|
Name : nrdA (ATP_00187) Accession : YP_002004224.1 Strain : Candidatus Phytoplasma mali AT Genome accession: NC_011047 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : - Position : 240542 - 243034 bp Length : 2493 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATAAAAATTGTTTATGATGGTTTAAAACATGGTCAAGTTTATAATATGGCTAAAAACTTAAATTATTCTTTTTATCA CGTAAAAGAATATTTATCTAATTTAGAATTGAAAGAACATTTAATAAGTGGTCTTCCAATTTTTCTTATTACTAAAAGTG TGAATTTTGGTGAAATTCCAAAGGAAACTAAAATTTTTTTAGATAAACATTCTGCTTCTACTATAGGTGTTGCTGTTTCT GGAAATAAAAATTGGGGTTCTAATTTTGGTAAAGCGGGAGATTTAATTGCTTCTAATTTTAGTATTCCTTTGGTTTTAAA ATTTGAAGGTAGTGGTTTTGATGAAGATGTTTTGTATTTAAAAAAATGGTTATCTGATTATATTTATAAAAATGGTCAAA AAAATGTCATTCCTAAGTGGATTATGTTAAATAACCAAGTTATTGATGAAAATGGGAATATTAAAGATTTAACCAAAGAT CAAGAAGCGTTAGAAATTTATTTTAAAGAAGAAATAAAGCCTAAATTAAAATATTTTTATAGTTTAAAAGCTAAAATAGA TTATTTATTAGAAAATAATTATTATGAAAAAGATTTTTTTAATCATTACACTTATGAACAAATAAAAACTATTTATCAAA TAGCTTATGCAGAAAAATTTCAATTTGCTAGTTTTATGGGTATTTTTAAATTTTATAATGATTACGCTTTAAAAAATAGA AATAAAACAAAATATTTAGAAACTTATGAAGATCGTTTAGTTGTTAATGCTTTGTATCATGCACATGGTAATTTTATACT TGCTAAAAAATTAATAAAATCATTAATTCAACAAAATTTCACTCCTGCGACTCCAACTTTACTTAATAGCGGAAAAAAAT ATCGTGGCGAATTTGTTTCTTGTTTTTTAATTGAAGGTGGCGATTCTTTAAACGATATTGCGCGTATTTTTGAATTTTCT ATGCAACTTTCAAAAATTGGTGGCGGAGTTTCAATTAATTTGAGTAATTTACGTGCCAAAGGAGAAACAATTAAAAAAAA TGCCAATGTTTGTAAAGGGGTAGTTGGGGTTTGTAAGTTACTTGATCATGGGTTTAGATATGCTGATCAAATGGGTCAAA GAAATGGTGCTGGCGCGGTTTATTTAAATGTTTTTCATGCTGATATTAAAGATTTTTTAAATACTAAAAAATTAAATGCC GATGAAGATGTGCGAGTTAAAACTTTATCTCTAGGAGTTGTAATTCCTGATAAAATGTTAGAATTAGCTAAAAATAATGA AATGATGTATATATTTTATCCTCATACTGTTTTTTTAGAATATGGTCAAAATTTTGCTGATATTAGTATTAATATGGATT ATTGGTATGATATTTTAGTCAAAAATTCAAAAATTAAAAAGAAAATCATTAATCCGCGTAATTTATTAGATTTAATTGCC CAATTACAAGGCGAATCAGGTTATCCTTATATTATGTATTGTGATAATGTCAATAAAAATAATATGTTGAATTTACCAAT TAAATTTTCTAATTTATGTACCGAAATTTTACAACCAACGATTACTTCTCATTATGCCGATTATGATAAAAGAGAAGAAG ATAGAATTGGAATGGATATTTCTTGTAATTTATCTTCTGGTCACATGGGTAATATGATTAAAAATAACTCAATCAAAGAA ACAGTATTTATGGCTATGGAAGTAATGAATTCCGTTGCTTTAAATACTGATATTGCTTATGTTCCTGGAGTTGCTAAAGC TAATCGTTTAAATCGTAGTGTTGGTTTTGGCATTATGGGACATCACGAATTTATTGCAAAAAATTTTATTTTTTTTGGTA GTGAAGAAGATTTAGATTTAATTGACGTATTTTTTAACGCAGTTAATTATTATAGTCTACTACATTCAATGCAAAAAGCT AAAACTACTGGTCAAAAATTTTTTAATTTTTCGAAATCTAAATATGCTGACGGAAGTTACTTTAACAATCGAGGTGAAAT TTTACCAAAAAATATTAAAGTAAAAAATATTTTCAAACATATTAAATTACCTAGTAATAAAGACTGGACAGAATTGAAAA CAAACGTTATTAAATATGGTCTTTATAATTCACATCGTTTAGCGGTTGCCCCGAATGGTTCAATTGGTTATATTATGAGC ACTACTCCTTCTTTAACCCCAATTAAACAATTAATTGAAGAAAGAACTTATGGTAATTCTAAAACATATTTTCCTACTCC TGGTTTAGAACAATTTTCTTTTATGTATGAAACTGCTTATAAAATTAATAAGTATCGTTTAATTGATGTTATAGCAACTG CACAAAAACACATTGATCAAGGAATTTCATTTGAATTAGGTATTACATCCGATATTACAACTAGAGAATTACAAAAATAT TATTTATATGCACATTATCAAGGTATTAAAACTTTATATTATACACGAACTCAAAAATTAAAAGTTAATGAATGTGAAGC TTGTGGAGTTTAA Protein sequence : MIKIVYDGLKHGQVYNMAKNLNYSFYHVKEYLSNLELKEHLISGLPIFLITKSVNFGEIPKETKIFLDKHSASTIGVAVS GNKNWGSNFGKAGDLIASNFSIPLVLKFEGSGFDEDVLYLKKWLSDYIYKNGQKNVIPKWIMLNNQVIDENGNIKDLTKD QEALEIYFKEEIKPKLKYFYSLKAKIDYLLENNYYEKDFFNHYTYEQIKTIYQIAYAEKFQFASFMGIFKFYNDYALKNR NKTKYLETYEDRLVVNALYHAHGNFILAKKLIKSLIQQNFTPATPTLLNSGKKYRGEFVSCFLIEGGDSLNDIARIFEFS MQLSKIGGGVSINLSNLRAKGETIKKNANVCKGVVGVCKLLDHGFRYADQMGQRNGAGAVYLNVFHADIKDFLNTKKLNA DEDVRVKTLSLGVVIPDKMLELAKNNEMMYIFYPHTVFLEYGQNFADISINMDYWYDILVKNSKIKKKIINPRNLLDLIA QLQGESGYPYIMYCDNVNKNNMLNLPIKFSNLCTEILQPTITSHYADYDKREEDRIGMDISCNLSSGHMGNMIKNNSIKE TVFMAMEVMNSVALNTDIAYVPGVAKANRLNRSVGFGIMGHHEFIAKNFIFFGSEEDLDLIDVFFNAVNYYSLLHSMQKA KTTGQKFFNFSKSKYADGSYFNNRGEILPKNIKVKNIFKHIKLPSNKDWTELKTNVIKYGLYNSHRLAVAPNGSIGYIMS TTPSLTPIKQLIEERTYGNSKTYFPTPGLEQFSFMYETAYKINKYRLIDVIATAQKHIDQGISFELGITSDITTRELQKY YLYAHYQGIKTLYYTRTQKLKVNECEACGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 2e-124 | 42 |
