTAACCCTGCCGATTTATC CATTGAAGCACTGCGTGGCCTGCGTACCAGCATGCACTTTGCCATGATGGAAGCCAAAAATAACGTAGTGATGATAACCG GTCCTGCACCAAATATTGGTAAGTCGTTTGTGGCAGTAAACTTTGCTGCAGTTATTGCCAAAACAGGCCAAAAAGTATTG GTAGTGGATGCCGATATGCGTAAAGGCTATATGCAACGTTACTTTGGTATGAAGTGGGATGACGGCTTATCAGATTATCT ATCAGGCAAATTAAGTTTAGAAGAGTCGATTCAAAAATCAGAAGTGCCAAACTTAGATGTACTAACCCGTGGGCAAGTGC CGCCAAACCCATCTGAACTATTAATGACTAAACGCTTTAGTGATTTTATTGATTGGGCTTCAGAAAATTACGACTTAGTG CTGATTGATACACCACCAGTGCTAGCTGTAACTGACCCAAGCATTGTAGGGGCACTAGCTGGCACAACATTAATGGTGGG GCGTTTTGACCAAACCTCAGTTAAAGAAATTGATGTAGCAAGGCATAGATTTGAACAAGCAGGGATAGAGGTGAAAGGCT TTATCTTGAATGCCGTAGAGAAGAAAGCAAGCAGTACGTATGGCTATGGTTATTATAACTACAGTTATGATAGTGATAAA TAA Protein sequence : MSQAINTTRDTSTSDEIDLAKLFGQLIDGRWLILSITTLFAIAGIVFALLSTPIYKADALVQVEQKSNGGMSALVGDMGE MFASESSSTTEIEIIKSRMILGDTVDALNLTTIASPQYMPIIGKGLSRLMGEEKAIKVSRFDIPRYVDKPNFIVVLDNAE QGTYTLFDGQERKILAGKVGVLAEKNDYRMFVMQLGGNSGDVFEVSKISRFDAILALQQSLSISEKGKQSGVLQFSLEGE NKAQIEAIINDVSQNYFLQNIARNSAEAEQSLEFLQAQLPAIKDKLTTSENVLNDFRLERKSVDLSLEARSALDVLVKLE AQLNELTFKESEISQRFTKDHPAYKSLIDKRKVLLAEKERLNGQVQKLPKTQREVLRMQRDVELNQEIYIQLLNKTQELN IVKAGTVGNVRILDTAQAYTHAVKPKKPLIVVLATLLGGMLSVAIVLLKAALHRGVENPDEIEALGIPVYASIPKSNWQE KLDIRYNKKKVKHLETLLAESNPADLSIEALRGLRTSMHFAMMEAKNNVVMITGPAPNIGKSFVAVNFAAVIAKTGQKVL VVDADMRKGYMQRYFGMKWDDGLSDYLSGKLSLEESIQKSEVPNLDVLTRGQVPPNPSELLMTKRFSDFIDWASENYDLV LIDTPPVLAVTDPSIVGALAGTTLMVGRFDQTSVKEIDVARHRFEQAGIEVKGFILNAVEKKASSTYGYGYYNYSYDSDK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 2e-158 | 46 |