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Name : secA (ATP_00100) Accession : YP_002004140.1 Strain : Candidatus Phytoplasma mali AT Genome accession: NC_011047 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit SecA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 131731 - 134124 bp Length : 2394 bp Strand : - Note : functions in protein export; can interact with acidic membrane phospholipids and the SecYEG protein complex; binds to preproteins; binds to ATP and undergoes a conformational change to promote membrane insertion of SecA/bound preprotein; ATP hydrolysis ap DNA sequence : ATGTTTAATATTTTAAAAAAAATATTTAATTCTTCTAGAAAATATTTAAAAAAAGCTAAAATTTTAGCTGATCAAATTAA TAAATTAGATGAAAAAATGACAAAATTAAAAGATGAAGATTTCAAAAAAGAAACTCTAAGATTAAAAAATATTTTTTGTC AAAAAAAAAATTTAGATGAACTTTTAGTTGAGGCTTACGCTTTAGCTAGGGAAGCTAGTTATAGAATTACTGGAATGAAA CCTTATTATGTACAACTTTTGGGAGCTATTATATTGCATCAAGGTAATGTAGCAGAAATGAAAACTGGAGAAGGGAAAAC TTTAACTGCTATTATGCCATCTTATTTGAATTCTTTAAGTGGTCAAAGTGTACATATTGTTACTGTTAATGAGTATTTAG CTAGTCGTGAAGCTGAAGGCATTATAAGTAAAGTTTTTAATTTTTTAGGATTATCTGTTGGTTTAAATACTAAAAATAAA AATAATATAGAAAAAAAACAAGCTTATGATTGTGATATTCTTTATTCTACAAACAGTGAATTATCTTTTGATTATTTAAG AGATAATATGCAAATTGATTGTAAAAATTTAGTTATGCAAAGAGATTATGGTTATGCTATTGTTGATGAAGTTGATTCTA TTTTAATAGATGAAGCTAGAACTCCTTTAATAATTTCAAATCAAAATAGGCAAACTGAATTTATTTATCGTGAAGCCGAT CGTTTTGTAAGAACTTTAAAAAACAATCATTATATAATTGATTTAGAAACTAAAACTATTGAATTAACTGAAAAAGGTAT AAATAAAGCAGAAAATTTTTTTCAAATAAATAATTTATATAATGTTAATCATGCTCCTTTATTACATCGTATAAAAAATG CTTTAAAAGCTTTTTTTCTAATGCACAACAATAAAGATTATTTAGTTGTTAAAGATCAAATATTGATTATTGATGAATTT ACGGGTAGAATTTTAAAAGGTCGTCAATTTAGTAATGGTTTACATCAAGCTTTAGAGGCTAAAGAAAGAGTTACTATTAA ACCTGAGACTACTATTTCAGCCACTATTACTTATCAAAATTTTTTTCGTCTTTATAAAAAAATATCTGGAATGACAGGAA CAGCTAAAACCGAAGAAGATGAATTTCGTAATATTTATAATATGGAAGTAATAGAAATTCCAACTAATAAACCTATGATT AGAATAGATGATCCAGATTTTATTTTTACAAATTTAAATGAAAAATGGAAATATTTAATTGAAGATGTTAAAAATAGACA TAAAAAAGGACAACCTGTTTTAATAGGTACTATTACTGTTGAAATATCAGAACAAATTTCTAAAAAATTACATAAACACA ATATTACACATGAAGTTTTGAATGCTAAGAATCACATAAGAGAAGCAGAAATAATTTCTAAAGCCGGCATTAAAGGTTCT GTTACTATTGCTACTAATATGGCAGGTCGTGGAACTGATATTATTTTGGGTAAAGGTGTAATTGAATTAGGCGGTTTGGC TGTTATAGGTACTGAAAAACACGAATCAAGAAGGATTGATCATCAGTTAAGAGGTAGAGCAGGTCGTCAAGGTGATCCTG GTTATTCTCGTTTTTTTATTTCTGGCGAAGATGATTTATTACAACGTTTTGGTGGTTCTAAATTACAATATATTATAGAA TTGTTGAAAAAAATTAATATTTCAGAAAATAAAATGACTTCTTCTAAATTAATAACTAGATTTTTGATTAATATTCAAAA AAAGATTGAATCCAGTAATTTTGATTATCGTAAATATATTTTAAAATACGATGATATTTTAAGAATTCAAAGAGAAATTA TTTATAAACAAAGAAAAGAAGTTTTATTTTGTGATGAAATAAAAAAATTAGTTTTTAATTTAGTAGAAAAAACTTTAAAT TATCAAATTAGTTATTATTTTAAAAATTCTAATATAAATATTAAAAAACAAAATTATTTAGAAGATTTAATTCATTATTT AGAATTACATTTTTTTAATAGAAATGTTTTATATTTATCAGAAATCAAACATTTAATAGAAAATAATAAAAATGTTAATA TTGAAAAAATAATTATTGATTATGTTCAAAATAAAGCTAAAAATATTTTATTATTACCACCTAAAGAATTAATTTCTGAA CATCAACAAAATTTTATAGAAAGAACAAGATTAAAAATTTTAAAAATCATCGATTATCATTGGAGTTTACATATTAATAA TATGGAGTATTTACGAAAAGGGGCAAGTTTTTTGAATTATGGACAACAAAACTCTTTGATTTCTTATCAAAAAGAAGGTA GATTGTTATTTAATCAAATGATACAACAAATTTCTTTTGATATTACTAAAATATTATTAAAAATTCCTATTTAA Protein sequence : MFNILKKIFNSSRKYLKKAKILADQINKLDEKMTKLKDEDFKKETLRLKNIFCQKKNLDELLVEAYALAREASYRITGMK PYYVQLLGAIILHQGNVAEMKTGEGKTLTAIMPSYLNSLSGQSVHIVTVNEYLASREAEGIISKVFNFLGLSVGLNTKNK NNIEKKQAYDCDILYSTNSELSFDYLRDNMQIDCKNLVMQRDYGYAIVDEVDSILIDEARTPLIISNQNRQTEFIYREAD RFVRTLKNNHYIIDLETKTIELTEKGINKAENFFQINNLYNVNHAPLLHRIKNALKAFFLMHNNKDYLVVKDQILIIDEF TGRILKGRQFSNGLHQALEAKERVTIKPETTISATITYQNFFRLYKKISGMTGTAKTEEDEFRNIYNMEVIEIPTNKPMI RIDDPDFIFTNLNEKWKYLIEDVKNRHKKGQPVLIGTITVEISEQISKKLHKHNITHEVLNAKNHIREAEIISKAGIKGS VTIATNMAGRGTDIILGKGVIELGGLAVIGTEKHESRRIDHQLRGRAGRQGDPGYSRFFISGEDDLLQRFGGSKLQYIIE LLKKINISENKMTSSKLITRFLINIQKKIESSNFDYRKYILKYDDILRIQREIIYKQRKEVLFCDEIKKLVFNLVEKTLN YQISYYFKNSNINIKKQNYLEDLIHYLELHFFNRNVLYLSEIKHLIENNKNVNIEKIIIDYVQNKAKNILLLPPKELISE HQQNFIERTRLKILKIIDYHWSLHINNMEYLRKGASFLNYGQQNSLISYQKEGRLLFNQMIQQISFDITKILLKIPI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 2e-114 | 44 |
