Name : leuS (ATP_00446) Accession : YP_002004474.1 Strain : Candidatus Phytoplasma mali AT Genome accession: NC_011047 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 531044 - 533479 bp Length : 2436 bp Strand : + Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : ATGAGAAATGTTTTATATGATTTTAAAAAGATAGAGTACAAATGGCAACGTTATTGGCTTGAAAATAAAGTTTTTAAAAC TTCTGATAATTTTGATAAAAAAAAATTTTATTGTTTAGATATGTTTCCCTATCCCTCGGCCGAAGGTTTACATGTAGGTC ATATTGAAGGTTATACGGCCAGCGATATTTTTAGTCGTTTTAAAAAAATGCAAGGATATAATGTTTTACATCCTTTTGGT TGGGATTCTTTTGGTTTACCAGCTGAACAATATGCTTTAAAAACTGGCAACAATCCTAGAAATTTTACTTATGAAAATAT TAAAAATTTCAAAGAACAAATTATTAAAATGGGAAAAGGTGTAGATTGGGATAAAGAATTAGCTACTTCTGATAACGATT TTTATCATTGGACGCAATGGATTTTTAAGAAATTATATCAAAAAAATTTAGCAGTTTTAAAAGATTTAGAAGTTAATTTT TGTGAAGGATTAGGAACTGTTTTAGCTAATGAAGAAATAGTTTCTAAAGATGGTAAACTTTTTTCCGAAAGAGGCGATTT TCCGGTTGTTAAAAAAACCTTAAAACAGTGGGTTTTGAAGATTACTGATTATGCAGAAAGGCTTTTAGATGATTTAGAAC TTGTTGATTTTCCTTCAAATTTAAAACAAATTCAACGTAATTGGATTGGAAAATCTAGTGGAGTAATCATTACTTTTAAA GTTGATGGTTTTTCGGAAACTTTCGATGTTTTTACTACTCGTCCTGATACTATTTTTGGCGTTACATGTTGTATTTTAGC GCCAGAACATATTTTAGTTAAAAAAATAACTAAAACTTTATTTCAAAAATCCATTTTTGATTATATTGAACAAACTAAAC AAAAACAAGAACTAGAACGATCTATTGATAAAAATAAAACAGGTGTTTTTACTGGTTCATACGCTATTAACCCTGTTAAT CAAAAAAAAGTACCAATTTGGATTTCAGACTATATTTTACCTCATTATGGGACTGGTGCTTTAGCAGCTGTTCCAGCACA TGATCAAAGAGATTTTGAATTTGCTAAAAAATATCAATTAGAAATTATTTCTGTAATTAAAGATAAAGATAATCAAATAC AAGAAGTTTTTTGTGGTGACGGAATACATTTTCAAAGTCATTTTTTAGATGGTTTAACTAACGAAACAGCTAAAATAAAA ATTATTGAATTTTTAGAAAAAAATAAATTAGGTTATATTCATAATATTTATAAATTGCATGATTATTTTTTTTCACGTCA AAGATATTGGGGAGAACCTTTTCCAGTATTTTATGATGAAAAAGATAATATTCATTTACTTTCTGATGAAGAATTGCCTT TAGAATTACCTTATTTAAAAGATTTTAAACCTTCTAATAATGCAAAAGAGGCTCCTCCTTTATCGCGAGTTAAAAATTGG ATTTATTTTGAAAAAAATGGTAAAAAATATCGAAGAGATGCTAATACTATGTCACAATTGGCTGGTAGTTCTTGGTATTA CATAGCTTATATTTTGAAAAATAGTTTAGGCATGTTACCTTTAAATACTTTGGATTCTAAAAAAAAAATAGATTATTTTT TGCCTGTTGATTTATATATTGGAGGAGCTGAACATTCAACTGGTCATTTATTATGTGTTCGTTTTTGGCATAAAGTTTTA TATGATTTAGGTTTAGTTTCTACTAAAGAACCTTTTAAAAAAATTATTCATCAAGGTATTATTTTAGGTAATGATAATAC TAAAATGAGTAAATCTAAAGGTAATGGTGTTAGTGCTAAATTAATGTTAGATCAATATGGAGCTGATGTTTTAAGATTAT ATGAAATGTTTTTAGGTCCATTGAGTGATACAAAAATTTGGTCTTATAAAAATATTAAAGGTTCTATTAAGTTTTTGGAA CGTGTTTATAATATTTTTAATTTTGAAATTACAACAATTAATCAAAAAGAGTTAGAATTTTTATATCATACCACTGTTAA AAAAGTAACTGATTTATATGAAAAATTAAAATTTAATGTAGCGATAAGTCAGTTAATGATTTTTGTTAATGAAGTTTATA AACATAAAAAAATTTCTAAATACCAAGCAAGAGGTTTTTTAAAATTATTAAATCCTATCGCTCCTCATTTAACAGAAGAA TTAAATCAATTATTTTTAAATGAAAAACCAATATGTTTTTCTTCTTTCCCTTCTTATGATGAAAGTTTTTTATCTTTAAA AAATGTAGAAATTATAATTCAAATTAATGGTAAGTTACGTTCAAAAATTACTAGTTTAATGAATGAAAGTAAAGAAAATA TTTTAAAAATAGCTTTACAAGATGCTAAAATTATTAATTATATTCACCATAAACAAAAAATTCAAAAAATAATTTTTGTT AATAATAAATTGTTAAATATTGTTTTAAAAAAATAA Protein sequence : MRNVLYDFKKIEYKWQRYWLENKVFKTSDNFDKKKFYCLDMFPYPSAEGLHVGHIEGYTASDIFSRFKKMQGYNVLHPFG WDSFGLPAEQYALKTGNNPRNFTYENIKNFKEQIIKMGKGVDWDKELATSDNDFYHWTQWIFKKLYQKNLAVLKDLEVNF CEGLGTVLANEEIVSKDGKLFSERGDFPVVKKTLKQWVLKITDYAERLLDDLELVDFPSNLKQIQRNWIGKSSGVIITFK VDGFSETFDVFTTRPDTIFGVTCCILAPEHILVKKITKTLFQKSIFDYIEQTKQKQELERSIDKNKTGVFTGSYAINPVN QKKVPIWISDYILPHYGTGALAAVPAHDQRDFEFAKKYQLEIISVIKDKDNQIQEVFCGDGIHFQSHFLDGLTNETAKIK IIEFLEKNKLGYIHNIYKLHDYFFSRQRYWGEPFPVFYDEKDNIHLLSDEELPLELPYLKDFKPSNNAKEAPPLSRVKNW IYFEKNGKKYRRDANTMSQLAGSSWYYIAYILKNSLGMLPLNTLDSKKKIDYFLPVDLYIGGAEHSTGHLLCVRFWHKVL YDLGLVSTKEPFKKIIHQGIILGNDNTKMSKSKGNGVSAKLMLDQYGADVLRLYEMFLGPLSDTKIWSYKNIKGSIKFLE RVYNIFNFEITTINQKELEFLYHTTVKKVTDLYEKLKFNVAISQLMIFVNEVYKHKKISKYQARGFLKLLNPIAPHLTEE LNQLFLNEKPICFSSFPSYDESFLSLKNVEIIIQINGKLRSKITSLMNESKENILKIALQDAKIINYIHHKQKIQKIIFV NNKLLNIVLKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 50 |