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Name : serS (ATP_00132) Accession : YP_002004172.1 Strain : Candidatus Phytoplasma mali AT Genome accession: NC_011047 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0172 EC number : 6.1.1.11 Position : 170999 - 172270 bp Length : 1272 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAAATTTAAAATTTATTATTGAAAATATAGAAAAAGTAATAGAAAAACTTAATACTAGAACAGGTGATTTTTCATA TTTAAATAAATTACTTGTTTTAAATATTAAAAAAAAAAAATTAATATTTAATATTGAAACATTAAGATATCAACAAAATA AAATTTCTAAAGAAATATCTATTTTAAAACAAAATAAAACAAATACTGAAAATATTTTTGAAAGAAGTATATTTTTAAAA AATGAAATTCATGTTTTGGAAAATGATTTTAAAAAAACAGATTCTGAAATTTCAGAAATTTTAAATAACATTCCTAATTT ACCTCACGAATCAGTAATTTTACTTTCAAAAGATAATAATAAAATAAATTTTAAAAAATATTTATCTCCTAAAAAATTTA ATTTTAATATTAAAGATCATGTTACTTTAGGGAGAAATTTAAATATTTTAGATTTTGATAGAGCTTCTAAGATTACTGGA AGTCGCTTTATTGTATATAAAGGATTGGGTGCGCGTTTAGAACGTTCTTTAATACAGTTTATGATGGATTTACATAGTGA AAAAGGTTATATAGAAATAATTCCACCTTTTATTGTTAATGATATATCTATGTTTAGTACAGGACAATTACCAAAATTTA AGAATGATAGTTATCGATTAGAAAATAGTAATAATTGGTATTTGAATCCTACTGGTGAAGTTCCAGCTATTAATTTACAT CGTAATGAAGTTTTATCTCAAAAAAATTTACCATTAAATTACGTTGTTTTTACAACTTGTTTTAGACAAGAAGCAGGGAC TGCTGGAAAAGATACAAGAGGTATCTTAAGACAACATCAATTTAATAAAGTAGAATTAATTAAATTTACCGAACCTCAAG ATTCTTATTTAGAGTTAGAAAATATGTTACAAGATGCCGAATCAGTATTACAAAAATTAGAATTACCTTATCGGGTAATT ATGTTACCATCACATGAATTAGGTTTTAGTGCTTCTAAAACTTATGATATAGAAGTTTGGTTGCCTGGTAGCAATAATTA TCGTGAAATTTCTTCAATTAGCAATACAGAATCTTTTCAATCTTTAAGAGCTAATATTAAATTTTATTCTAAAAATAAAG GAAAAAATAAATATGTACATACTTTAAATGGTTCTGGTTTGGCTATAGGTAGGACATTAATTGCTATTTTAGAAAATTAT CAAAATAAAGACGGCACGATTACTGTGCCCAAGGTTTTGCGTTCTTATATGAGAACTGATATAATTAAATAA Protein sequence : MLNLKFIIENIEKVIEKLNTRTGDFSYLNKLLVLNIKKKKLIFNIETLRYQQNKISKEISILKQNKTNTENIFERSIFLK NEIHVLENDFKKTDSEISEILNNIPNLPHESVILLSKDNNKINFKKYLSPKKFNFNIKDHVTLGRNLNILDFDRASKITG SRFIVYKGLGARLERSLIQFMMDLHSEKGYIEIIPPFIVNDISMFSTGQLPKFKNDSYRLENSNNWYLNPTGEVPAINLH RNEVLSQKNLPLNYVVFTTCFRQEAGTAGKDTRGILRQHQFNKVELIKFTEPQDSYLELENMLQDAESVLQKLELPYRVI MLPSHELGFSASKTYDIEVWLPGSNNYREISSISNTESFQSLRANIKFYSKNKGKNKYVHTLNGSGLAIGRTLIAILENY QNKDGTITVPKVLRSYMRTDIIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 4e-99 | 48 |
