Gene Information

Name : SNSL254_A4606 (SNSL254_A4606)
Accession : YP_002043513.1
Strain : Salmonella enterica SL254
Genome accession: NC_011080
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG1340
EC number : -
Position : 4473642 - 4490321 bp
Length : 16680 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCCGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAAGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAA
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TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTGCAGATGATAAT
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GCTTGCATCAGGTTTATGTCAAGGTTGAGGACATTGCGGGTAATAAAGCGAACAGCGCGGTATTCGATTTTACTATCGAT
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGCGTGAAAGGCGATAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
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GGAAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAAGCGACTGATAAAGCAGG
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ACACCGGCATCCAGGGCGATAACATGACGAATAGCACCCAGCCGACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTT
CGCGTTACGGTCAGCGTAGAGCATGGCGGCGTCACCACCACATTTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGAGCTTTAC
GCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGAT
AATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGACGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGG
CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGCCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAAGACGACGCAGGAACTTGATTTCACCATCGATACC
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GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTGATAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGACAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCTGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCATATCGCCATTGA
CCGTATTGAACTGGTTAACGACAGCGGTATCCCCGACGATAATCTGACCAATGAAGCGCGCCCGCACTTTCAGGTGACAG
TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGCATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTATACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCAACCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCACCATCGATACCATTCTGTCAGAACCGACGATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCAACTATACGCTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAACTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
CATCAACTGGGTTAACGCAACGCTGACGTCTGACGGCGTTTGGGAGTATATATGGCCGACAGATCTGGTCGAAAATACGT
ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCGCCATTGACCATAT
TGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGA
CTGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCGACCCAGAGCGCGACGCCGGGTGTC
TGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAA
AACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACTCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTGCAGCATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTAACACC
GACCGGTACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACAGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGCTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTTAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACCACG
CTGTCAGTGCCGGTCATCGTACTGAATAGCGCGGACGATACCGGTGTCCAGGGCGATAACATGACCAATAGCACCCAGCC
GACATTTGCCCTGCAGCATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGGCGTAGGCGGATGGAGCTTTACGCCGACAGGGGCGTGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTGCATCGTTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
CATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGAAGGTAC
CGACGGATGTTAACGAGGTACGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGC
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CCAGACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCATGCTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGCGAATAAGCCGACGTTTATACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAGTATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATATGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCGGGGAACGTAAAATACTCAG
CGCCGCTGACGGTCACGGTTGATACCCAAATCACCATTGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
CTGTCAACGCCTACCATCACTATGGATAGCAGGGACGATACAGGTGCCATTGGCGATCATATTACGAGCGTCAAAAGACC
GGGCTTTACCATTGGCAATATTGACTCCGATGCGCAATCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAG
TGACACTAACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACACTGACGGTA
GAGGTAACGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGATAGTGACGGTAGATACGCAAACCAGCATTACTGA
TATTACATTGGTCAATGATCATGGCGTGCCTGATGACAATCTAACTAACAGCACCCGTCCGCAGTTTGAGATCACGGTGC
CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGGCGCAGGGTATTGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACTATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACCGCGACACAGGGGGCTGGAGGCTGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCATATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTG
ACAAAACATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATCGACGGCGGCAC
GACCTGGGTTACCGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
ATACCCTGACCGTGGAAGTGACTGACGGTGCGGGTAATAAGATGACGGAGACGCTCAATTTCACTATCGACATCACGTTG
ATGACGCCAACCATTGAGCTGGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
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TGGTACTCACCGAATCAGCCGACGGCTGGCGCTATCGACCGGATTCTGCTTTGGCGGACGGTAGCTACACATTCACCGTG
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ACCAATGGTCAATGGCGCTTTACGCCTTCTGCGAGCTGGGCTGATGGCTCATATCAGTTAGCCGTTGTGGTGGAAGATCT
GGCGGGGAATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGACACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACTGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTC
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CCCGAATACTCTGGTTGACGGCACATATACCCTTCGCGTAGAGGCCACGGATGAGGCAGGTAATATTGCGAATAAAGATT
TAGTATTTAATATCGATACTAATATACAGGTTCCGACTATTGCTTTAGACGCAGGACAAGATACCGGAGCGAATACAGCC
GATAATATCACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACGCCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
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AAGGAGGGGATGGCCGCTGGATATTTAATGTCGGTTCGGCATTACCTGATGGGCAACACACTCTCTTGGTTGATGTGACT
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GGCAGGTAATAAATGGCTGTTTACCCCTGATACACCGTTAGTGGATGGAACTTACAAAATAGAAATAGTGGCTGAAGATA
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GCGGATGATACTGGCGAAAGCGCTGTTGATAATATTACGAGTGTCACTAAACCACGTTTCGTTATTGGCAATGTACCCGC
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AAGCTGCCCTTTACCATTGATACCACGACAAGCGTCAGTGTCAGAATGGAGCCAGCGTCTGATACCGGAAATTCCAATAG
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ACGATAAGTCAGGTCGGGAGGTTTTAAAACAAACGATTACGGTTGGCGCTGATGGCAACTGGAGTGTGACGCCGAATATA
CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGTTTGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCCGCAAAC
GCCAATGCGAATGGCGAATGGAGTTGGACGCCGCCATCAGTATTAGCGCCAGGCTCCTATGTTGTGAGCATTGTTGCCAA
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AGCTCAGCGAGGAGAGCGATAGTGGTGCCTTAGGAGACTTTACCACGAATAATAAAACGCCGACCCTGGTTGGGAACACG
TTACCTAATGCGATTGTGAGTATTTATGTGGATGGCGTGAAGGTCGGCGAGGCGACAGCGGATACAGCGGGTCGATATAC
TTTCCAGTTATCGGAAATGAAAGATGGCCATTATGTCGTCCAGGTGGGTATCGTCAACCCTCGCGATAATAGCGAACTGC
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AAAAGCGATTGCTTATACGACAGGCGCAGGACACTGGGGCGTAGTATTACCTGCTTTGGGTAATGACGGTAATTATGTAT
TAACGTTTAAAGTTGAAGATGTTGCCGGCAATATCAGAGAGTTTGGTCCGCAGAATGTGATACTGGATACGGTAATTTCG
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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GCAACTCTGGTTCACTTGACGATCTGATTACTAATCACAACAAGCCTGTGTTAGTTGGCACCGCAGAAGCGGGAGCCACA
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AGTATAACGAGTCAGACCCGGCCTACGTTTAGTATTTCTGGAGAAATGAACCAGAGTGTTCAGATTTTCATTGATGGGGT
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CACGACACGTAACTTATTGTTTAGTGGCAGTGCCGAGCCCAATAGCAAAATAGAAATCATCATTAATGGCTTAAATGTGG
GGGAAGTTTGGGTTAATGACAAAGGCCACTGGCAGATGCCGGTGAACCCGCTTTATTTCACAGAAGGCCAGCTGGATATC
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TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTA
TGGGGGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGCTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAG
TGGGAGTTATCGACCGATCAGCTTCCGGAAGGGAAATACGATATCACTTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAA
GGAAGAGGTACATGAAATATTTATTGATCGAACGCCGCCAAACGCTCCGGTCGTAACTTATTCAGATATTGTCAACGATC
TAATTATTATGCAGGGGACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACC
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TGGTAACCGGAGTGATGATGTCCCTCTCGATATCATGAAAGAGGTTCCCGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAAGCAACCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTCGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTATACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACCGTTA
CGATCGACAGTACGCTGACCGTGCCGGAGATTGCGCTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGCTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAA
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ACTACACGCTGAGCGTGACGGTGGTGGATCGCGCGGGGAACTCACAGCAATCTGCTTCGCTAGCGGTGACGGTTGACTCA
ACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTC
TGAAACAGTGAATGCCGAAAGCGCTACGCATCTTCGTACAGTGCCGTCTGCGGCGGAAGAAAGCGTGGTGAAGGAGACAG
CCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATA
TCAGTACCTGAGAATATTGTTAATGTCAGTATTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGC
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Protein sequence :
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DLKDIQLERIDSSLVDSAQVEKKGNGKRRNKKEEEELKKQLDDAENAKKEADKAKEEAEKAKEAAEKALNEAFEVQNSSK
QIEEMLQNFLADNVAKDNLAQQSDASQQNTQAKATQASKQNDAEKVLPQPINKNTSTGKSNSSKNEENKLDAESVKEPLK
VTLALAAESNSGSKDDSITNFTKPQFVGSTAPNATVIIKINGIAVGQAVADSLGNFTFTAPETLTDGTYNLEAEAKTADG
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KTEPNAIISVINSETGEEVIFKANDKGEWTFNFTSDSVEGINNLTFTVEDVAGNKKDFSFSYVIDTIAPVPPTVSLEDYV
VLPNGIILSGNDLPALVGTAEPKSTILLMRDGKLYDSIEVDSNGTWNYQFSNKFLQGAYDIEIISQDAAGNKSSTVKYSF
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DDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 99
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
SNSL254_A4606 YP_002043513.1 hypothetical protein VFG0581 Protein 0.0 99