Name : lysU (ATP_00096) Accession : YP_002004136.1 Strain : Candidatus Phytoplasma mali AT Genome accession: NC_011047 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 125686 - 127179 bp Length : 1494 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACGTATAAAACATCAGAACAATATATTATAAGAAGAAAAAAAATTGATCATTTAAAAAAATTAAAAATAAATCCTTT TGGAAATAAATTTATCCGTACTCATTGTATAAAAAATATTATAGAAGAATTTCAAAATTATGATAAATTAGATTTAGTAA AAAAAAATGAACAAGTTACTATAGCTGGACGAATAATTTTAAAAAGAGAACAAGGTAAAGCCGGGTTTTTACATTTACAA GATTATCATTATAAAATTCAAATTTATATAAAATTAGATTTAATAGGTGATAAAGCTTTTGAATTATATAAAAATTCGGA TTTAGGTGATATTATTGGCATTAGCGGTATATTATTTAAAACTAAAACTAATGAATTAACTATTAAGGCTAATGACTTTA TACATTTAACAAAAGCTCTATTACCGTTACCTGATAAATACAAAGGATTAAAAAATAAAGAAATTATTAGAAAACGTCGT TATATTGATTTAATAATGAATTCAAAAACACGTGAAATTTTTTTTCTTCGTAGTCAAATTATTAAAAATATAAGAAATTT TTTTGATAATAAAAATTTTTTAGAAGTAGAAACACCTACATTACAATCCATTTTAGGAGGAGCAACAGCAAAACCTTTTG TAACATATCATAATGATTTAGAAAGTAATTTTTATTTAAGAATAGCAACAGAATTATCACTAAAAAAATTAATTGTGGGT GGTTTAGAAGCAGTTTATGAAATTGGAAAAGTTTTTAGAAATGAAGGAATTGATGCAAGTCATAATCCTGAATTTACAAG CTTAGAAATTTATTTAGCTTTCGCCGATATGAGAGATATGATGAATTTAACTAAACAATGTTTAAAAGATGTTTGTAAAA AAACTTTAAAAACTTTGGAATTTAAATATCAAAATCATATTATTAATTTTAATAAATTTGAAGAAATACATATTTTAGAT GCTATTAAACAAAAAACTGGAATTAACTTTTGGAATGATATGAACTTAGAAACTGCTAAAAATTTAAGTTTGCAACATCA AATAAATATTTTACCTCATTTTAGTATAGGACATATCATCGAAGCTTTTTTTGAAAAATATGTTGAAAAAGAATTAATTC AACCTACATTTATTTATGGCCATCCAATAGAAATTAGTCCTTTAGCAAAAACTAATCAAAAAGATAAAAGATTAACAGAT CGTTTTGAATTATTTATAGTAGGAAAAGAATTTGCAAATGCATTTAGCGAATTAAATGATCCTATAGAACAAGAAAAACG TTTTTTAAATCAATTAGAACAAAAAAAATTAGGAAATCAAGAAGCAAACGAAATGGATCTAGATTTTATTGAAGCCCTAG AATATGGTATGCCACCTACTGGAGGTATGGGTTTGGGGATTGATAGATTAGTAATGCTTTTAACTAACGTAGATAATATA AATGATGTAATTTTATTTCCACACTTTAAAAATCAAAAAAAAGAAGATGTATAA Protein sequence : MTYKTSEQYIIRRKKIDHLKKLKINPFGNKFIRTHCIKNIIEEFQNYDKLDLVKKNEQVTIAGRIILKREQGKAGFLHLQ DYHYKIQIYIKLDLIGDKAFELYKNSDLGDIIGISGILFKTKTNELTIKANDFIHLTKALLPLPDKYKGLKNKEIIRKRR YIDLIMNSKTREIFFLRSQIIKNIRNFFDNKNFLEVETPTLQSILGGATAKPFVTYHNDLESNFYLRIATELSLKKLIVG GLEAVYEIGKVFRNEGIDASHNPEFTSLEIYLAFADMRDMMNLTKQCLKDVCKKTLKTLEFKYQNHIINFNKFEEIHILD AIKQKTGINFWNDMNLETAKNLSLQHQINILPHFSIGHIIEAFFEKYVEKELIQPTFIYGHPIEISPLAKTNQKDKRLTD RFELFIVGKEFANAFSELNDPIEQEKRFLNQLEQKKLGNQEANEMDLDFIEALEYGMPPTGGMGLGIDRLVMLLTNVDNI NDVILFPHFKNQKKEDV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-88 | 44 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
lysU | YP_002004136.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 9e-89 | 44 |